Assssing evolutionary episodes of genetic hybridization in small mammals using the population haplotype structure analysis

使用群体单倍型结构分析评估小型哺乳动物遗传杂交的进化事件

• 批准号: 23570101
• 负责人: SUZUKI Hitoshi
• 金额: $ 3.33万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23570101/
• 关键词: 二次的接触; ハプロタイプ構造解析; 毛色関連遺伝子; 系統地理; 浸透交雑; 小型哺乳類; クマネズミ; クロテン; 組換え; Asip; ミトコンドリアDNA; 連鎖不平衡; コウベモグラ; 野生ハツカネズミ; 遺伝子汚染; 自然選択; 塩基多様度

In this study, we aimed to develop a new method to better understand spacial and temporal aspects for the secondary contact in which two distinct lineages of different geographic groups are mingled, focusing on recombination signals along a certain chromosome portion, such as 10 kb, 200 kb, 1 Mb, and 5 Mb. In a case of 200 kb segment, for example, we determined nucleotide sequences in eight gene region (~500 bp) being separated at 20-30 kb interval and assessed its haplotype structures. These methods allowed us to detect the secondary contact events of different time scales, such as several hundred years before present and several hundred thousand years ago. Further efforts would be needed to improve the method, aiming at establishment of ways to fully utilize the genetic information related to recombination events in molecular phylogeographic study.

在这项研究中，我们旨在开发一种新的方法来更好地了解不同地理群体的两个不同谱系混合的二次接触的空间和时间方面，重点关注特定染色体部分的重组信号，如10kb、200kb、1Mb和5Mb。以200kb片段为例，我们测定了在20-30kb区间分离的8个基因区(~500bp)的核苷酸序列，并对其单倍型结构进行了评估。这些方法使我们能够探测到不同时间尺度的二次接触事件，例如距今几百年和几十万年前。还需要进一步努力改进这一方法，旨在建立在分子系统地理研究中充分利用与重组事件有关的遗传信息的方法。

项目成果

ミャンマー産ネズミ亜科4種の分子系統学的把握

缅甸四种鼠科动物的分子系统发育了解

• 发表时间: 2013
• 作者: 鈴木仁;Saw Bown;片倉賢
• 通讯作者: 片倉賢

Phylogenetic history of mustelid fauna in Taiwan inferred from mitochondrial genetic loci

• DOI: 10.1139/z11-029
• 发表时间: 2011-06-01
• 期刊: CANADIAN JOURNAL OF ZOOLOGY
• 影响因子: 1.4
• 作者: Hosoda, T.;Sato, J. J.;Suzuki, H.
• 通讯作者: Suzuki, H.

クマネズミ類における環境適応に関連する遺伝子の進化的動態

黑鼠环境适应相关基因的进化动态

• 发表时间: 2013
• 作者: 高梨脩;土屋公幸;Ken Aplin;鈴木仁
• 通讯作者: 鈴木仁

ニホンテン紀伊集団における毛色関連遺伝子ASIPの遺伝的分化

日本貂Kii群体毛色相关基因ASIP的遗传分化

• 发表时间: 2011
• 作者: 安生浩太;佐藤淳;細田徹治;木下豪太;鈴木仁
• 通讯作者: 鈴木仁

北海道における野生ハツカネズミのハプロタイプ構造解析に基づく浸透性交雑の検出

基于北海道野生小鼠单倍型结构分析的渐渗杂交检测

• 发表时间: 2011
• 作者: 鈴木仁;乃美大祐;神戸嘉一;安田俊平;中田勝士;鈴木仁;鈴木仁・乃美大祐・神戸嘉一・安田俊平・中田勝士;鈴木仁;児玉紗也香・布目三夫・森脇和郎・鈴木仁;桑山崇・布目三夫・森脇和郎・鈴木仁
• 通讯作者: 桑山崇・布目三夫・森脇和郎・鈴木仁