イネ転移因子mPingを介した転写因子発現促進ループの構築

水稻转座元件mPing介导的转录因子表达促进环的构建

基本信息

  • 批准号:
    14J02449
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.6万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2014
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2014-04-25 至 2016-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

イネ品種銀坊は転移因子mPingの転移活性が高い。銀坊主集団から目的のmPing挿入変異を選抜できれば、これらの遺伝資源を効率的に利用できる。本年度までに、10,560個体の銀坊主に由来するmPing挿入パネルの作製および後代の種子増殖を完了した。これまでに、50,629の挿入が同定できており、mPing挿入変異体の幅広い利用が期待される。昨年度に、塩ストレス条件下でmPingを認識する転写因子としてORR1を同定した。ORR1のプロモーターにmPingが挿入した場合、mPingを介してORR1自身の発現が促進されると考えられる(発現促進ループ)。さらに、任意のmPing挿入型プロモーターを組み合わせることで、任意の遺伝子発現を飛躍的に増幅できると期待される。本年度は、発現促進ループ形成の可能性を検証した。ORR1の過剰発現体をもちいたマイクロアレイ解析の結果、ORR1の過剰発現により発現量が2倍以上に上昇した遺伝子は2,926個であった。各遺伝子の発現量と最近傍mPing挿入までの距離に着目したところ、転写開始点上流1 kbp以内にmPing挿入をもつ遺伝子の発現量は上昇する傾向が認められた。この結果はORR1がmPing配列を介して下流の遺伝子発現を促進することを示唆している。次に、ORR1の転写開始点上流1 kbp以内へのmPing挿入をmPing挿入パネルで探索・選抜した。選抜の結果、挿入部位の異なる3種類のmPing挿入個体を獲得した。選抜した挿入ホモおよび非挿入ホモ個体におけるORR1の発現量を比較した結果、発現促進ループの形成は認められなかった。ORR1によるmPing挿入型プロモーターの発現制御を効率よく利用するには、ORR1とmPingの相互作用を詳細に解析する必要がある。
The migration activity of MPing is high. The Bank's main team has a variety of options for the purpose of improving the efficiency of resource utilization. During the year, 10,560 individual bank owners completed their production and seed production. 50,629 entries are available at the same time. The ORR factor is constant under the same conditions. ORR1 's mPing is introduced when ORR1 's mPing is introduced and ORR1 's own mPing is promoted. In addition, any random number of entries into the database can be grouped together, and any random number of entries can be generated by increasing the size of the database. This year, the possibility of promoting the formation of a group has been demonstrated. ORR1 's occurrence increased by more than 2 times and the number of ORR1 's occurrence increased by 2,926 The occurrence of each gene and the distance between the nearest mPing entry point and the mPing entry point within 1 kbp upstream of the writing start point tend to increase. This results in ORR1 and mPing alignment, which promotes the development of downstream vectors. Next, ORR1 and the start point of writing within 1 kbp upstream of the mPing into the mPing into the group to explore the selection. The results of the selection, the different parts of the entry, and the three types of mPing entry individuals were obtained. The results of the comparison of ORR1 and ORR1 in the selection process and the non-selection process are as follows: ORR1 and mPing are required for detailed analysis of the interaction between ORR1 and mPing.

项目成果

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专著数量(0)
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专利数量(0)
イネ転移因子mPingを介した転写因子発現促進ループの構築
水稻转座元件mPing介导的转录因子表达促进环的构建
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    安田加奈子;築山拓司;奥本裕
  • 通讯作者:
    奥本裕
The evaluation and improvement of STAmP (Spontaneous transposition of an active transposable element of miniature-Ping) database in rice.
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Kanako Yasuda;Takuji Tsukiyama;Hiroki Saito;Ken Naito;Masayoshi Teraishi;Takatoshi Tanisaka;and Yutaka Okumoto.
  • 通讯作者:
    and Yutaka Okumoto.
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    $ 1.6万
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  • 资助金额:
    $ 1.6万
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  • 财政年份:
    2016
  • 资助金额:
    $ 1.6万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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    2013
  • 资助金额:
    $ 1.6万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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    2008
  • 资助金额:
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  • 财政年份:
    2007
  • 资助金额:
    $ 1.6万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 1.6万
  • 项目类别:
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  • 批准号:
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  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 1.6万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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