昆虫における効率的な遺伝子ノックインシステムの構築
昆虫における効率的な遺伝子ノックインシステムの構築
批准号:
13F03387
负责人:
日下部 宜宏
金额:
$1.47万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2013
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2013-04-01 至 2016-03-31
中文摘要
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英文摘要
カイコは、モデル昆虫、産業昆虫として、多様な遺伝子組換え昆虫が作出されいる。一方、遺伝子ノックインは、究極の遺伝子操作技術であると考えられているが、その効率は極めて低い。しかし、ゲノム編集技術の技術革新により、遺伝子破壊は可能となった。さらに、遺伝子ノックインを効率的に誘導するためには、DNA切断後、相同組換え(HR)を誘導する必要がある。このような状況を踏まえて、本研究では、カイコNHEJ関連因子の機能を明らかにするとともに、両経路間のクロストークを明らかにし、それらを制御することで、効率良く遺伝子ノックインを誘導する方法の確立を目指した。まず、カイコNHEJ関連因子、およびHR関連因子の同定と機能解析を行った。同時に、新規NHEJ活性測定用のアッセイシステムを構築し、既存のHRアッセイ系と組み合わせることにより、樹立したアッセイ細胞において機能阻害し、NHEJ経路への影響、及びNHEJ経路を抑制した際にHR修復経路に与える影響を解析した。カイコNHEJ関連遺伝子と想定していた遺伝子の多くは、機能阻害によりNHEJ効率が著しく低下したことから、これらの機能不全が、効率的な遺伝子ターゲティングを誘導できることを示唆していた。そこで、NHEJ関連遺伝子についてノックアウト細胞を樹立した。次いで、ゲノム編集用のCRISPERと同時にHRの鋳型となるDNAを導入したところ、TUDOR-SN遺伝子内の相同配列とカイコゲノム間で、遺伝子ターゲティングが誘導され、TUDOR-SN遺伝子内に正確にGFP遺伝子をノックインすることができた。また、その際、挿入のための相同性のあるアーム部分の長さは、100 bpから250 bpで十分であることも確認できた。この場合、RNAiによるNHEJ関連遺伝子機能阻害細胞でより効率的に遺伝子ノックインが誘導できることを明らかにした。
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会议论文
Role of silkworm RISC components in the basal defense against Bombyx mori nucleopolyhedrovirus (BmNPV)
家蚕 RISC 成分在家蚕核多角体病毒 (BmNPV) 基础防御中的作用
DOI:
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发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[祝 力・徐 剣・李 志清・門 宏明・ 李 在萬・日下部宜宏]
通讯作者:
祝 力・徐 剣・李 志清・門 宏明・ 李 在萬・日下部宜宏
Generation of silkworm lacking silk gland suitable for insect factories
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批准号:21K19121
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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资助金额:$4.16万
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财政年份:2021
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负责人:日下部 宜宏
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依托单位:
カイコ細胞におけるMAPK情報伝達経路の遺伝子ネットワーク解析
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批准号:14F04090
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2014
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负责人:日下部 宜宏
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依托单位:
カイコ分散型染色体におけるクロマチン動態のエピジェネティック制御
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批准号:12F02396
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2012
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负责人:日下部 宜宏
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依托单位:
昆虫分散型動原体染色体の謎
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批准号:21658018
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$1.98万
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财政年份:2009
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负责人:日下部 宜宏
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依托单位:
昆虫細胞におけるDNA修復と減数分裂期相同組換え
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批准号:14704010
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
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资助金额:$18.72万
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财政年份:2002
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负责人:日下部 宜宏
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依托单位:
家蚕の5齢致死突然変異利用による変態制御機構の解析
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批准号:11142208
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1999
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负责人:日下部 宜宏
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依托单位:
海外基金