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Biochemische Charakterisierung des pIP501-kodierten Transkriptionsrepressors CopR und Evolution des CopR-targets

Biochemische Charakterisierung des pIP501-kodierten Transkriptionsrepressors CopR und Evolution des CopR-targets
pIP501 编码的转录阻遏蛋白 CopR 的生化特征和 CopR 靶标的进化
批准号:
5114264
负责人:
Privatdozentin Dr. Sabine Brantl
金额:
$0.0万
依托单位:
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Grants
财政年份:
1998
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
1997-12-31 至 2006-12-31

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
转录抑制子COPR(92aa,10.6kD)是链霉菌pIP501的转录调控基因。COPR和Esentiellen Repr-mRNA约10-20fach和von正义和反义RNA的转录本。COPR BINDINT ALS VOGERFORFORTS DIMER和ZWEI BINDOUND在DNA中的不对称结合。在B.subtilis Wurden bstimt中,Gleichgewichts dissolation skonstanten für die Copr-Dimere and den Copr-DNA-Komplex Sowie die inzelluläre Konzentation.Ein 3D-Strukturmodell der ersten 63 Aminosäuren von Copr wurde konstruciert and zur Lokalization des DNA-Bindungmoves/Identifizierung von Aminosäuren,die an der Spezifischen and unSpezifischen Erkennung der DNA Beteigt Sind,Sowie zur Grobeingrenzung der DimerisisierungsRegion verwendet t.蛋白水解酶的功能和功能。1)进化和目标2)表达机制;3)复制DNA和复制;3)复制运营者;4)复制的功能;4)复制的终端;5)复制的个体。
英文摘要
Der Transkriptionsrepressor CopR (92 aa, 10.6 kD) ist einer der beiden Regulatoren der Replikation des Streptokokkenplasmids pIP501. CopR reprimiert die Transkription der essentiellen repR-mRNA ca. 10-20fach und verhindert die konvergente Transkription von Sense- und Antisense-RNA. CopR bindet asymmetrisch als vorgeformtes Dimer an zwei Bindungsorten in der großen Furche der DNA. Die Gleichgewichtsdissoziationskonstanten für die CopR-Dimere und den CopR-DNA-Komplex sowie die intrazelluläre Konzentration in B. subtilis wurden bestimmt. Ein 3D-Strukturmodell der ersten 63 Aminosäuren von CopR wurde konstruiert und zur Lokalisation des DNA-Bindungsmotives/Identifizierung von Aminosäuren, die an der spezifischen und unspezifischen Erkennung der DNA beteiligt sind, sowie zur Grobeingrenzung der Dimerisierungsregion verwendet. Eine Funktion des CopR-C-Terminus ist der Schutz vor Proteolyse. Im Rahmen des geplanten Vorhabens sollen 1) die Evolution des CopR-`targets`mittels SELEX-Verfahren untersucht 2) der Repressionsmechanismus von CopR aufgeklärt, 3) die Konformationsveränderung von DNA und CopR bei Bindung von CopR an seinen Operator untersucht 4) weitere Funktionen des sauren C-Terminus von CopR aufgeklärt und 5) der individuelle Beitrag hydrophober Aminosäuren an der Dimerisierung von CopR bestimmt werden.
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会议论文
Identification and characterization of new sRNA/mRNA targets of CsrA in Bacillus subtilis
  • 批准号:
    435337256
  • 项目类别:
    Research Grants
  • 资助金额:
    $0.0万
  • 财政年份:
    2019
  • 负责人:
    Privatdozentin Dr. Sabine Brantl
  • 依托单位:
Peptide encoding and dual-function sRNAs in Bacillus subtilis
  • 批准号:
    378886710
  • 项目类别:
    Priority Programmes
  • 资助金额:
    $0.0万
  • 财政年份:
    2017
  • 负责人:
    Privatdozentin Dr. Sabine Brantl
  • 依托单位:
BsrE/SR5: a novel type I toxin-antitoxin system in Bacillus subtilis: Localization of the toxin and identification of its cellular target(s), mechanism(s) of antitoxin action, and biological functions of the system
  • 批准号:
    276973612
  • 项目类别:
    Research Grants
  • 资助金额:
    $0.0万
  • 财政年份:
    2015
  • 负责人:
    Privatdozentin Dr. Sabine Brantl
  • 依托单位:
Characterization of trigger enzymes involved in the regulation and function of sRNAs in B. subtilis
  • 批准号:
    238802965
  • 项目类别:
    Research Grants
  • 资助金额:
    $0.0万
  • 财政年份:
    2013
  • 负责人:
    Privatdozentin Dr. Sabine Brantl
  • 依托单位:
海外基金