小児急性脳症の網羅的メタボローム・マイクロＲＮＡ解析を用いたバイオマーカー探索

使用综合代谢组和 microRNA 分析进行儿科急性脑病生物标志物搜索

• 批准号: 15J40217
• 负责人: 鳥居 ゆか
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2015
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2015-04-24 至 2018-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15J40217/
• 关键词: 脳症; エクソソーム; マイクロRNA; ヒトヘルペスウイルス6型; メタボローム解析; キノリン酸; キヌレニン

HHV-6感染が証明された症例をAESD(Acute encephalopathy with biphasic seizures and late reduced diffusion)タイプの脳症と診断された症例と、痙攣重積を起こしたが、その後意識回復良好で脳症に至らなかった症例の2群にわけ、それぞれ脳脊髄液エクソソーム中のマイクロRNAの発現プロファイルの比較解析を行った。髄液よりmiRCURY exosome isolatiom kitを用いてエクソソームを分離後、miRCURY RNA Isolation Kit Cell and Plantを用いてRNA抽出を行った。抽出したRNAからNEB Next Multiplex Small RNA Library Prep Set for Illuminaを用いてマイクロRNAのライブラリを作成した。作成したライブラリをMiseqでシーケンスを行った。脳症5例、対症5例の計10サンプルの解析を行い、出力したデータからマイクロRNA発現量を標準化して(RPAM: reads per annotated reads per million)比較解析をした。結果、10症例においてのべ292種のマイクロRNAが検出された。比較解析の結果、FDR(False Discovery Rate)<0.05を満たすのはmiR-381-3pのみであった。mir-381-3pは脳症群で有意に検出された。ターゲット遺伝子予測サイト(miRanda, Target Scan, mirDB)を用いて検索したところ、mir-381-3pの標的となると予測された遺伝子にはGRM8など神経伝達に関わる遺伝子もあり、病態との関連が考えられた。今回は10症例の検討のみであったが、PCRでの解析システムを確立して、より多くの症例を解析する必要があると思われた。

HHV-6 infection was confirmed by AESD(Acute encephalopathy with biphasic seizures and late reduced diffusion). The diagnosis of AESD was confirmed by AESD (Acute encephalopathy with biphasic seizures and late reduced diffusion). The diagnosis of AESD was confirmed by AESD (Acute encephalopathy with biphasic seizures and late reduced diffusion). miRCURY exosome isolation kit is used to isolate miRCURY RNA from cells and plants. Next Multiplex Small RNA Library Prep Set for Illumina The first step is to make a decision. The analysis of 10 samples in 5 cases of disease and 5 cases of disease was carried out, and the output of RNA was standardized (RPAM: reads per annotated reads per million). Results: 292 kinds of RNA were detected in 10 cases. Compare the results of the analysis, FDR(False Discovery Rate)<0.05, miR-381- 3p and miR-381- 3p. mir-381- 3p is a syndrome group that is intentionally detected. MiRanda, Target Scan, mirDB) is used to detect the target of mir-381- 3p and GRM8 is used to detect the target of mir-381- 3p. This article reviews the diagnosis and treatment of 10 cases, and analyzes the diagnosis and treatment of 10 cases.

项目成果

Epstein-Barr virus infection-induced inflammasome activation in human monocytes.

• DOI: 10.1371/journal.pone.0175053
• 发表时间: 2017
• 期刊: PloS one
• 影响因子: 3.7
• 作者: Torii Y;Kawada JI;Murata T;Yoshiyama H;Kimura H;Ito Y
• 通讯作者: Ito Y

EBV関連腫瘍におけるトファシチニブの抗腫瘍効果の検討

托法替布在 EBV 相关肿瘤中的抗肿瘤作用研究

• 发表时间: 2015
• 作者: 安藤将太郎;川田潤一;鈴木道雄;渡辺崇広;鳥居ゆか;吉山裕規;清水則夫;木村宏;伊藤嘉規
• 通讯作者: 伊藤嘉規

先天性サイトメガロウイルス感染症に対するバルガンシクロビル治療効果の検討

缬更昔洛韦治疗先天性巨细胞病毒感染的疗效观察

• 发表时间: 2016
• 作者: 川田潤一;鳥居ゆか;安藤将太郎;鈴木高子;神谷泰子;小島勢二;伊藤嘉規;鳥居ゆか
• 通讯作者: 鳥居ゆか

次世代シーケンシングによる血流感染症の微生物ゲノム分布解析と臨床応用

利用新一代测序进行血流感染微生物基因组分布分析及临床应用

• 发表时间: 2017
• 作者: 堀場千尋;川田潤一;手塚宜行;武内俊;鈴木高子;安藤将太郎;神谷泰子;鳥居ゆか;伊藤嘉規
• 通讯作者: 伊藤嘉規

Inflammasome-mediated IL-1β production by Human Monocyte with primary EBV infection.

原发性 EBV 感染的人单核细胞产生炎症小体介导的 IL-1β。

• 发表时间: 2017
• 作者: Jun-ichi Kawada;Yuka Torii;Takayuki Murata;Hironori Yoshiyama;Hiroshi Kimura;Yoshihiro Ito
• 通讯作者: Yoshihiro Ito