Genome engineering and gene expression analysis in a model plant Arabidopsis thaliana

模式植物拟南芥的基因组工程和基因表达分析

• 批准号: 22310129
• 负责人: MURATA Minoru
• 金额: $ 11.48万
• 依托单位: Okayama University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22310129/
• 关键词: ゲノム再編成; シロイヌナズナ; 染色体; Cre/LoxP; 相互転座; 遺伝子発現; ゲノム再構成; Cre-LoxP; Ac-Ds; 組換え; ゲノム; 再構成; Ac; Ds; 転座

In order to reconstruct the nuclear genome of Arabidopsis thaliana, we introduced the LoxP sequence, which originated from bacteriophase P1, into the chromosomes, and have created 30 lines carrying one or two copies of LoxP per chromosome. These LoxP sites were combined in the genome by crossing, and the sequence-specific recombination was induced with the Cre-recombinase. PCR and FISH analyses revealed that reciprocal translocations are possibly induced by recombination between two LoxP sites located on different chromosomes. It was also suggested that alteration of chromatin structure associated with the reciprocal translocation, induces phenotypic changes.

为了重建拟南芥的核基因组，我们将来自细菌期P1的LoxP序列引入染色体，并创建了30个每个染色体携带一个或两个LoxP拷贝的株系。这些LoxP位点通过杂交在基因组中组合，并且用Cre重组酶诱导序列特异性重组。PCR和FISH分析表明，相互易位可能是由位于不同染色体上的两个LoxP位点之间的重组诱导的。也有人认为，与相互易位相关的染色质结构的改变诱导表型变化。

项目成果

Plant Centromere Biology(J.Jiang and J.Birchler, eds.)

植物着丝粒生物学（J.Jiang 和 J.Birchler，编辑）

• 发表时间: 2012
• 作者: Murata;M.
• 通讯作者: M.

Arabidopsisring mini- chromosomes: A candidate for artificial chromosome vector. Japan-Germany Joint Seminar

拟南芥迷你染色体：人工染色体载体的候选者。

• 发表时间: 2011
• 作者: Murata;M
• 通讯作者: M

Cre/LoxP組換えによるシロイヌナズナ染色体の大規模再編成

通过 Cre/LoxP 重组对拟南芥染色体进行大规模重排

• 发表时间: 2011
• 作者: Ichinose,N.;Yada,T.,Gotoh,O.;北原武嗣;村田稔・柴田洋・弘中明子・柏原壱成・長岐清孝
• 通讯作者: 村田稔・柴田洋・弘中明子・柏原壱成・長岐清孝

シロイヌナズナにおいて新規に見出された染色体構造変異とその伝達

新发现的拟南芥染色体结构突变及其传播

• 发表时间: 2010
• 作者: Nakato;R. and Gotoh;O;横田悦子・長岐清孝・村田稔
• 通讯作者: 横田悦子・長岐清孝・村田稔

Stability of monocentric and dicentric ring minichromosomes in Arabidopsis

拟南芥单着丝粒和双着丝粒环微染色体的稳定性

• DOI: 10.1007/s10577-011-9250-3
• 发表时间: 2011
• 期刊: Chromosome Research
• 影响因子: 2.6
• 作者: Etsuko Yokota;F. Shibata;K. Nagaki;M. Murata
• 通讯作者: M. Murata