Untersuchungen zu molekularen Mechanismen der Transfer RNA-Gen-gerichteten Integration des Retrotransposons TRE5-A im Genom von Dictyostelium discoideum

盘基网柄菌基因组中转移RNA基因定向整合反转录转座子TRE5-A的分子机制研究

• 批准号: 5386061
• 负责人: Professor Dr. Thomas Winckler
• 金额: --
• 依托单位: Lehrstuhl für Pharmazeutische Biologie
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2002
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2001-12-31 至 2010-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5386061?language=en
• 关键词: Untersuchungen; zu; molekularen; Mechanismen; der

In dem hier beschriebenen wissenschaftlichen Vorhaben sollen verschiedene Aspekte der positionsspezifischen Integration bestimmter Retrotransposons vor tRNA-Genen im Genom von Dictyostelium discoideum untersucht werden. Grundlage der geplanten Arbeiten ist ein kürzlich etablierter in vivo-Test, der die gerichtete Integration in D. discoideum-Zellen aktiver Retrotransposons vor ein definiertes Ziel-tRNA-Gen darzustellen vermag. De novo-Integrationsereignisse können auf die Identität und Struktur der inserierten Elemente sowie auf kritische Insertionsparameter wie die Orientierung und den Abstand zum Ziel-tRNA-Gen hin untersucht werden. In weiterführenden Arbeiten soll definiert werden, welche DNA-Sequenzen des untersuchten Retrotransposons TRE5-A für die gerichtete Integration minimal benötigt werden. Hierzu werden Mini-TRE5-A-Elemente konstruiert und auf ihre Mobilität getestet. Außerdem soll versucht werden, durch Zufallsmutagenese des D. discoideum-Genoms Wirtsfaktoren zu identifizieren, die für die Retrotransposition des mobilen Elementes gebraucht werden.

在本研究中，我们发现了逆转录转座子在盘状网柄藻韦尔登基因组中的特异性整合位点。植物劳动力的基础是一种生物体内试验，是D. discoideum-Zellen激活逆转录转座子vor ein definiertes Ziel-tRNA-Gen darzustellen vermag.新的整合方法是通过对关键插入参数的定位和对Ziel-tRNA-Gen的Abstand的识别和结构的研究来实现的，其中Ziel-tRNA-Gen的定位和Abstand是韦尔登-Gen的Abstand。在以后的研究中，我们将明确韦尔登转座子TRE 5-A的DNA测序结果，以确保最小整合韦尔登。Hierzu韦尔登Mini-TRE 5-A-Elemente结构和auf ihre Mobilität得到测试。通过D. discoideum-Genoms Wirtsfaktoren zu identifizieren，die für die Retrotranslocation des mobilen Elementes gebraucht韦尔登.