結晶構造解析による赤痢菌エフェクターの作用機構の解明とその応用
結晶構造解析による赤痢菌エフェクターの作用機構の解明とその応用
批准号:
14J10879
负责人:
西出 旭
金额:
$1.79万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2014
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2014-04-25 至 2017-03-31
中文摘要
病原菌は感染に際し、エフェクターと呼ばれる約30種類のタンパク質を宿主細胞へ分泌し、宿主の持つ防御機構を妨げることで感染を成立させる。これらの中で、脱アミド化酵素OspI及びユビキチンリガーゼIpaHファミリータンパク質は自然免疫応答を抑制することが、報告されている。先行研究として赤痢菌エフェクターOspIの構造研究を行い、OspIによる特異的なUbc13認識機構を明らかにした。しかし、赤痢菌による宿主免疫系の制御にはIpaHファミリーも関わっており、OspI単独の研究だけでは病原性細菌による宿主の免疫系阻害機構の理解およびこのエフェクターを制御することによる薬剤の開発には不十分である。そこで、OspIの研究と共にIpaHの構造解析を行うことにより、病原性細菌による宿主免疫系の抑制機構の理解および、エフェクターの機能を制御する薬剤開発の基盤構築を目的として本研究を行った。IpaHに関しては、26年度に行ったIpaH4との相互作用解析により結合が示唆されていた3種類の化合物をもちいて、これらの阻害活性を検証したが、何れの化合物も有意な阻害活性を持たなかった。しかし、IpaH4、IpaH3の活性の詳細を明らかにするために、ユビキチン変異体を用いたin vitroユビキチン化実験を行ったところ、これまで報告になかった連結様式のユビキチン鎖も伸長することが示唆された。OspIは、類似の活性を持つ酵素を阻害することが報告されている化合物を用いて、化合物との複合体結晶構造解析を行った。その結果、複合体構造を分解能2.6Åで決定することに成功した。OspIは活性残基が化合物と共有結合を形成した阻害型構造を形成しており、OspIと阻害剤の原子レベルの構造情報を得ることができた。
英文摘要
病原菌は感染に際し、エフェクターと呼ばれる約30種類のタンパク質を宿主細胞へ分泌し、宿主の持つ防御機構を妨げることで感染を成立させる。これらの中で、脱アミド化酵素OspI及びユビキチンリガーゼIpaHファミリータンパク質は自然免疫応答を抑制することが、報告されている。先行研究として赤痢菌エフェクターOspIの構造研究を行い、OspIによる特異的なUbc13認識機構を明らかにした。しかし、赤痢菌による宿主免疫系の制御にはIpaHファミリーも関わっており、OspI単独の研究だけでは病原性細菌による宿主の免疫系阻害機構の理解およびこのエフェクターを制御することによる薬剤の開発には不十分である。そこで、OspIの研究と共にIpaHの構造解析を行うことにより、病原性細菌による宿主免疫系の抑制機構の理解および、エフェクターの機能を制御する薬剤開発の基盤構築を目的として本研究を行った。IpaHに関しては、26年度に行ったIpaH4との相互作用解析により結合が示唆されていた3種類の化合物をもちいて、これらの阻害活性を検証したが、何れの化合物も有意な阻害活性を持たなかった。しかし、IpaH4、IpaH3の活性の詳細を明らかにするために、ユビキチン変異体を用いたin vitroユビキチン化実験を行ったところ、これまで報告になかった連結様式のユビキチン鎖も伸長することが示唆された。OspIは、類似の活性を持つ酵素を阻害することが報告されている化合物を用いて、化合物との複合体結晶構造解析を行った。その結果、複合体構造を分解能2.6Åで決定することに成功した。OspIは活性残基が化合物と共有結合を形成した阻害型構造を形成しており、OspIと阻害剤の原子レベルの構造情報を得ることができた。
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DOI:
10.1016/j.jmb.2013.02.037
发表时间:
2013-08
期刊:
Journal of molecular biology
影响因子:
5.6
作者:
[A. Nishide;Minsoo Kim;K. Takagi;Ai Himeno;Takahito Sanada;C. Sasakawa;T. Mizushima]
通讯作者:
A. Nishide;Minsoo Kim;K. Takagi;Ai Himeno;Takahito Sanada;C. Sasakawa;T. Mizushima
赤痢菌エフェクターIpaH1880の結晶化と構造解析 ユビキチンネオバイオロジー
志贺氏菌效应子 IpaH1880 泛素新生物学的结晶和结构分析
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[西出旭, Minsoo Kim, 笹川千尋, 水島恒裕]
通讯作者:
水島恒裕
構造学的手法を用いた赤痢菌エフェクターIpaHファミリーの反応機構の解析
利用结构方法分析志贺菌效应子IpaH家族的反应机制
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[西出旭]
通讯作者:
西出旭
赤痢菌エフェクターOspIの結晶構造解析による観戦機構の解明
通过志贺氏菌效应子 OspI 的晶体结构分析阐明观察机制
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[西出旭, 水島恒裕]
通讯作者:
水島恒裕
赤痢菌エフェクターIpaH1880反応機構の解析
志贺菌效应子IpaH1880反应机制分析
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[西出旭]
通讯作者:
西出旭
共 7 条
病原タンパク質を標的とした分解誘導薬剤の提案と実証
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批准号:24K08633
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.91万
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财政年份:2024
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负责人:西出 旭
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依托单位:
海外基金