カイコ細胞におけるMAPK情報伝達経路の遺伝子ネットワーク解析
カイコ細胞におけるMAPK情報伝達経路の遺伝子ネットワーク解析
批准号:
14F04090
负责人:
日下部 宜宏
金额:
$1.47万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2014
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2014-04-25 至 2016-03-31
中文摘要
MAPK経路は真核生物に広く保存されている増殖刺激やストレスなど細胞外シグナルを核へと伝達する経路である。この経路は、ERK1/2、JUK1-3、p38の3経路に大別され、それぞれ、上流のキナーゼ群が存在する。そこで、各経路について鍵となる遺伝子について、機能阻害とRNAプロファイル解析により各経路の役割を明らかにすることを計画した。また、p38 MAPKは、ラパマイシン受容体(TOR)を介した制御を受けている。また、ラパマイシンは抗老化物質とし注目されているが、昆虫では詳細な解析は行われていない。そこで、カイコMAPK経路と、ラパマイシン情報伝達経路関連遺伝子との関連を明らかにすべく、各遺伝子の機能解析を行った。まず、カイコゲノム中にMAPKKKKを6遺伝子、MAPKKKを11遺伝子, 4 records MAPKKを4遺伝子、 MAPKを3遺伝子同定した。ついで、各遺伝子の機能阻害解析を行った結果、これらの単独機能阻害は、細胞の形態、増殖に影響を及ぼさなかった。ERK、p38、JUNキナーゼなど、各経路について1種しか存在しない遺伝子についても同様であった。また、ERK、p38、JUNキナーゼ機能阻害BmN4SID-1細胞よりRNAを抽出し、次世代シーケンサー(RNA-Seq)を用いたRNAプロファイル解析用のライブラリー作製し、mRNA発現動態の変化を解析したところ、p38、ERK1/2、 JUK1-3機能阻害細胞においてそれぞれ、18, 14, 32遺伝子の発現が顕著に変化していた。特に、Na/K-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3 (NKAIN3)をコードしていたBGIBMGA017058 遺伝子は、p38、ERK1/2、JUK1-3の3種の阻害細胞全てにおいて発現量が低下していた。
英文摘要
MAPK経路は真核生物に広く保存されている増殖刺激やストレスなど細胞外シグナルを核へと伝達する経路である。この経路は、ERK1/2、JUK1-3、p38の3経路に大別され、それぞれ、上流のキナーゼ群が存在する。そこで、各経路について鍵となる遺伝子について、機能阻害とRNAプロファイル解析により各経路の役割を明らかにすることを計画した。また、p38 MAPKは、ラパマイシン受容体(TOR)を介した制御を受けている。また、ラパマイシンは抗老化物質とし注目されているが、昆虫では詳細な解析は行われていない。そこで、カイコMAPK経路と、ラパマイシン情報伝達経路関連遺伝子との関連を明らかにすべく、各遺伝子の機能解析を行った。まず、カイコゲノム中にMAPKKKKを6遺伝子、MAPKKKを11遺伝子, 4 records MAPKKを4遺伝子、 MAPKを3遺伝子同定した。ついで、各遺伝子の機能阻害解析を行った結果、これらの単独機能阻害は、細胞の形態、増殖に影響を及ぼさなかった。ERK、p38、JUNキナーゼなど、各経路について1種しか存在しない遺伝子についても同様であった。また、ERK、p38、JUNキナーゼ機能阻害BmN4SID-1細胞よりRNAを抽出し、次世代シーケンサー(RNA-Seq)を用いたRNAプロファイル解析用のライブラリー作製し、mRNA発現動態の変化を解析したところ、p38、ERK1/2、 JUK1-3機能阻害細胞においてそれぞれ、18, 14, 32遺伝子の発現が顕著に変化していた。特に、Na/K-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3 (NKAIN3)をコードしていたBGIBMGA017058 遺伝子は、p38、ERK1/2、JUK1-3の3種の阻害細胞全てにおいて発現量が低下していた。
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カイコにおけるTORシグナル経路の解明
家蚕 TOR 信号通路的阐明
DOI:
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发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Jian Xu, Hiroaki Mon, Jae Man Lee, Takahiro Kusakabe, 平田一真・佐藤昌直・徐 剣・季 明明・祝 力・日野真人・山下真実・諸熊大輔・門 宏明・李 在萬・日下部宜宏]
通讯作者:
平田一真・佐藤昌直・徐 剣・季 明明・祝 力・日野真人・山下真実・諸熊大輔・門 宏明・李 在萬・日下部宜宏
RNA-Seq-based transcriptome analysis of p38, ERK and JNK MAPK gene suppressions in cultured Bombyx mori cells
基于 RNA-Seq 的转录组分析,对培养的家蚕细胞中 p38、ERK 和 JNK MAPK 基因抑制进行分析
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Jian Xu, Hiroaki Mon, Jae Man Lee, Takahiro Kusakabe]
通讯作者:
Takahiro Kusakabe
Generation of silkworm lacking silk gland suitable for insect factories
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批准号:21K19121
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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资助金额:$4.16万
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财政年份:2021
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负责人:日下部 宜宏
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依托单位:
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批准号:13F03387
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2013
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负责人:日下部 宜宏
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依托单位:
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批准号:12F02396
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2012
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负责人:日下部 宜宏
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依托单位:
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批准号:21658018
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$1.98万
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财政年份:2009
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负责人:日下部 宜宏
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依托单位:
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批准号:14704010
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
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资助金额:$18.72万
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财政年份:2002
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负责人:日下部 宜宏
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依托单位:
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批准号:11142208
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1999
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负责人:日下部 宜宏
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依托单位:
国内基金
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