カイコ細胞におけるＭＡＰＫ情報伝達経路の遺伝子ネットワーク解析

家蚕细胞MAPK信号通路基因网络分析

• 批准号: 14F04090
• 负责人: 日下部 宜宏
• 金额: $ 1.47万
• 依托单位: Kyushu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2014
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2014-04-25 至 2016-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-14F04090/
• 关键词: MAPK経路; 昆虫; ラパマイシン受容体; カイコ; シグナル伝達

MAPK経路は真核生物に広く保存されている増殖刺激やストレスなど細胞外シグナルを核へと伝達する経路である。この経路は、ERK1/2、JUK1-3、p38の３経路に大別され、それぞれ、上流のキナーゼ群が存在する。そこで、各経路について鍵となる遺伝子について、機能阻害とRNAプロファイル解析により各経路の役割を明らかにすることを計画した。また、p38 MAPKは、ラパマイシン受容体（TOR）を介した制御を受けている。また、ラパマイシンは抗老化物質とし注目されているが、昆虫では詳細な解析は行われていない。そこで、カイコMAPK経路と、ラパマイシン情報伝達経路関連遺伝子との関連を明らかにすべく、各遺伝子の機能解析を行った。まず、カイコゲノム中にMAPKKKKを６遺伝子、MAPKKKを１１遺伝子, 4 records MAPKKを４遺伝子、 MAPKを３遺伝子同定した。ついで、各遺伝子の機能阻害解析を行った結果、これらの単独機能阻害は、細胞の形態、増殖に影響を及ぼさなかった。ERK、p38、JUNキナーゼなど、各経路について１種しか存在しない遺伝子についても同様であった。また、ERK、p38、JUNキナーゼ機能阻害BmN4SID-1細胞よりRNAを抽出し、次世代シーケンサー(RNA-Seq)を用いたRNAプロファイル解析用のライブラリー作製し、mRNA発現動態の変化を解析したところ、p38、ERK1/2、 JUK1-3機能阻害細胞においてそれぞれ、18, 14, 32遺伝子の発現が顕著に変化していた。特に、Na/K-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3 (NKAIN3)をコードしていたBGIBMGA017058 遺伝子は、p38、ERK1/2、JUK1-3の３種の阻害細胞全てにおいて発現量が低下していた。

MAPK pathway is the pathway for eukaryotic cell growth and development. The circuit, ERK1/2, JUK1-3, p38 and 3 circuits are in existence. For example, each circuit has a key to the transmission of information, functional resistance and RNA analysis, and each circuit has a clear service plan. p38 MAPK is a receptor that regulates the expression of protein. Anti-aging substances such as insects and insects are analyzed in detail. The information of MAPK circuit and its correlation with each other is analyzed. MAPKKK 6, MAPKKK 11, MAPKK 4, MAPK 3, MAPKK 4, MAPKK 5, MAPKK 6, MAPKK 7, MAPKK 8, MAPKK 9, MAPKK 9, MAPKK In addition, the functional resistance analysis of each gene was carried out, and the functional resistance of each gene was analyzed. The morphological and reproductive effects of each gene were also analyzed. ERK, p38, JUN, RNA extraction from BmN4SID-1 cells, RNA-Seq (RNA-Seq) analysis, mRNA expression dynamics analysis, 18, 14, 32 gene expression in BmN4SID-1 cells, p38, ERK1/2, JUK1 -3 cells. In particular, Na/K-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3 (NKAIN3) was detected in BGIBMGA017058, p38, ERK1/2 and JUK1 -3.

项目成果

カイコにおけるTORシグナル経路の解明

家蚕 TOR 信号通路的阐明

• 发表时间: 2015
• 作者: Jian Xu;Hiroaki Mon;Jae Man Lee;Takahiro Kusakabe;平田一真・佐藤昌直・徐 剣・季 明明・祝 力・日野真人・山下真実・諸熊大輔・門 宏明・李 在萬・日下部宜宏
• 通讯作者: 平田一真・佐藤昌直・徐 剣・季 明明・祝 力・日野真人・山下真実・諸熊大輔・門 宏明・李 在萬・日下部宜宏

RNA-Seq-based transcriptome analysis of p38, ERK and JNK MAPK gene suppressions in cultured Bombyx mori cells

基于 RNA-Seq 的转录组分析，对培养的家蚕细胞中 p38、ERK 和 JNK MAPK 基因抑制进行分析

• 发表时间: 2015
• 作者: Jian Xu;Hiroaki Mon;Jae Man Lee;Takahiro Kusakabe
• 通讯作者: Takahiro Kusakabe