エピジェネティック修飾の分子機構の解明
阐明表观遗传修饰的分子机制
基本信息
- 批准号:16J11369
- 负责人:
- 金额:$ 1.22万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2016
- 资助国家:日本
- 起止时间:2016-04-22 至 2018-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
昨年度は、メチルシトシンやヒドロキシメチルシトシンといったエピジェネティックなDNA修飾がヌクレオソーム構造に与える影響について、原子間力顕微鏡による測定で評価を行った。その結果、DNAのシトシンがメチル化されてメチルシトシンとなることでヌクレオソームの構造はより強固になり、さらにヒドロキシメチル化されることで、ヌクレオソーム構造は少し緩むということが明らかになった。この結果を踏まえ、今年度は、エピジェネティックなDNA修飾が転写反応に与える影響について、in vitro転写システムを用いて評価を行なった。始めに、CpG配列のシトシンをメチル化したDNAと、全てのシトシンをメチルシトシンあるいはヒドロキシメチルシトシンに置換したDNAを作成し、このDNAを用いてヌクレオソーム再構成を行なった。続いて、作成したヌクレオソーム、あるいはフリーのDNAを鋳型としてin vitro転写反応を行い、転写産物の量を定量PCRにより測定した。その結果、ヌクレオソーム再構成を行なっていないフリーのDNAではCpG配列をメチル化した場合に転写産物の量の減少が見られた。また、全てのシトシンをメチルシトシンあるいはヒドロキシメチルシトシンに置換した場合には、さらに転写産物の量が減少した。この理由としては、メチルシトシンにメチル化DNA結合タンパク質が結合して転写が抑制されたことの他に、シトシンがメチルシトシンあるいはヒドロキシメチルシトシンに置換されことによる立体的な障害により、転写因子のプロモーターへの結合、あるいは転写反応の進行が阻害されたためであると考えられる。ヌクレオソーム再構成を行なったDNAにおいても同様の転写産物量の減少の傾向が見られた。
In the past year, the evaluation of DNA modification and structure, atomic force microscopy and measurement was carried out. As a result, the DNA structure of the DNA molecule was transformed into a complex structure, and the structure of the DNA molecule was transformed into a complex structure. The results of this study are as follows: 1. DNA modification is the most common form of DNA modification in the world. The DNA sequence of CpG was transformed into DNA sequence, and the DNA sequence of CpG was transformed into DNA sequence. In the process of preparation, the amount of DNA was determined by quantitative PCR. As a result, the amount of CpG in DNA was reduced in the case of CpG recombination. In addition, the total number of products written in this paper is reduced. The reason for this is that the combination of DNA binding factors and the inhibition of DNA binding factors in different ways is that the combination of DNA binding factors and the inhibition of DNA binding factors in different ways is that the inhibition of DNA binding factors and the inhibition of DNA binding factors in different ways are not allowed. The tendency to decrease the amount of DNA products produced by the recombination of DNA and DNA was observed.
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Nucleosome Assembly Alters the Accessibility of the Antitumor Agent Duocarmycin B2 to Duplex DNA.
- DOI:10.1002/chem.201600950
- 发表时间:2016-06
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Tingting Zou;S. Kizaki;G. Pandian;H. Sugiyama
- 通讯作者:Tingting Zou;S. Kizaki;G. Pandian;H. Sugiyama
UVA irradiation of Br U-substituted DNA in the presence of Hoechst 33258
在 Hoechst 33258 存在下对 Br U 取代的 DNA 进行 UVA 照射
- DOI:10.1016/j.bmc.2017.11.011
- 发表时间:2018
- 期刊:
- 影响因子:3.5
- 作者:Saha Abhijit;Kizaki Seiichiro;Han Ji Hoon;Yu Zutao;Sugiyama Hiroshi
- 通讯作者:Sugiyama Hiroshi
Identification of Sequence Specificity of 5-Methylcytosine Oxidation by Tet1 Protein with High-Throughput Sequencing
- DOI:10.1002/cbic.201500646
- 发表时间:2016-03-01
- 期刊:
- 影响因子:3.2
- 作者:Kizaki, Seiichiro;Chandran, Anandhakumar;Sugiyama, Hiroshi
- 通讯作者:Sugiyama, Hiroshi
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木崎 誠一朗其他文献
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- DOI:
- 发表时间:
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- 影响因子:0
- 作者:
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杉山 弘
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