合成プロモーターを用いた土壌ストレス応答を担うシス配列の総合的解析

使用合成启动子对负责土壤胁迫响应的顺式序列进行综合分析

• 批准号: 11F01078
• 负责人: 山本 義治
• 金额: $ 1.02万
• 依托单位: Gifu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-11F01078/
• 关键词: 土壌ストレス応答; 植物ゲノム; 合成プロモーター; 土壌ストレス; 転写制御; シス配列

【目的】植物は、日々変化している様々な種類の環境変化を感知し、遺伝子発現を調節することで新たな環境に適応して行く。遺伝子の発現調節はプロモーター上にある転写制御配列(シス配列)により実現されている。同じ発現様式を示す遺伝子のプロモーターは共通するシス配列を持つ、という仮説に従えば、大規榎遺伝子発現データをもとに転写制御配列を予測することが可能である、発表者らはこれまでの研究によりAl,Cd,CuイオンとNaClストレスで誘導される遺伝子群をシロイヌナズナマイクロアレイ解析により同定してきた。本研究では、これまで一般的に行われてきたコンセンサス配列の抽出を行うのではなく、頻度比較を第一のストラテジーとして転写制御配列の予測を行い、冷属イオン応答を担う機能シス配列の推定、さらに実験的手法による機能配列の同定までを目指す。昨年度は予測に基づ89個の合成プロモーターを作成した。【研究の成果】(1)作成した含成プロモーターをアグロバクテリウムを用いてシロイヌナズナに導入し、T1種子を収穫した。(2)発光系レポーター遺伝子として現在利用しているホタルルシフュラーゼ以外にいくつか新規のものが開発・販売されている。それらについて植物でのill vivoでの特性(S/N比、反応応答性等)について評価するために、同一の誘導性プロモーターの支配下に各種発光レポーター遺伝子を組み込み、植物へ導入した。

[Objective] Plant species and environmental changes are perceived and regulated by plant growth and development. The regulation of the development of the gene is carried out in the middle of the system. The same expression shows that the common configuration of the gene is maintained, and the common configuration of the gene is maintained, and the large-scale gene is generated. The prediction of the common configuration of the gene is possible. The gene is generated by the research of Al,Cd,Cu and NaCl. This study is aimed at the estimation of functional allocation and the identification of functional allocation in general, frequency comparison, prediction of functional allocation, cold response, estimation of functional allocation and method of functional allocation. Last year, 89 of the estimated bases were created. [Results of the study](1) Creation of the first batch of seeds including the introduction of the first batch of seeds and the harvesting of the first batch of seeds (2)In addition to the new regulations, the development and marketing of light systems are now being used. The characteristics of plants in vivo (S/N ratio, reactivity, etc.), evaluation, and induction under the control of the same inducer, various light-emitting molecules are grouped and introduced into plants.

项目成果

マイクロアレイデータをもとにした金属イオンストレス応答を担う転写制御配列の予測

基于微阵列数据预测负责金属离子应激反应的转录控制序列

• 发表时间: 2012
• 作者: 趙成日;時澤睦朋;澤木宣忠;小林安文;小林佑理子;小山博之;吉岡洋平;百町満朗;山本義治
• 通讯作者: 山本義治

マイクロアレイデータに基づいた有用微生物によって誘導される植物の全身的抵抗性に関する転写制御配列の予測

基于微阵列数据预测有益微生物诱导植物系统抗性的转录调控序列

• 发表时间: 2012
• 作者: 吉岡洋平;日恵野綾香;Most.Hushna Ara Naznin;百町満朗;時澤睦朋;小林佑理子;小山博之;井内聖;小林正智;圓山恭之進;篠崎和子;坂井優作;趙成日;山本義治
• 通讯作者: 山本義治

有用微生物による病害抵抗性誘導時の気孔開度を制御する転写制御配列のin silico予測

在有用微生物诱导抗病期间控制气孔打开的转录调控序列的计算机预测

• 发表时间: 2012
• 作者: 日恵野綾香;Most.Hushna Ara Naznin;吉岡洋平;百町満朗;時澤睦朋;小林佑理子;小山博之;井内聖;小林正智;光田展隆;高木優;坂井優作;趙成日;山本義治
• 通讯作者: 山本義治

Plant promoter analysis in the genomic age

基因组时代的植物启动子分析

• 发表时间: 2012
• 作者: Yohei Yoshioka;Mitsuro Hyakucachi;Yuriko Kobayashi;Hiroyuki Koyama;Satoshi Iuchi;Masatomo Kobayashi;Yutaka Suzuki;Sumio Sugano;Tetsuya Sakurai;Kazuo Shinozaki;Nobutaka Mitsuda;Masaru Ohme-Takagi;Yasuomi Tada;Yoshiharu Y. Yamamoto
• 通讯作者: Yoshiharu Y. Yamamoto

マイクロアレイデータに基づいた植物生育促進菌類Penicillium simplicissimum GP17-2株によって誘導される植物の全身的抵抗性に関する転写制御配列の予測

基于微阵列数据预测植物促生真菌简单青霉GP17-2诱导的植物系统抗性相关转录调控序列

• 发表时间: 2012
• 作者: 吉岡洋平;日恵野綾香;Most.Hushna Ara Naznin;百町満朗;時澤睦朋;小林佑理子;小山博之;井内聖;小林正智;圓山恭之進;篠崎和子;坂井優作;趙成日;山本義治
• 通讯作者: 山本義治