クロマチンタンパク質のユビキチン修飾を介した維持DNAメチル化制御機構の解析
クロマチンタンパク質のユビキチン修飾を介した維持DNAメチル化制御機構の解析
批准号:
14J07515
负责人:
山口 留奈
金额:
$1.79万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2014
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2014-04-25 至 2017-03-31
中文摘要
DNAのメチル化は、エピジェネティック情報の一つとして細胞固有の遺伝子発現や形質制御に重要であり、個体の正常な発生や細胞分化に関与する。本研究では、維持メチル化の過程でUhrf1依存的に生じるヒストンH3のユビキチン化/脱ユビキチン化制御の分子機構の解明および細胞の生存に与える影響を明らかにすることを目的とする。DNAのメチル化パターンはDNA複製を介して親鎖から娘鎖へと、メチル化酵素Dnmt1により正確に継承される必要がある。我々はこれまでにアフリカツメガエル卵を用いた無細胞系での解析により、ヘミメチル化DNA結合タンパク質Uhrf1によるH3K23のユビキチン化が、Dnmt1の同部位への集積に重要であることを報告してきた。またDNA複製の完了に伴い、Dnmt1のクロマチンからの解離とともにH3の脱ユビキチン化が起こることが分かっているが、この詳細は不明である。H3の脱ユビキチン化がDnmt1の解離とともに起こることに注目し、卵抽出液を用いてDnmt1に結合する脱ユビキチン化酵素を質量分析にて探索したところUsp7を同定した。そこでUsp7のクロマチン結合を調べると、複製依存的かつDnmt1およびUhrf1依存的に結合することが分かった。興味深いことに、Usp7を卵抽出液より特異抗体を用いて免疫除去したとき、Dnmt1のクロマチン結合の増強およびH3の弱いユビキチン化が見られた。続いてin vitroの脱ユビキチン化アッセイにより、Usp7が直接ヒストンH3を脱ユビキチン化する活性について検討したところ、加えたリコンビナントUsp7の濃度依存的にH3のユビキチン化の減少が見られた。またUsp7阻害剤で抽出液を処理したところ、DNAメチル化がコントロールに比べ大きく抑制されることを見出した。
英文摘要
DNAのメチル化は、エピジェネティック情報の一つとして細胞固有の遺伝子発現や形質制御に重要であり、個体の正常な発生や細胞分化に関与する。本研究では、維持メチル化の過程でUhrf1依存的に生じるヒストンH3のユビキチン化/脱ユビキチン化制御の分子機構の解明および細胞の生存に与える影響を明らかにすることを目的とする。DNAのメチル化パターンはDNA複製を介して親鎖から娘鎖へと、メチル化酵素Dnmt1により正確に継承される必要がある。我々はこれまでにアフリカツメガエル卵を用いた無細胞系での解析により、ヘミメチル化DNA結合タンパク質Uhrf1によるH3K23のユビキチン化が、Dnmt1の同部位への集積に重要であることを報告してきた。またDNA複製の完了に伴い、Dnmt1のクロマチンからの解離とともにH3の脱ユビキチン化が起こることが分かっているが、この詳細は不明である。H3の脱ユビキチン化がDnmt1の解離とともに起こることに注目し、卵抽出液を用いてDnmt1に結合する脱ユビキチン化酵素を質量分析にて探索したところUsp7を同定した。そこでUsp7のクロマチン結合を調べると、複製依存的かつDnmt1およびUhrf1依存的に結合することが分かった。興味深いことに、Usp7を卵抽出液より特異抗体を用いて免疫除去したとき、Dnmt1のクロマチン結合の増強およびH3の弱いユビキチン化が見られた。続いてin vitroの脱ユビキチン化アッセイにより、Usp7が直接ヒストンH3を脱ユビキチン化する活性について検討したところ、加えたリコンビナントUsp7の濃度依存的にH3のユビキチン化の減少が見られた。またUsp7阻害剤で抽出液を処理したところ、DNAメチル化がコントロールに比べ大きく抑制されることを見出した。
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DOI:
10.1038/s41598-017-00136-5
发表时间:
2017-03-03
期刊:
Scientific reports
影响因子:
4.6
作者:
[Yamaguchi L, Nishiyama A, Misaki T, Johmura Y, Ueda J, Arita K, Nagao K, Obuse C, Nakanishi M]
通讯作者:
Nakanishi M
Reguation of DNA methylation-coupled histone H3 deubiquitylation
DNA 甲基化偶联组蛋白 H3 去泛素化的调控
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[山口留奈, 西山敦哉, 中西真]
通讯作者:
中西真
ヒストンユビキチン化・脱ユビキチン化による DNA維持メチル化制御
通过组蛋白泛素化/去泛素化控制 DNA 维持甲基化
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[中西真※, 西山敦哉, 山口留奈]
通讯作者:
山口留奈
ユビキチン修飾系によるDNAメチル化維持経路の制御
泛素修饰系统控制DNA甲基化维持途径
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[西山敦哉※, 山口留奈, 三崎紀展, 有田恭平, 佐伯泰, 中西真]
通讯作者:
中西真
Role of the PCNA-interacting protein box of Dnmt1 in the maintenance of DNA methylation
Dnmt1 的 PCNA 相互作用蛋白盒在维持 DNA 甲基化中的作用
DOI:
--
发表时间:
2017
期刊:
Nagoya Medical Journal
影响因子:
--
作者:
[Luna Yamaguchi, Toshinori Misaki, Atsuya Nishiyama, Makoto Nakanishi]
通讯作者:
Makoto Nakanishi
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