機能不全リボソームを選択的に分解する新たな品質管理機〓
機能不全リボソームを選択的に分解する新たな品質管理機〓
批准号:
09J04272
负责人:
坂田 知子
金额:
$1.34万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2009
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2009 至 2011
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昨年報告したように、出芽酵母において活性の弱い変異型リボソームタンパク質Rp128(K110A)が分解される際、K110A変異体自身がユビキチン化を受けて単体として分解される可能性が高くなった。リボソーム全体が品質管理を受けていることを示すことが難しいため、このRp128変異体の研究は中断することとした。昨年度の研究において、機能不全リボソームを分解(nonfunctional rRNA decay: NRD)に必要なE3ユビキチンライゲース、RTT101-MMS1複合体の構成因子としてCRTIOというタンパク質が必要なことを発見した。研究目標である機能不全リボソーム分解機構の解明のため、CRT10pと結合するたんぱく質を探索した。MMS1-Flag,CRT10-HAの二段階で免疫沈降し、質量分析を行った結果、Paf1複合体が検出された。Paf1複合体はRNA polymerase IIに結合し、転写伸長因子などのプラットホームとなる。Western BlotによりPaf1複合体とCRT10との結合が確認できたが、Paf1欠損株株においても機能不全リボソームRNAの分解が抑制されなかったことから、Paf1はNRDに関与しないと考えられる。リボソームの分解に関わる結合パートナーはPaf1複合体の影に隠れている可能性があるため、Paf1欠損株において、MMS1-Flag,CRT10-HAの二段階で免疫沈降し、質量分析を行った。その結果、rvb1,rvb2(chromatin remodeling complex)などのタンパク質が同定された。CRT10はDNA損傷時にリボヌクレオチド還元酵素の発現を制御している。CRT10pはストレス時の損傷リボソームの分解とdNTP量の調節という2つの役割を使い分けており、それぞれ異なる基質を認識していると考えられる。本研究においてCRT10との結合が明らかになったPaf1複合体やRvb1-Rvb2複合体もDNA修復に関与することが知られている。放射線や活性酸素など、リボソームを破壊するストレスはDNAも傷つける可能性が高く、このMMS1-CRT10複合体は、ストレス時に複数の品質管理経路を司っていると考えられる。
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DOI:
10.1101/gad.1775609
发表时间:
2009-04-15
期刊:
GENES & DEVELOPMENT
影响因子:
10.5
作者:
[Fujii, Kotaro, Kitabatake, Makoto, Ohno, Mutsuhito]
通讯作者:
Ohno, Mutsuhito
翻訳阻害剤等によるリボソーム複合体のユビキチン化の解析
翻译抑制剂等对核糖体复合物的泛素化分析
DOI:
--
发表时间:
2010
期刊:
影响因子:
--
作者:
[藤井耕太郎, 北畠真, 坂田知子, 坂田知子]
通讯作者:
坂田知子
機能不全リボソームの分解に関わるE3ユビキチンリガーゼ複合体の解析
参与功能失调核糖体降解的 E3 泛素连接酶复合物分析
DOI:
--
发表时间:
2011
期刊:
影响因子:
--
作者:
[藤井耕太郎, 北畠真, 坂田知子]
通讯作者:
坂田知子
Translation inhibitors induce ubiquitination of ribosomal particles.
翻译抑制剂诱导核糖体颗粒泛素化。
DOI:
--
发表时间:
2010
期刊:
影响因子:
--
作者:
[藤井耕太郎, 北畠真, 坂田知子, 坂田知子, 坂田知子]
通讯作者:
坂田知子
Selective degradation of nonfunctional ribosomal protein in S.cerevisiae
酿酒酵母中非功能核糖体蛋白的选择性降解
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
影响因子:
--
作者:
[藤井耕太郎, 北畠真, 坂田知子, 坂田知子, 坂田知子, 坂田知子]
通讯作者:
坂田知子
乳幼児の脂肪量・除脂肪量の発育〜匍匐運動と直立二足歩行開始時に着目して〜
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批准号:11780052
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1999
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负责人:坂田 知子
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依托单位:
乳児の発育曲線にみられる時相差〜運動発達にともなう筋量・脂肪量の時系列的変化を中心に〜
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批准号:07780106
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1995
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负责人:坂田 知子
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依托单位:
乳幼児の運動発達にともなう身体組成の変化
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批准号:06780110
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1994
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负责人:坂田 知子
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依托单位:
海外基金