Analyse zweier regulatorischer RNAs grampositiver Bakterien: SR1 aus dem Bacillus subtilis-Chromosom und RNAIII aus Plasmid pIP501
Analyse zweier regulatorischer RNAs grampositiver Bakterien: SR1 aus dem Bacillus subtilis-Chromosom und RNAIII aus Plasmid pIP501
批准号:
5434214
负责人:
Privatdozentin Dr. Sabine Brantl
金额:
$0.0万
依托单位:
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Grants
财政年份:
2004
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2003-12-31 至 2013-12-31
中文摘要
Kleine Nichtkodierende RNAs be Pro-and Eucaryoten rückten in den letzten 3 Jahren in den Blickpenkt der Aufmerksamkeit.麻省理工学院的计算机程序员在枯草杆菌-染色体互换的区域中收集了大量的RNA。北极星检测系统中的Bislang konnte eine Davon。Wir haben diese RNA,die in der slp-cadintergenischen Region kodiert ist,SRI(Small RNA1)genannt.Sr1(205个碱基)与北京地区的WachstumspaseexPrimiert站有关,而Jedoch则处于对数阶段。枯草杆菌和贝类约10个因子表达毒素。根据von 2DGelanalysen von ProteinExtrakten Aus Wildtyp-und SR1-Knokout Stämmen Hir 4 Potelle靶目标识别,以及所有的嘧啶酶DES Yrimidinstoffwechsel kodieren。Ein Target、UPP-mRNA、Konnte Bislang实验结果最佳。温度和底材的重量表示型材的厚度。反义RNA RNAIII(136个核苷酸)调节转导pIP501的基本RRmRNA和复制。在枯草芽孢杆菌中,这是一种新的抑制方法。1)SR1生物化学和Funktionell特征;2)靶标von SRI鉴定;3)表达调控von SR1 aufgekläRT;4)结合抑制因子Komplexes von RNAII/RNAIII aufgeklärt。
英文摘要
Kleine nichtkodierende RNAs bei Pro- und Eukaryoten rückten in den letzten 3 Jahren in den Blickpunkt der Aufmerksamkeit. Mit Hilfe von Computerprogrammen gelang es uns, eine Reihe nichtkodierender RNAs in intergenischen Regionen des B. subtilis-Chromosoms vorherzusagen. Bislang konnte eine davon in nachfolgenden Northernblot-Analysen detektiert werden. Wir haben diese RNA, die in der slp-cadintergenischen Region kodiert ist, SRI (small RNA1) genannt. SR1 (205 nt) wird beim Übergang in die stationäre Wachstumsphase exprimiert, nicht jedoch in der logPhase. SR1 ist nicht essentiell für B. subtilis und bei ca. 10facher Überexpression nicht toxisch. Auf der Basis von 2DGelanalysen von Proteinextrakten aus Wildtyp- und SR1-knockoutStämmen haben wir 4 potentielle Targets identifiziert, die alle für Enzyme des Pyrimidinstoffwechsels kodieren. Ein Target, upp-mRNA, konnte bislang experimentell bestätigt werden. SR1 weist ein interessantes temperatur- und substratabhängiges Expressionsprofil auf. Die Antisense-RNA RNAIII (136 nt) reguliert über Transkriptionsattenuierung der essentiellen repRmRNA die Replikation des Streptokokkenplasmides pIP501. Ihre Paarungs- und Inhibitionskonstanten, ihre intrazelluläre Konzentration und Halbwertszeit in B. subtilis wurden von uns bestimmt. Im Rahmen des geplanten Vorhabens sollen 1) SR1 biochemisch und funktionell charakterisiert, 2) weitere Targets von SRI identifiziert werden, 3) die Regulation der Expression von SR1 aufgeklärt und 4) der Bindungsweg und die Struktur des inhibitorischen Komplexes von RNAII/RNAIII aufgeklärt werden.
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会议论文
Identification and characterization of new sRNA/mRNA targets of CsrA in Bacillus subtilis
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批准号:435337256
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2019
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负责人:Privatdozentin Dr. Sabine Brantl
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依托单位:
Peptide encoding and dual-function sRNAs in Bacillus subtilis
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批准号:378886710
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项目类别:Priority Programmes
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2017
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负责人:Privatdozentin Dr. Sabine Brantl
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依托单位:
BsrE/SR5: a novel type I toxin-antitoxin system in Bacillus subtilis: Localization of the toxin and identification of its cellular target(s), mechanism(s) of antitoxin action, and biological functions of the system
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批准号:276973612
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2015
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负责人:Privatdozentin Dr. Sabine Brantl
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依托单位:
Characterization of trigger enzymes involved in the regulation and function of sRNAs in B. subtilis
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批准号:238802965
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2013
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负责人:Privatdozentin Dr. Sabine Brantl
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依托单位:
Elucidation of novel regulatory mechanisms employed by small noncoding RNAs from B. subtilis and identification of RNA chaperones involved in these mechanisms
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批准号:40035314
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项目类别:Priority Programmes
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2007
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负责人:Privatdozentin Dr. Sabine Brantl
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依托单位:
Biochemische Charakterisierung des pIP501-kodierten Transkriptionsrepressors CopR und Evolution des CopR-targets
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批准号:5114264
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:1998
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负责人:Privatdozentin Dr. Sabine Brantl
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依托单位:
Molekularbiologie
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批准号:5368758
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项目类别:Heisenberg Fellowships
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资助金额:$0.0万
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财政年份:1997
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负责人:Privatdozentin Dr. Sabine Brantl
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依托单位:
Zusammenspiel der inhibitorischen Komponenten RNAIII und CopR bei der Kontrolle der Kopiezahl des Plasmides pIP501. Einfluß von chromosomalen Komponenten auf die Regulation der Plasmidreplikation in grampositiven Bakterien
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批准号:5270736
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:1996
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负责人:Privatdozentin Dr. Sabine Brantl
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依托单位:
Role of small proteins and the moonlighting enzyme GapA in the degradosome-like network of Bacillus subtilis
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批准号:492739895
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:--
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负责人:Privatdozentin Dr. Sabine Brantl
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依托单位:
海外基金