転写後レベルでのエピジェネティックな遺伝子調節機構と発癌における役割

转录后水平的表观遗传基因调控机制及其在致癌作用中的作用

• 批准号: 22300320
• 负责人: 豊田 実
• 金额: $ 8.49万
• 依托单位: Sapporo Medical University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22300320/
• 关键词: エピゲノム; 転写; ヒストン; 発癌; 機能性RNA

DNAメチル化やヒストン修飾異常は癌関連遺伝子の不活化に重要な役割を果たし、転写の開始反応を抑制するとされているが、遺伝子プロモーター以外の遺伝子発現制御機構に関しては未知の点が多い。本研究では、転写伸長反応など転写後レベルの遺伝子発現制御におけるDNAメチル化およびヒストン修飾の役割について明らかにすることを目的とする。本年度は、メチル化シトシン結合タンパク、及びヒストンH3K4、K9、K27、K36のメチル化を特異的に認識する抗体を用いて免疫沈降したクロマチンからDNAを抽出し、次世代シークエンサーにより、癌細胞におけるDNAメチル化、ヒストン修飾の状態についてゲノム網羅的に解析し、癌における遺伝子発現の異常に関連するエピゲノム変化について解析した。癌細胞株を用いた解析では、いずれも安定して5,000万タグ程度の情報を得ることが可能であった。白血病細胞株においてMethylminer法によるDNAメチル化の網羅的解析とメチル化阻害剤で遺伝子発現が誘導される遺伝子について比較したところ、メチル化阻害剤で誘導される遺伝子の中には、プロモーター部位のメチル化だけでなく、H3K27me3により発現抑制されている遺伝子群が同定された。メチル阻害剤によるメチル化解除と遺伝子発現は、必ずしも転写開始点のメチル化の程度と一致しないが、転写開始点がメチル化されていて、メチル化阻害剤で発現上昇する遺伝子は既知の疾患関連遺伝子が多く含まれていた。また、多発性骨髄腫細胞株を用いた検討においては、DNAメチル化はプロモーター部位にCpGアイランドを持つ遺伝子において顕著に遺伝子発現制御と逆相関の関係を示したが、そうでない遺伝子については関連が見られなかった。さらに、Genebody領域のメチル化領域は遺伝子発現と正の相関を持ち、プロモーター領域のメチル化とは違いが見られた。

DNA modification abnormalities play an important role in the inactivation of cancer-associated genes, and there are many unknown factors in the inhibition of gene expression mechanisms other than gene activation. The purpose of this study is to control the development of DNA and DNA modification in the process of gene expression. This year, we will analyze the specific characteristics of H3, K4, K9, K27 and K36 in combination with DNA extraction, next generation DNA extraction, and modification of cancer cells. The abnormal relationship between cancer detection and gene detection should be resolved by the method of analysis. Cancer cell lines are analyzed in the middle of the analysis, and information on the degree of stability is obtained. Analysis of DNA fragmentation by Methylminer method in leukemia cell lines and detection of DNA fragmentation by H3K27me3. Comparison of DNA fragmentation and detection of DNA fragmentation by H3K27me3. The occurrence of the disease resistance agent is different from that of the known disease-related agent. The occurrence of the disease resistance agent is different from that of the known disease-related agent. The relationship between CpG gene expression and gene expression in multiple osteoma cell lines was studied. The relationship between CpG gene expression and gene expression in multiple osteoma cell lines was analyzed. In addition, the Genebody domain's transformation domain's reverse gene discovery and positive correlation domain's reverse gene discovery and negative correlation domain's reverse gene discovery.

项目成果

Analysis of cell cycle-related proteins in gastric intramucosal differentiated-type cancers based on mucin phenotypes: a novel hypothesis of early gastric carcinogenesis based on mucin phenotype.

• DOI: 10.1186/1471-230x-10-55
• 发表时间: 2010-06-07
• 期刊: BMC gastroenterology
• 影响因子: 2.4
• 作者: Sugai T;Tsukahara M;Endoh M;Shioi Y;Takebe N;Mue Y;Matsushita H;Toyota M;Suzuki K
• 通讯作者: Suzuki K

Molecular analysis of gastric differentiated-type intramucosal and submucosal cancers

• DOI: 10.1002/ijc.25271
• 发表时间: 2010-12-01
• 期刊: INTERNATIONAL JOURNAL OF CANCER
• 影响因子: 6.4
• 作者: Sugai, Tamotsu;Habano, Wataru;Suzuki, Kazuyuki
• 通讯作者: Suzuki, Kazuyuki

Interferon-alpha/beta and anti-fibroblast growth factor receptor 1 monoclonal antibody synergistically suppress hepatic cancer cells in vitro and in vivo FGFR 1.

干扰素-α/β 和抗成纤维细胞生长因子受体 1 单克隆抗体在体外和体内协同抑制肝癌细胞 FGFR 1。

• 发表时间: 2011
• 期刊: PLoS One
• 影响因子: 3.7
• 作者: Kei Sakamoto;et al.;Kamimae S;大和広明・ 三上岳彦 ・ 高橋日出男;Ryoji Yao and Tetsuo Noda;原口 健;Sasaki S
• 通讯作者: Sasaki S

Genomic Screening for genes upregulated by demethylation identified novel targets of epigenetic silencing in breast cancer.

对去甲基化上调基因的基因组筛选确定了乳腺癌表观遗传沉默的新靶点。

• 发表时间: 2010
• 期刊: Breast Cancer Res Treat
• 作者: Fujimori KE;Hazama K;Kawasaki T;Deguchi T;Yuba S;Fujikane T
• 通讯作者: Fujikane T

Epigenetics as Cancer Biomarkers.

表观遗传学作为癌症生物标志物。

• 发表时间: 2010
• 作者: Takahashi;K.;Takahashi;H.;Mikami;T.;Toyota M
• 通讯作者: Toyota M