細胞内にチューリングパターンは形成可能か?
細胞内にチューリングパターンは形成可能か?
批准号:
22K19299
负责人:
藤原 慶
金额:
$4.16万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2022-06-30 至 2024-03-31
中文摘要
化学反応と分子拡散の共役(反応拡散共役)によって出現するチューリングパターン(TPs)は、動物の縞模様のように細胞間相互作用で出現する現象を説明可能だが、最新研究において細胞内の分子配置にも重要である証拠が集まってきている。もし細胞の分子配置をTPsが決めていることが証明されれば、分子配置メカニズムにおける生命科学の視点は大きく転換する。そこで本研究では、人工細胞内再構成系と精製された要素を利用し、細胞サイズの空間でTPsが形成可能な条件を解明することを目的としている。本研究に関連するものとして、バクテリアの細胞分裂面を決定するタンパク質の極間振動波であるMin波が存在するが、Min波とTPsの違いは、動的な変化を示すか、静的な構造であるかの違いである。そこで、Min波の動的な振る舞いは阻害因子(MinE)が活性化因子(MinD)と局在を共にすることに由来することに着目し、この両者が共存できない条件を創ることでMin波を静的にすることを試みた。具体的には、細胞骨格タンパク質であるFtsZをMinEと結合させ、MinEとMinDの局在を別にする条件を探索した。結果、反応速度と分子拡散の速度を調節することで、MinEとMinDが分離し、MinDが周期的なスポットパターンとして出現する条件を発見した。静的な周期パターンであり、ATPを利用した非平衡性を持ち、FRAP法のような局所刺激による外乱に対する自己修復機能の持つこと、融合によりスポット形状の再編成が生じることからTPsであると結論づけた。現在は理論研究者との共同研究を開し、このパターンが発生するメカニズムの解明とTPsであることの正確な論証を行うことを検討している。また、細胞内でのチューリングパターン形成法として本成果をまとめた論文を執筆中である。
英文摘要
化学反応と分子拡散の共役(反応拡散共役)によって出現するチューリングパターン(TPs)は、動物の縞模様のように細胞間相互作用で出現する現象を説明可能だが、最新研究において細胞内の分子配置にも重要である証拠が集まってきている。もし細胞の分子配置をTPsが決めていることが証明されれば、分子配置メカニズムにおける生命科学の視点は大きく転換する。そこで本研究では、人工細胞内再構成系と精製された要素を利用し、細胞サイズの空間でTPsが形成可能な条件を解明することを目的としている。本研究に関連するものとして、バクテリアの細胞分裂面を決定するタンパク質の極間振動波であるMin波が存在するが、Min波とTPsの違いは、動的な変化を示すか、静的な構造であるかの違いである。そこで、Min波の動的な振る舞いは阻害因子(MinE)が活性化因子(MinD)と局在を共にすることに由来することに着目し、この両者が共存できない条件を創ることでMin波を静的にすることを試みた。具体的には、細胞骨格タンパク質であるFtsZをMinEと結合させ、MinEとMinDの局在を別にする条件を探索した。結果、反応速度と分子拡散の速度を調節することで、MinEとMinDが分離し、MinDが周期的なスポットパターンとして出現する条件を発見した。静的な周期パターンであり、ATPを利用した非平衡性を持ち、FRAP法のような局所刺激による外乱に対する自己修復機能の持つこと、融合によりスポット形状の再編成が生じることからTPsであると結論づけた。現在は理論研究者との共同研究を開し、このパターンが発生するメカニズムの解明とTPsであることの正確な論証を行うことを検討している。また、細胞内でのチューリングパターン形成法として本成果をまとめた論文を執筆中である。
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細胞サイズ空間に創られたチューリ ングパターン
在单元尺寸空间中创建图灵图案
DOI:
--
发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[髙田咲良, 義永那津人, 土居信英, 藤原慶]
通讯作者:
藤原慶
細胞サイズの空間でチューリングパターンを創る
在单元大小的空间中创建图灵图案
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[髙田咲良, 義永那津人, 土居信英, 藤原慶]
通讯作者:
藤原慶
人工細胞の中に静的なパターンを創る:Min 系と PAR 系
在人造细胞中创建静态模式:Min 系统和 PAR 系统
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[髙田咲良, 義永那津人, 土居信英, 茂木文夫, 藤原慶]
通讯作者:
藤原慶
人工細胞の中でチューリングパターンを創る
在人造细胞中创建图灵图案
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[髙田咲良, 義永那津人, 土居信英, 藤原慶]
通讯作者:
藤原慶
濃縮された遺伝子発現セットのリポソーム封入による生命システム再構成条件の探索
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批准号:11J03718
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2011
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负责人:藤原 慶
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依托单位:
GroE依存基質タンパク質を用いたフォールディングスイッチの作製
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批准号:22870016
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项目类别:Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
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资助金额:$1.84万
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财政年份:2010
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负责人:藤原 慶
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依托单位:
シャペロニン依存タンパク質の非依存体への変換によるシャペロニン依存性の解明
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批准号:08J08701
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.77万
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财政年份:2008
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负责人:藤原 慶
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依托单位:
海外基金