エピジェネティクス解析のための新規アプタマーの探索と応用
表观遗传学分析新型适体的寻找及应用
基本信息
- 批准号:08J11563
- 负责人:
- 金额:$ 1.54万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2008
- 资助国家:日本
- 起止时间:2008 至 2010
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
母性・父性アレル間でメチル化状態の異なる領域(differentially methylated regions, DMR)はインプリント遺伝子の発現制御において重要な役割を果たす。DNAメチル化酵素関連遺伝子Dnmt3Lを欠損した雌マウスの卵子ではmaternal DMR(母性アレルがメチル化されるDMR)のDNAメチル化が消失し、Dnmt3L^<-/->雌由来の胚(Dnmt3L^<mat-/->)においてもこのメチル化消失が確認できる。Dnmt3L^<mat-/->のDNAメチル化状態をゲノムワイドに決定することで、新規maternal DMRを同定することを試みた。Agilent CpG island (CGI) arrayを用いたMeDIP-chip解析により16,000個のCGIについてのメチル化プロファイルを取得し、次に野生型胚と比較してDnmt3L^<mat-/->で低メチル化傾向を示すCGIを37箇所同定した。新規maternal DMR候補の一部についてメチル化解析を行った結果、正常卵子ではメチル化が確立され、DNMT3L欠損卵子ではメチル化が消失するようなCGIを少なくとも9つ同定した。これらの新規germline maternal DMRのうちの一つは、Cdh15遺伝子内に位置していた。新規DMR近傍遺伝子についてアレル発現解析を行い、Cdh15は胎生期・新生期のマウス脳において父性アレルから優位に発現することを見出した。更に初代培養ニューロン・グリアを用いた解析から、Cdh15は未分化神経幹細胞とニューロンでは父性アレル発現を、グリア細胞では両アレル性発現を示すことを明らかにした。Cdh15-DMRの母性アレル特異的なDNAメチル化は受精前に既に確立されているが、その母性・父性アレル間で異なるメチル化状態が遺伝子発現様式に反映されるのは脳神経系細胞に限定されていると考えられる。
The development of maternal and paternal offspring is controlled by differentially methylated regions (DMR). Dnmt3L is deficient in DNA methylation enzyme related gene Dnmt3L is deficient in DNA methylation of female eggs and maternal DMR(maternal DMR), and Dnmt3L^<-/-> female-derived embryos (Dnmt3L^<mat-/->) is deficient in DNA methylation of female eggs and maternal DMR. Dnmt3L^<mat-/-> DNA transformation status must be determined, new material DMR must be determined Agilent CpG island (CGI) array uses MeDIP-chip analysis to obtain 16,000 CGI samples, followed by wild-type comparison, and 37 CGI samples with low CGI tendency. The results of the analysis of the new maternal DMR candidate are as follows: normal eggs are established, DNMT3L is damaged eggs are disappeared, CGI is reduced, and the results are as follows: The new germline material DMR is located in the inner part of Cdh15. The new DMR has been published in the analysis of the development of the child, Cdh15, and the development of the father's position in the prenatal and neonatal periods. In addition, Cdh15 showed that undifferentiated neural stem cells were able to develop paternal development and reproductive development in primary culture. Cdh15-DMR and maternal-specific DNA mutations are reflected in the pre-fertilization establishment, maternal and paternal differentiation, and in the development of offspring.
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Aptameric sensors based on structural change for diagnosis.
基于结构变化的适体传感器进行诊断。
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- 发表时间:2011
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- 影响因子:3.4
- 作者:K. Abe;Daisuke Ogasawara;W. Yoshida;K. Sode;K. Ikebukuro
- 通讯作者:K. Ikebukuro
An Aptamer-Based Bound/Free Separation System for Protein Detection
- DOI:10.1002/elan.200804555
- 发表时间:2009-06-01
- 期刊:
- 影响因子:3
- 作者:Fukasawa, Mieko;Yoshida, Wataru;Ikebukuro, Kazunori
- 通讯作者:Ikebukuro, Kazunori
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- 发表时间:2009-01-01
- 期刊:
- 影响因子:12.6
- 作者:Yoshida, Wataru;Mochizuki, Eriko;Ikebukuro, Kazunori
- 通讯作者:Ikebukuro, Kazunori
DNAメチル化プロファイリングによるゲノムインプリンティング領域の網羅的解析
通过 DNA 甲基化谱综合分析基因组印记区域
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:吉田亘;中林一彦;山澤一樹;永江玄太;油谷浩幸;緒方勤;秦健一郎
- 通讯作者:秦健一郎
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- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Fukasawa M;Yoshida W;Yamazaki H;Sode K;Ikebukuro K;田中佳佑;吉田亘・中林一彦・田山千春・久須美真紀・佐藤俊・秦健一郎
- 通讯作者:吉田亘・中林一彦・田山千春・久須美真紀・佐藤俊・秦健一郎
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