未スプライシングRNAを排除する新規mRNA品質管理機構の解明
未スプライシングRNAを排除する新規mRNA品質管理機構の解明
批准号:
11J02501
负责人:
椎森 仁美
金额:
$0.83万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2011
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2011 至 2012
中文摘要
形質発現の基本となる遺伝子発現の正確性を保証するために、異常なmRNAの発現を防ぐゲートキーパーとなる機構は不可欠である。本研究では、Y14がイントロンを含む未スプライシングRNAの核外輸送を抑制する分子機構を解明することを目指し、解析を進めてきた。これまでに、Y14を含むExon Junction Complex (EJC)の中核因子が、pre-mRNAにリクルートされ、いくつかのスプライシング因子と相互作用することにより未スプライシングRNAの核外漏出を防ぐ可能性を見出した。そこで、本年度は、Y14による未スプライシングRNA核外漏出阻止機構のさらに詳細な分子メカニズムを明らかにするため解析を進めた。本年度の解析から、(1)スプライシング関連因子であるCWC22や、U6snRNP構成因子であるLsm2が未スプライシングRNA核外漏出阻止に機能すること、(2)Y14発現阻害においては、ほとんどの遺伝子で未スプライシングRNAが蓄積し、1つしかイントロンを持たない遺伝子や、非コードRNAの未スプライシングRNA、また、トランススプライシングにより取り除かれるアウトロンも蓄積すること、(3)Y14とIBP160がRNA非依存的に相互作用することを明らかにした。本研究の結果は、Y14を含むEJCの中核因子が、IBP160,CWC22によってpre-mRNAにリクルートされ、U2 snRNPやU6 snRNPを含む特定のスプライシング因子と協調して働くことで、未スプライシングRNAの核外漏出を防ぐことを示唆する。このことから、線虫において、Y14が未スプライシングRNAの核外漏出を防ぎ、遺伝子発現の正確性を保証するというゲートキーパーとしての新規機能を持つことが示された。以上の研究成果をまとめて、Molecular and Cellular Biology誌に発表した。
英文摘要
形質発現の基本となる遺伝子発現の正確性を保証するために、異常なmRNAの発現を防ぐゲートキーパーとなる機構は不可欠である。本研究では、Y14がイントロンを含む未スプライシングRNAの核外輸送を抑制する分子機構を解明することを目指し、解析を進めてきた。これまでに、Y14を含むExon Junction Complex (EJC)の中核因子が、pre-mRNAにリクルートされ、いくつかのスプライシング因子と相互作用することにより未スプライシングRNAの核外漏出を防ぐ可能性を見出した。そこで、本年度は、Y14による未スプライシングRNA核外漏出阻止機構のさらに詳細な分子メカニズムを明らかにするため解析を進めた。本年度の解析から、(1)スプライシング関連因子であるCWC22や、U6snRNP構成因子であるLsm2が未スプライシングRNA核外漏出阻止に機能すること、(2)Y14発現阻害においては、ほとんどの遺伝子で未スプライシングRNAが蓄積し、1つしかイントロンを持たない遺伝子や、非コードRNAの未スプライシングRNA、また、トランススプライシングにより取り除かれるアウトロンも蓄積すること、(3)Y14とIBP160がRNA非依存的に相互作用することを明らかにした。本研究の結果は、Y14を含むEJCの中核因子が、IBP160,CWC22によってpre-mRNAにリクルートされ、U2 snRNPやU6 snRNPを含む特定のスプライシング因子と協調して働くことで、未スプライシングRNAの核外漏出を防ぐことを示唆する。このことから、線虫において、Y14が未スプライシングRNAの核外漏出を防ぎ、遺伝子発現の正確性を保証するというゲートキーパーとしての新規機能を持つことが示された。以上の研究成果をまとめて、Molecular and Cellular Biology誌に発表した。
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線虫 EJC 中核因子 Y14はスプライシング未完了 RNA の核外輸送を防ぐ
秀丽隐杆线虫EJC核心因子Y14阻止未剪接RNA的核输出
DOI:
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发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[椎森仁美, 井上邦夫, 坂本博]
通讯作者:
坂本博
EJC core subunits have a novel gatekeeper function in mRNA quality control in the nematode C elesans
EJC核心亚基在线虫C elesans的mRNA质量控制中具有新颖的看门功能
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Masami Shiimori, KunioInoue, Hiroshi Sakamoto, 椎森 仁美]
通讯作者:
椎森 仁美
A specific set of EJC subunits is required for the nuclear retention of unspliced RNAs in C. elegans
秀丽隐杆线虫中未剪接 RNA 的核保留需要一组特定的 EJC 亚基
DOI:
10.1128/mcb.01298-12
发表时间:
2013
期刊:
Molecular and Cellular Biology
影响因子:
5.3
作者:
[Masami Shiimori, KunioInoue, Hiroshi Sakamoto]
通讯作者:
Hiroshi Sakamoto
線虫Y14はイントロンを含む未スプライシングRNAの核外漏出を防ぐ
线虫 Y14 防止含有内含子的未剪接 RNA 的核外渗
DOI:
--
发表时间:
2011
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Taichi Maki, Osamu Morita, Yoshinori Suzuki and Kenji Wakimizu, 椎森仁美]
通讯作者:
椎森仁美
Two EJC core subunits, Y14 and MAG-1, have a novel gatekeeper function in mRNA quality control in the nematode C. elegans
两个 EJC 核心亚基 Y14 和 MAG-1 在内线虫的 mRNA 质量控制中具有新颖的看门人功能。
DOI:
--
发表时间:
2011
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Masami Shiimori, Shunichi Wakabayashi, Yutaka Suzuki, Kenta Nakai, Kunio Inoue & Hiroshi Sakamoto]
通讯作者:
Kunio Inoue & Hiroshi Sakamoto
マダニのRdRP依存性新規小分子RNA経路の分子機構とウイルス相互作用の解明
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批准号:24K09327
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.91万
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财政年份:2024
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负责人:椎森 仁美
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依托单位:
Translational control in skeletal muscle regeneration
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批准号:21K09218
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.66万
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财政年份:2021
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负责人:椎森 仁美
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依托单位:
海外基金