合成生物学的アプローチによる鉄硫黄クラスター合成系の反応機構と多様性の解析

利用合成生物学方法分析铁硫簇合成体系的反应机理和多样性

基本信息

  • 批准号:
    14J12351
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.41万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2014
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2014-04-25 至 2016-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

鉄硫黄(Fe-S)クラスターは鉄と硫黄から構成されるシンプルな形の金属コファクターだが、その生合成には複雑な多成分酵素系(マシナリー)が関与することが知られている。大腸菌は2種類のFe-Sクラスター生合成系(ISCとSUFマシナリー)を有しており、それぞれが独立してクラスターを合成しているが、これらを二重に破壊すると合成致死となるため、これまで詳細な遺伝学的解析が行われていなかった。一方、最近私は大腸菌のイソプレノイド合成経路を放線菌由来のメバロン酸経路に代謝改変することにより、クラスター生合成系の必須性を回避できることを見出した。この発見により、クラスター形成関連遺伝子群を自在に操作・解析して、その影響を正確に評価することができるようになった。そこで本年度は、この実験系を用いてISCマシナリーの中心成分であるIscU(クラスターの新規形成の足場)の機能解析を進めた。1.HscA/HscB (HSP70型シャペロン/コシャペロン)はISCマシナリーのクラスター形成機能に必須であるが、HscA/HscBの欠損をバイパスする二次的な変異をIscUの分子内部に同定した。クラスター形成反応においてHscA/HscBがIscUの構造変化を引き起こし、クラスター移行反応を促進させる可能性が考えられる。2.IscU Tyr3を他のアミノ酸に置換すると機能不全となるが、IscSの活性部位近傍の二次的なサプレッサー変異によって機能が回復する(平成26年度)。本年度では(野生型/機能不全型)IscUと(野生型/サプレッサー変異型)IscSをそれぞれ精製し、IscU-IscS間の相互作用および硫黄原子の受け渡し活性を調べたところ、IscU Tyr3がIscSから硫黄原子受け渡しの際の相互作用に重要であることを見出した。IscU Tyr3はIscSの活性部位近傍の構造変化を引き起こし、硫黄原子の移行反応を促進させる分子スイッチとして機能する可能性がある。
Iron and sulfur (Fe-S) are related to the formation of iron and sulfur in the form of metal complexes and multi-component enzyme systems. E. coli is composed of two kinds of Fe-S complex (ISC and SUF), which are composed of two kinds of Fe-S complex and two kinds of Fe-S complex. Recently, the importance of metabolic modification in the biosynthesis of E. coli and the origin of E. coli has been demonstrated. The discovery of this phenomenon is related to the formation of a group of related information, which is free from operation, analysis and influence. This year, we will continue to analyze the functions of ISC, the core component of ISC and the new rules. 1. HscA/HscB (HSP70 type) is required for the formation of ISC functions, and the secondary variation of HscA/HscB is the same within the molecule of IscU. HscA/HscB and IscU structural transformation may be initiated and promoted in the formation of reaction. 2. IscU Tyr3 is not fully functional due to its acid substitution, and its secondary acid substitution function is restored near the active site of IscS (Heisei 26). This year, IscU (wild-type/dysfunctional) and IscS (wild-type/dysfunctional) were refined, and IscU-IscS interactions were important for the regulation of sulfur atom transition activity, and IscU Tyr3 interactions were important for sulfur atom transition. IscU Tyr3 is likely to initiate structural changes near the active site of IscS and promote the migration of sulfur atoms.

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Genetic and biochemical analysis of IscU, a central component of Fe-S cluster biosynthesis machinery
Fe-S簇生物合成机制的核心组成部分IscU的遗传和生化分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Naoyuki Tanaka;Miaki Kanazawa;Tomohisa Kuzuyama;Yasuhiro Takahashi
  • 通讯作者:
    Yasuhiro Takahashi
鉄硫黄クラスター生合成系(ISCマシナリー)におけるIscUの構造変換の意義
IscU结构转变在铁硫簇生物合成系统(ISC机械)中的意义
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    田中尚志;松嶋夢叶;北村整一;和田啓;福山恵一;高橋康弘
  • 通讯作者:
    高橋康弘
イソプレノイド生合成系を改変した大腸菌における鉄硫黄クラスター生合成 系の解析
用改良的类异戊二烯生物合成系统分析大肠杆菌中的铁硫簇生物合成系统
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    田中尚志;葛山智久;高橋康弘
  • 通讯作者:
    高橋康弘
鉄硫黄クラスター生合成系の完全欠損変異株を用いたISCマシナリーの再検討
使用铁硫簇生物合成系统完全缺陷的突变菌株重新检查 ISC 机制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    田中尚志;金澤美秋;外崎敬太郎;葛山智久;高橋康弘
  • 通讯作者:
    高橋康弘
鉄硫黄クラスターの生合成を担うISCマシナリーの機能解析
负责铁硫簇生物合成的ISC机器的功能分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    田中尚志;葛山智久;高橋康弘
  • 通讯作者:
    高橋康弘
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

田中 尚志其他文献

ヒトF1-ATPaseの回転・制御機構
人F1-ATP酶的旋转和控制机制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    田中 尚志;和田 啓;福山 恵一;葛山 智久;高橋 康弘;鈴木俊治
  • 通讯作者:
    鈴木俊治
鉄硫黄クラスター生合成系に関与する大腸菌フェレドキシン(Fdx)の機能残基および機能領域の解析
大肠杆菌铁氧还蛋白(Fdx)参与铁硫簇生物合成系统的功能残基和功能区域分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    外崎 敬太郎;田中 尚志;金澤 美秋;高橋 康弘
  • 通讯作者:
    高橋 康弘
鉄硫黄クラスターの生合成におけるフェレドキシン(Fdx)の機能領域の解析
铁氧还蛋白(Fdx)在铁硫簇生物合成中的功能区域分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    外崎 敬太郎;田中 尚志;高橋 康弘
  • 通讯作者:
    高橋 康弘
SufBCD複合体への変異導入解析から見えてきた鉄硫黄クラスターの生合成機構
通过SufBCD复合物的突变引入分析揭示铁硫簇的生物合成机制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    湯田 瑛樹;田中 尚志;藤城 貴史;平林 佳;福山 恵一;和田 啓;高橋 康弘
  • 通讯作者:
    高橋 康弘
鉄硫黄クラスター生合成系の多様性:グラム陽性菌に見られるキメラ型生合成系の解析
铁硫簇生物合成系统的多样性:革兰氏阳性菌中嵌合生物合成系统的分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    横山 奈央;丸山 ちひろ;野中 ちひろ;田中 尚志;葛山 智久;朝井 計;高橋 康弘
  • 通讯作者:
    高橋 康弘

田中 尚志的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('田中 尚志', 18)}}的其他基金

ミトコンドリア機能が関与する分裂酵母の硫黄同化経路の解析とシステイン生産への応用
裂殖酵母中涉及线粒体功能的硫同化途径分析及其在半胱氨酸生产中的应用
  • 批准号:
    19K15728
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 1.41万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

相似海外基金

電子状態から読み解く鉄硫黄タンパク質の酸化還元反応
从电子态了解铁硫蛋白的氧化还原反应
  • 批准号:
    24K09351
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.41万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
高分解能X線および中性子線回折による高電位鉄硫黄タンパク質の酸化還元反応の理解
通过高分辨率 X 射线和中子衍射了解高电位铁硫蛋白的氧化还原反应
  • 批准号:
    20K22642
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 1.41万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
電子伝達機能をもつ鉄-硫黄タンパク質の電子状態-物性物理からのアプローチ-
具有电子传递功能的铁硫蛋白的电子态 - 凝聚态物理学的方法 -
  • 批准号:
    20654032
  • 财政年份:
    2008
  • 资助金额:
    $ 1.41万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
赤痢アメーバにおける鉄硫黄タンパク質の生合成機構の解明
阐明溶组织内阿米巴铁硫蛋白的生物合成机制
  • 批准号:
    16017307
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 1.41万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
原虫における鉄硫黄タンパク質の生合成機構の解明
阐明原生动物铁硫蛋白的生物合成机制
  • 批准号:
    15019120
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 1.41万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
原虫における鉄硫黄タンパク質の生合成機構の解明
阐明原生动物铁硫蛋白的生物合成机制
  • 批准号:
    14021134
  • 财政年份:
    2002
  • 资助金额:
    $ 1.41万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
シトクロムP450camと鉄-硫黄タンパク質の複合体
细胞色素 P450cam 和铁硫蛋白复合物
  • 批准号:
    11780452
  • 财政年份:
    1999
  • 资助金额:
    $ 1.41万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
鉄硫黄タンパク質の酸化還元電位制御機構の研究
铁硫蛋白氧化还原电位调控机制研究
  • 批准号:
    05209222
  • 财政年份:
    1993
  • 资助金额:
    $ 1.41万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
鉄硫黄タンパク質の酸化環元電位制御機構の研究
铁硫蛋白氧化环电位控制机制研究
  • 批准号:
    04225224
  • 财政年份:
    1992
  • 资助金额:
    $ 1.41万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
葉緑体DNAにコードされる未知の鉄・硫黄タンパク質の同定と生理機能の解析
叶绿体DNA编码的未知铁/硫蛋白的鉴定及其生理功能分析
  • 批准号:
    63740376
  • 财政年份:
    1988
  • 资助金额:
    $ 1.41万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了