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Analyse zweier regulatorischer RNAs grampositiver Bakterien: SR1 aus dem Bacillus subtilis-Chromosom und RNAIII aus Plasmid pIP501

Analyse zweier regulatorischer RNAs grampositiver Bakterien: SR1 aus dem Bacillus subtilis-Chromosom und RNAIII aus Plasmid pIP501
分析革兰氏阳性菌的两种调节 RNA:来自枯草芽孢杆菌染色体的 SR1 和来自质粒 pIP501 的 RNAIII
批准号:
5434214
负责人:
Privatdozentin Dr. Sabine Brantl
金额:
$0.0万
依托单位:
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Grants
财政年份:
2004
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2003-12-31 至 2013-12-31

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
[3] [j] [j] [j] [j] [j] [j] [j] [j]。研究了枯草芽孢杆菌-嗜酸梭菌染色体的基因间区差异rna。在nachfolgenden的Northernblot-Analysen检测器中,Bislang konterine davon。小RNA (small RNA1)基因在小RNA基因区(slp- cadgenischenregion)中死亡。SR1 (205nt) wind beim Übergang in die stationäre wachstumphase experiment, night jedoch in der logPhase。SR1 1 1夜基本细胞<s:1> r B.枯草芽孢杆菌和贝可10父亲Überexpression夜毒性。基于2DGelanalysen von Proteinextrakten aus wildtype - and SR1-knockoutStämmen haben wir 4 potential - elle靶标鉴定,die alle frelase des pyrimidinstofwechsels kodieren。in Target, upp-mRNA, konte - bislang实验细胞bestätigt werden。SR1在温度和substratabhängiges的相互作用下表达谱。反义rna RNAIII (136nt)调控<s:1> ber转录与转录的关系[3]研究枯草芽孢杆菌的抑菌及抑菌作用,研究intrazelluläre konzation和Halbwertszeit对枯草芽孢杆菌的影响。1) SR1生物化学与功能细胞特性研究;2)SR1靶点鉴定研究;3)SR1表达调控研究aufgeklärt; 4) RNAII/RNAIII复合物抑制研究与结构研究aufgeklärt研究。
英文摘要
Kleine nichtkodierende RNAs bei Pro- und Eukaryoten rückten in den letzten 3 Jahren in den Blickpunkt der Aufmerksamkeit. Mit Hilfe von Computerprogrammen gelang es uns, eine Reihe nichtkodierender RNAs in intergenischen Regionen des B. subtilis-Chromosoms vorherzusagen. Bislang konnte eine davon in nachfolgenden Northernblot-Analysen detektiert werden. Wir haben diese RNA, die in der slp-cadintergenischen Region kodiert ist, SRI (small RNA1) genannt. SR1 (205 nt) wird beim Übergang in die stationäre Wachstumsphase exprimiert, nicht jedoch in der logPhase. SR1 ist nicht essentiell für B. subtilis und bei ca. 10facher Überexpression nicht toxisch. Auf der Basis von 2DGelanalysen von Proteinextrakten aus Wildtyp- und SR1-knockoutStämmen haben wir 4 potentielle Targets identifiziert, die alle für Enzyme des Pyrimidinstoffwechsels kodieren. Ein Target, upp-mRNA, konnte bislang experimentell bestätigt werden. SR1 weist ein interessantes temperatur- und substratabhängiges Expressionsprofil auf. Die Antisense-RNA RNAIII (136 nt) reguliert über Transkriptionsattenuierung der essentiellen repRmRNA die Replikation des Streptokokkenplasmides pIP501. Ihre Paarungs- und Inhibitionskonstanten, ihre intrazelluläre Konzentration und Halbwertszeit in B. subtilis wurden von uns bestimmt. Im Rahmen des geplanten Vorhabens sollen 1) SR1 biochemisch und funktionell charakterisiert, 2) weitere Targets von SRI identifiziert werden, 3) die Regulation der Expression von SR1 aufgeklärt und 4) der Bindungsweg und die Struktur des inhibitorischen Komplexes von RNAII/RNAIII aufgeklärt werden.
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会议论文
Identification and characterization of new sRNA/mRNA targets of CsrA in Bacillus subtilis
  • 批准号:
    435337256
  • 项目类别:
    Research Grants
  • 资助金额:
    $0.0万
  • 财政年份:
    2019
  • 负责人:
    Privatdozentin Dr. Sabine Brantl
  • 依托单位:
Peptide encoding and dual-function sRNAs in Bacillus subtilis
  • 批准号:
    378886710
  • 项目类别:
    Priority Programmes
  • 资助金额:
    $0.0万
  • 财政年份:
    2017
  • 负责人:
    Privatdozentin Dr. Sabine Brantl
  • 依托单位:
BsrE/SR5: a novel type I toxin-antitoxin system in Bacillus subtilis: Localization of the toxin and identification of its cellular target(s), mechanism(s) of antitoxin action, and biological functions of the system
  • 批准号:
    276973612
  • 项目类别:
    Research Grants
  • 资助金额:
    $0.0万
  • 财政年份:
    2015
  • 负责人:
    Privatdozentin Dr. Sabine Brantl
  • 依托单位:
Characterization of trigger enzymes involved in the regulation and function of sRNAs in B. subtilis
  • 批准号:
    238802965
  • 项目类别:
    Research Grants
  • 资助金额:
    $0.0万
  • 财政年份:
    2013
  • 负责人:
    Privatdozentin Dr. Sabine Brantl
  • 依托单位:
海外基金