メチローム解析による試験管内始原生殖細胞誘導過程における遺伝子発現制御機構の解明
メチローム解析による試験管内始原生殖細胞誘導過程における遺伝子発現制御機構の解明
批准号:
14J04310
负责人:
白根 健次郎
金额:
$1.79万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2014
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2014-04-25 至 2017-03-31
中文摘要
本研究は胚性幹細胞からエピブラスト様細胞を経て誘導された始原生殖細胞様細胞をモデルとして生殖細胞形成過程におけるDNAメチル化制御機構と遺伝子発現とメチル化の関係性を明らかにすることを目的としている。本年度は昨年度までに取得したデータの詳細な解析を行い、胚性幹細胞と始原生殖細胞様細胞におけるDNAメチル化による遺伝子発現制御は大きく異なることを発見した。胚性幹細胞では多能性の維持に関わる遺伝子を含む遺伝子周辺は低いDNAメチル化状態であり、転写活性化と関わるのに対して、始原生殖細胞様細胞ではポリコームのターゲット遺伝子である発生関連遺伝子周囲のDNA が低いメチル化状態となるもののH3K27me3によりその抑制状態を保つことがわかった。また、胚性幹細胞と始原生殖細胞様細胞における低いDNAのメチル化状態の確立と維持にはPrdm14という因子が必須であることを突き止めた。更に、メスの胚性幹細胞、エピブラスト様細胞、始原生殖細胞様細胞のDNAメチル化レベルはオスと比べて低いこと、またメスの胚性幹細胞とエピブラスト様細胞では特定のがん細胞に特徴的なラミナ会合ドメインにおけるメチル化の低下が見られた。
英文摘要
本研究は胚性幹細胞からエピブラスト様細胞を経て誘導された始原生殖細胞様細胞をモデルとして生殖細胞形成過程におけるDNAメチル化制御機構と遺伝子発現とメチル化の関係性を明らかにすることを目的としている。本年度は昨年度までに取得したデータの詳細な解析を行い、胚性幹細胞と始原生殖細胞様細胞におけるDNAメチル化による遺伝子発現制御は大きく異なることを発見した。胚性幹細胞では多能性の維持に関わる遺伝子を含む遺伝子周辺は低いDNAメチル化状態であり、転写活性化と関わるのに対して、始原生殖細胞様細胞ではポリコームのターゲット遺伝子である発生関連遺伝子周囲のDNA が低いメチル化状態となるもののH3K27me3によりその抑制状態を保つことがわかった。また、胚性幹細胞と始原生殖細胞様細胞における低いDNAのメチル化状態の確立と維持にはPrdm14という因子が必須であることを突き止めた。更に、メスの胚性幹細胞、エピブラスト様細胞、始原生殖細胞様細胞のDNAメチル化レベルはオスと比べて低いこと、またメスの胚性幹細胞とエピブラスト様細胞では特定のがん細胞に特徴的なラミナ会合ドメインにおけるメチル化の低下が見られた。
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試験管内始原生殖細胞誘導における全ゲノムDNAメチル化解析
体外原始生殖细胞诱导过程中的全基因组 DNA 甲基化分析
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[白根健次郎, 栗本一基, 林克彦, 渡辺亮, 斎藤通紀, 佐々木裕之]
通讯作者:
佐々木裕之
Analysis of influenza A/H3N2 neuraminidase genes obtained from influenza patients in the 2011/12 and 2012/13 seasons in Japan
日本2011/12、2012/13流感季流感患者甲型/H3N2流感神经氨酸酶基因分析
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
Fukuoka Acta Medica
影响因子:
--
作者:
[Ikematsu, H., Chong, Y., Shirane, K., Toh, H., Sasaki, H., Koga, Y., Matsumoto, S., Hotta, T., Uchiumi, T., Kang, D.]
通讯作者:
D.
DOI:
10.1186/s12864-015-1833-5
发表时间:
2015-08-20
期刊:
BMC genomics
影响因子:
4.4
作者:
[Kubo N, Toh H, Shirane K, Shirakawa T, Kobayashi H, Sato T, Sone H, Sato Y, Tomizawa S, Tsurusaki Y, Shibata H, Saitsu H, Suzuki Y, Matsumoto N, Suyama M, Kono T, Ohbo K, Sasaki H]
通讯作者:
Sasaki H
Analysis of the Neuraminidase Amino Acid Sequences of Influenza A/H1N1pdm09, A/H3N2, and B Viruses Isolated from Influenza Patients in the 2013/14 Japanese Influenza Season
2013/14日本流感季节从流感患者分离的甲型/H1N1pdm09、甲型/H3N2和乙型流感病毒神经氨酸酶氨基酸序列分析
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
Fukuoka Acta Medica
影响因子:
--
作者:
[Ikematsu, H., Chong, Y., Shirane, K., Toh, H., Sasaki, H., Koga, Y., Matsumoto, S., Hotta, T., Uchiumi, T., Kang, D.]
通讯作者:
D.
Global Landscape and Regulatory Principle of DNA Methylation Reprogramming for Germ Cell Specification by Mouse Pluripotent Stem Cells
小鼠多能干细胞生殖细胞规范DNA甲基化重编程的全球格局和调控原理
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kenjiro Shirane, Kazuki Kurimoto, Yukihiro Yabuta, Masashi Yamaji, Akira Watanabe, Katsuhiko Hayashi, Mitinori Saitou, Hiroyuki Sasaki]
通讯作者:
Hiroyuki Sasaki
共 10 条
レトロトランスポゾンによる卵母細胞の発生制御
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批准号:24K01938
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.9万
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财政年份:2024
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负责人:白根 健次郎
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依托单位:
Characterizing the roles of oocyte-specific factors in inhibiting unique features of the sperm epigenome
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批准号:22K15125
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项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2022
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负责人:白根 健次郎
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依托单位:
海外基金