Development of stress diagnosis technology for photosynthesis based on genomic biology

基于基因组生物学的光合作用胁迫诊断技术发展

• 批准号: 20780108
• 负责人: SAITO Hideyuki
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20780108/
• 关键词: ストレス診断; ブナ; ゲノム生態学; 光合成; 遺伝子発現

We firstly generated a normalized and full-length enriched cDNA library of leaves of beech (Fagus crenata Blume). The 5'end one pass sequence for 5,376 clones was analyzed, and 3,629 non-redundant clones were annotated. Second, we evaluated the stability of candidate reference gene mRNA transcript level to seasonal change and various abiotic stresses ; remove of leaf, dry, heat, chilling, hydrogen peroxide, resulting that ef1α and EIF1A were relatively universally available reference gene of F. crenata leave from the different season and stresses. Third, we found abiotic stress-dependent expression of genes. Consequently, we suggested transcriptome analysis was a promising approach for stress diagnosis of beech tree in field.

本研究首先构建了一个标准化和全长富集的毛榉叶片cDNA文库。分析了5，376个克隆的5 '端一次通过序列，并注释了3，629个非冗余克隆。其次，通过对候选参考基因EIF1A和ef1 α mRNA转录水平对季节变化和各种非生物胁迫（去叶、干旱、高温、低温、过氧化氢）的稳定性分析，确定了ef1α和EIF1A是相对通用的参考基因。从不同的季节和压力锯齿离开。第三，我们发现了非生物胁迫依赖的基因表达。因此，我们认为转录组分析是一种很有前途的方法，用于山毛榉树的胁迫诊断领域。

项目成果

ポストゲノム時代における新たな森林研究の展開(テーマ別シンポジウム)

后基因组时代森林研究新进展（专题研讨会）

• 发表时间: 2010
• 作者: 斎藤秀之;伊森允一;青山千穂;渡辺誠;シンポジウム;Saito H;斎藤秀之;Naoi M;Saito H;Shamoto-Nagai M;永井 雅代;斎藤秀之;永井 雅代;斎藤秀之・大宮泰徳・高田直樹;高田克彦・斎藤秀之・渡辺敦史・高橋誠
• 通讯作者: 高田克彦・斎藤秀之・渡辺敦史・高橋誠

ブナ花成の光周性に関わる転写因子CONSTANS様遺伝子群の単離と発現特性～どうして毎年花を咲かさないか?

山毛榉开花光周期相关转录因子CONSTANS-like基因的分离和表达特征：为什么它不是每年都开花？

• 发表时间: 2010
• 作者: 斎藤秀之;伊森允一;青山千穂;渡辺誠;シンポジウム;Saito H;斎藤秀之;Naoi M;Saito H;Shamoto-Nagai M;永井 雅代;斎藤秀之;永井 雅代;斎藤秀之・大宮泰徳・高田直樹
• 通讯作者: 斎藤秀之・大宮泰徳・高田直樹

ブナの葉で発現する遺伝子の完全長cDNAクローンの網羅的収集

山毛榉叶中表达基因的全长 cDNA 克隆的全面收集

• 发表时间: 2009
• 期刊: 北海道の林木育種 51(2)
• 作者: 斎藤秀之;伊森允一;青山千穂;渡辺誠;シンポジウム;Saito H;斎藤秀之
• 通讯作者: 斎藤秀之

樹木の機能遺伝子研究の現状と今後の利用にむけて(テーマ別シンポジューム)

树木功能基因研究现状及未来应用（专题研讨会）

• 发表时间: 2009
• 作者: 斎藤秀之;伊森允一;青山千穂;渡辺誠;シンポジウム;Saito H;斎藤秀之;Naoi M;Saito H;Shamoto-Nagai M;永井 雅代;斎藤秀之;永井 雅代;斎藤秀之・大宮泰徳・高田直樹;高田克彦・斎藤秀之・渡辺敦史・高橋誠;大宮泰徳・松田修一・高田直樹・上村松生・斎藤秀之・赤田辰治;斎藤秀之・楠城時彦
• 通讯作者: 斎藤秀之・楠城時彦

Stress diagnosis of beech tree by genomic ecophysiology-A perspective

从基因组生态生理学角度诊断山毛榉树的逆境胁迫

• 发表时间: 2008
• 作者: Fumitoshi IMAIZUMI;Tsuyoshi HATTANJI;Yuichi S.HAYAKAWA;Saito H
• 通讯作者: Saito H