究極的DNA鑑定である微量混合試料分析法の開発と評価
究極的DNA鑑定である微量混合試料分析法の開発と評価
批准号:
14J03372
负责人:
真鍋 翔
金额:
$1.22万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2014
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2014-04-25 至 2016-03-31
中文摘要
法医鑑識領域において、複数人のDNAが混合した試料や微量試料の分析結果について、何人のDNAが含まれるか、被疑者のDNAは含まれるか等を尤度比を利用して確率的に評価する必要があるが、その方法は未だ確立していない。しかし、最近提唱されたcontinuous modelは、ピークの高さに影響を及ぼす様々な因子を考慮することで、より厳密な確率的評価を行えると期待されている。しかし、この方法は実践的なデータよりも理論的な条件設定が中心であり、パラメータの設定値やプログラムのアルゴリズムに問題点を有している。そこで、本研究ではcontinuous modelに基づいたソフトウェアを独自に作成し、検証することを目的としている。本年度は、昨年度までに作成したソフトウェアの改良とその検証を行った。昨年度までのソフトウェアでは、本来検出されるはずのアリルが微量なため検出されないこと(アリルドロップアウト)やDNAの断片化の影響を扱えなかったが、本年度はこれら2つの因子をソフトウェアに組み入れた。また、continuous modelではシミュレーション的にパラメータの値を推定した上で確率計算を行うが、昨年度まで利用していたMCMC法では各パラメータが非現実的な値となる問題点があった。そこで本年度は、各パラメータの確率分布を実験的に推定した上で、その確率分布に従って乱数を発生させる方法(モンテカルロ法)を新たに利用することにし、ソフトウェアのプログラムを改良した。また、2人から4人までのDNA混合試料を計20例作製し、ソフトウェアで分析した。各混合試料について、何人のDNAが含まれるかの推定と仮に設定した被疑者の関与の有無に関する尤度比の計算を行い、従来の方法と比較した。その結果、本ソフトウェアにおける判定の精度は従来法よりも向上した。よって、本ソフトウェアは混合試料の解析に有用であった。
英文摘要
法医鑑識領域において、複数人のDNAが混合した試料や微量試料の分析結果について、何人のDNAが含まれるか、被疑者のDNAは含まれるか等を尤度比を利用して確率的に評価する必要があるが、その方法は未だ確立していない。しかし、最近提唱されたcontinuous modelは、ピークの高さに影響を及ぼす様々な因子を考慮することで、より厳密な確率的評価を行えると期待されている。しかし、この方法は実践的なデータよりも理論的な条件設定が中心であり、パラメータの設定値やプログラムのアルゴリズムに問題点を有している。そこで、本研究ではcontinuous modelに基づいたソフトウェアを独自に作成し、検証することを目的としている。本年度は、昨年度までに作成したソフトウェアの改良とその検証を行った。昨年度までのソフトウェアでは、本来検出されるはずのアリルが微量なため検出されないこと(アリルドロップアウト)やDNAの断片化の影響を扱えなかったが、本年度はこれら2つの因子をソフトウェアに組み入れた。また、continuous modelではシミュレーション的にパラメータの値を推定した上で確率計算を行うが、昨年度まで利用していたMCMC法では各パラメータが非現実的な値となる問題点があった。そこで本年度は、各パラメータの確率分布を実験的に推定した上で、その確率分布に従って乱数を発生させる方法(モンテカルロ法)を新たに利用することにし、ソフトウェアのプログラムを改良した。また、2人から4人までのDNA混合試料を計20例作製し、ソフトウェアで分析した。各混合試料について、何人のDNAが含まれるかの推定と仮に設定した被疑者の関与の有無に関する尤度比の計算を行い、従来の方法と比較した。その結果、本ソフトウェアにおける判定の精度は従来法よりも向上した。よって、本ソフトウェアは混合試料の解析に有用であった。
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身元確認のための2者間血縁鑑定ツールの開発
身份确认两方亲属关系鉴定工具开发
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
法科学技術
影响因子:
--
作者:
[濱野 悠也, 真鍋 翔, 吉田 耕一, 川合 千裕, 玉木 敬二]
通讯作者:
玉木 敬二
同胞鑑定例におけるIdentifiler検査の有効性の検討
检查 Identifiler 测试在兄弟姐妹识别案件中的有效性
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
DNA多型
影响因子:
--
作者:
[真鍋 翔, 吉田 耕一, 川合 千裕, 尾関 宗孝, 小谷 泰一, 玉木 敬二]
通讯作者:
玉木 敬二
混合試料分析において、対立仮説に被疑者の血縁者の関与を想定した尤度比計算とその評価
混合样本分析中,假设备择假设中嫌疑人的血亲参与,进行似然比计算和评估
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
DNA多型
影响因子:
--
作者:
[真鍋 翔, 川合 千裕, 垣本 由布, 石田 季子, 宮尾 昌, 玉木 敬二]
通讯作者:
玉木 敬二
ピーク高に影響を及ぼす各パラメータの分布に関する統計的推定
统计估计影响峰高的每个参数的分布
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[真鍋 翔, 濱野 悠也, 川合 千裕, 森本 千恵, 宮尾 昌, 玉木 敬二]
通讯作者:
玉木 敬二
新しく開発した混合試料分析ソフトウェアの検証-米国NISTによる調査で扱われた複雑な混合試料を用いて-.
验证新开发的混合样本分析软件 - 使用美国 NIST 进行的一项调查中使用的复杂混合样本。
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
DNA多型
影响因子:
--
作者:
[真鍋翔, 森本千恵, 濱野悠也, 藤本駿太朗, 川合千裕, 小谷泰一, 玉木敬二.]
通讯作者:
玉木敬二.
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