Epigenome information profiling for molecular basis on seed epigetics

种子表观遗传学分子基础的表观基因组信息分析

• 批准号: 24790137
• 负责人: NAKAMURA Kosuke
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: National Institute of Health Sciences
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2012-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24790137/
• 关键词: 種子; 遺伝子導入; ゲノム; エピジェネティクス

Genomic DNA and histone modifications, such as methylation, acetylation and phosphorylation, code for epigenetic information which control cellular function such as gene expression and regulation. This information is independent of the nucleic acid sequence, and is transmitted and maintained through cell division and generations. However, the epigenetic dynamisms among plants, especially dry seed to its germinal stage at individual grain level, have not been well characterized. In this study, an experimental model system was developed to analyze pattern of the genomic DNA methylation and histone modifications in genetically modified and wild-type rice. The obtained data were analyzed using multivariable statistical method. For the first time, the epigenetic information profiling showed that the genetically modified seed may differ from the wild-type seed.

基因组DNA和组蛋白修饰，如甲基化、乙酰化和磷酸化，编码控制细胞功能如基因表达和调控的表观遗传信息。这种信息不依赖于核酸序列，通过细胞分裂和世代传递和维持。然而，植物的表观遗传动力学，特别是干种子到发芽阶段在单个籽粒水平，还没有得到很好的表征。本研究建立了一个分析转基因水稻和野生型水稻基因组DNA甲基化和组蛋白修饰模式的实验模型。所得数据采用多变量统计方法进行分析。表观遗传信息分析首次表明，转基因种子可能与野生型种子不同。

项目成果

Comparison of DNA extraction methods for sweet corn and processed sweet corns

甜玉米与加工甜玉米DNA提取方法的比较

• 发表时间: 2013
• 期刊: Food Hygiene and Safety Science
• 影响因子: 0.3
• 作者: Takabatake;R.;Noritake;H.;Noguchi;A.;Nakamura;K.;Kondo;K.;Akiyama;H.;Teshima;R.;Mano;J.;Kitta;K
• 通讯作者: K

A novel DNA extraction and purification method using an ion-exchange resin type kit for the detection of genetically modified papaya in processed papaya products

一种使用离子交换树脂型试剂盒检测木瓜加工产品中转基因木瓜的新型 DNA 提取和纯化方法

• 发表时间: 2013
• 期刊: Food Control
• 影响因子: 6
• 作者: Ohmori;K.;Nakamura;K.;Kasahara;M.;Takabatake;R.;Kitta;K.;Fujimaki;T.;Kondo;K.;Teshima;R.;Akiyama;H
• 通讯作者: H

Proficiency testing of unauthorized genetically modified rice using plasmid DNA test samples

使用质粒 DNA 测试样品对未经授权的转基因水稻进行能力验证

• 发表时间: 2012
• 期刊: Japanese Journal of Food Chemistry and Safety
• 作者: Kasama;K.;Inoue;Y;Akiyama;H.;Suzuki;T.;Sakata;K.;Nakamura;K.;Ohshima;Y.;Kojima;K.;Kondo;K.;Teshima;R
• 通讯作者: R

2010年度米国産不分別遺伝子組換えトウモロコシ試料中の系統分析

2010年美国生产的未分类转基因玉米样品的系统发育分析

• 发表时间: 2013
• 作者: 野口秋雄;坂田こずえ;真野潤一;中村公亮;高畠令王奈;峯岸恭孝;橘田和美;穐山浩;手島玲子;近藤一成;最上(西巻)知子
• 通讯作者: 最上(西巻)知子

ヒトエリスロポエチン遺伝子を導入された組換えニワトリに由来する肉の検知法について

导入人促红细胞生成素基因的重组鸡肉的检测方法

• 发表时间: 2013
• 作者: 中島治;中村公亮;近藤一成;穐山浩;手島玲子
• 通讯作者: 手島玲子