Comprehensive screening of gene expression pattern as indicator of stress diagnosis in leaf photosynthesis

综合筛选基因表达模式作为叶片光合作用胁迫诊断指标

• 批准号: 22780135
• 负责人: SAITO Hideyuki
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22780135/
• 关键词: 遺伝子発現; 機能ゲノム学; ゲノム生物学的情報; ストレス診断; DNAマイクロアレイ; ブナ; ゲノム生理生態学; 土壌乾燥ストレス; マクロアレイ

We generated 355, 845, 739 sequence from a full-length enriched cDNA library of beech(Fagus crenata) leaves by using 454 next generation sequencer. The DNA microarray for analysis of gene expression of beech leaves was developed, 12, 446 annotated genes and 31, 357 non-annotated genes. The high temperature-, drought-and acidification(H_2O_2)-specific gene expression patterns were found. The soil-drought intensity-and its history-dependent gene expression pattern related to photosynthetic reduction were found. These results suggested that transcriptome analysis will became promising method that provides useful indicators for diagnosis of health and stress of beech leaves.

利用454测序仪从山毛榉（Faguscrenata）叶片全长cDNA文库中扩增出355、845、739个序列。建立了用于山毛榉叶片基因表达分析的DNA微阵列，共获得12446个注释基因和31357个未注释基因。结果表明，转录组分析可为山毛榉叶片的健康和逆境诊断提供有用的指标。

项目成果

ブナにおける花芽形成の日長誘導経路に関わる遺伝子群の発現特性

山毛榉花芽形成光周期诱导途径相关基因的表达特征

• 发表时间: 2012
• 作者: 小倉俊治;斎藤秀之;門松昌彦;渋谷正人;小池孝良
• 通讯作者: 小池孝良

摩周湖における対流圏オゾン濃度とその植物影響について

摩周湖对流层臭氧浓度及其对植物的影响

• 发表时间: 2010
• 作者: 山口高志;龍田慎平;渡辺誠;渡邊忠;久保島康行;斎藤秀之;野口泉;小池孝良
• 通讯作者: 小池孝良

土壌水分変動がブナ苗木の葉の遺伝子発現に与える影響のゲノム網羅的解析

土壤湿度波动对山毛榉幼苗叶片基因表达影响的全基因组分析

• 发表时间: 2012
• 作者: 斎藤秀之;石堂 光;神村章子;瀬々潤;清水(稲継)理恵;清水健太郎
• 通讯作者: 清水健太郎

ブナ葉の高温・乾燥・酸化ストレスに応答する発現遺伝子の網羅的探索

全面寻找山毛榉叶片响应高温、干燥和氧化应激的表达基因

• 发表时间: 2011
• 作者: 斎藤秀之;山田宰靖;瀬々潤;福崎睦美;清水(稲継)理恵;清水健太郎
• 通讯作者: 清水健太郎

ブナ林の遺伝子診断による環境ストレス評価

利用山毛榉林基因诊断进行环境压力评估

• 发表时间: 2012
• 作者: 松本健司;横山慎一郎;斎藤秀之
• 通讯作者: 斎藤秀之