Analyses of the genetic basis for domestication using inbred strains of Xenopus tropicalis

利用热带爪蟾近交系驯化的遗传基础分析

• 批准号: 22K06318
• 负责人: 鈴木 誠
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Hiroshima University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K06318/
• 关键词: 従順性; ネッタイツメガエル; 家畜化; 近交系; QTL

本研究では、動物家畜化にも関わる従順性の普遍原理を理解することを目的とし、ネッタイツメガエル近交系で見いだされたストレス応答行動とその関連形質の系統間差の分子基盤を行動生理・遺伝学解析によって解明することを目指している。本年度は第一に、ネッタイツメガエルのストレス応答を定量的に評価するために生理学的手法の確立を目指した。当初はストレス刺激後に心臓から採取した血液からのストレスホルモン測定を試みた。しかし採取量が安定せず採取操作による個体への影響も懸念されたことから、スワブサンプリングにより採取した皮膚分泌物の測定へと計画を変更し引き続き条件検討を進めた。ストレス応答行動の系統間差への関与が示唆される遺伝子の一塩基多型の意義については、コードするタンパク質のドメイン解析からアミノ酸置換が膜貫通領域の末端近傍にあることを明らかにした。第二に、系統特異的な形質と関連する遺伝子座を同定するための行動解析手法の至適化とF2世代の作成を進めた。行動解析に関しては、行動差異の評価を高スループットで実施可能にするため、撮影画像データからのバックグラウンド除去およびモルフォロジー演算処理による個体輪郭の自動抽出法を開発し、加えて抽出輪郭の単純形状への近似によりストレス応答行動の定量を自動化した。F2世代を用いた解析についてはゲノムスキャン実施には至らなかったものの、性成熟していたF1世代を用いた交配により解析サンプルとして約300匹が得られた。

This study aims to understand the general principles of animal domestication, animal breeding, and inbred lines, and to clarify the physiological and genetic analysis of molecular basis for the interaction between systems. This year is the first year to establish a quantitative evaluation of physiological methods. The first time, the heart was stimulated, and the blood was taken. The amount of blood taken is stable, the individual's blood pressure is high, and the blood pressure is low. The relationship between the system difference of the response and the change of the expression, the change of the expression. Second, system-specific qualitative and quantitative analysis of genetic loci is carried out to optimize the generation of F2. The automatic extraction method of individual wheel in the calculation process of motion analysis, motion difference evaluation, high resolution, implementation possibility, image extraction, image removal, and motion analysis is developed, and the pure shape approximation of the extracted wheel is automatically quantified. The F2 generation is used to analyze and analyze the relationship between sex and maturity. The F1 generation is used to analyze and analyze the relationship between sex and maturity.

项目成果

NBRPツメガエル・イモリとツメガエルを用いたヒト疾患研究

使用 NBRP 非洲爪蟾和非洲爪蟾进行人类疾病研究

• 发表时间: 2022
• 作者: 鈴木 誠;井川 武;鈴木 菜花;加藤 陽菜子;欧 語詩;辻本 貴行;黒坂 寛;林 利憲;荻野 肇
• 通讯作者: 荻野 肇

ツメガエルにおけるCRISPR/Cas9と長鎖一本鎖DNAを用いた簡便な遺伝子ノックイン

使用 CRISPR/Cas9 和长单链 DNA 在非洲爪蟾中进行简单的基因敲入

• 发表时间: 2022
• 作者: 欧 語詩;鈴木 誠;成瀬 清;笹倉 靖徳;Paix Alexandre;荻野 肇
• 通讯作者: 荻野 肇

至適化されたツメガエル用のTet-Onシステムは神経特異的な遺伝子発現を誘導できる

优化的非洲爪蟾Tet-On系统可诱导神经元特异性基因表达

• 发表时间: 2022
• 作者: 吉田 真菜;川﨑 詩織;坂口 裕介;鈴木 菜花;鈴木 誠;荻野 肇
• 通讯作者: 荻野 肇

ツメガエルにおける至適Tet-On システムの開発

非洲爪蟾最佳 Tet-On 系统的开发

• 发表时间: 2022
• 作者: 吉田 真菜;川崎 詩織;坂口 裕介;鈴木 菜花;鈴木 誠;荻野 肇
• 通讯作者: 荻野 肇

EMBL Heidelberg(ドイツ)

EMBL海德堡（德国）