海浜環境への進出初期段階におけるアブラナ科野生植物ジャニンジンの適応進化

人参（一种十字花科野生植物）在进入沿海环境的早期阶段的适应性进化。

• 批准号: 22K06355
• 负责人: 岩崎 貴也
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Ochanomizu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K06355/
• 关键词: ゲノム; 野生植物; 海浜環境; アブラナ科; 適応進化

2022年度は、ロングリードシーケンスによる比較ゲノム解析と、ストレス条件下での栽培実験・遺伝子発現解析のための栽培環境の確立を目的としていた。まず、安定した栽培環境の確立では、ジャニンジンの海浜系統、林床系統の両方について、保存していた種子からの栽培を改めて行い、海浜系統が林床系統に比べて葉や茎が大型になること、海浜系統がロゼットを形成せず、春化処理無しに花芽を形成すること、林床系統の花成には4℃で2ヶ月の春化処理が必要であることなどを確認した。これらの結果は、本研究で着目している海浜系統と林床系統の違いが、可塑性によるものではなく、遺伝的に決まっていることを示唆している。また、比較ゲノム解析の前段階として、栽培系統が純粋な系統であることを確認するための系統判別マーカーの作成を行った。既に得られていた分布域全体でのMIG-seq解析のデータを再解析し、海浜型と林床型で明瞭に分化している領域を探索した。検出した2つの分化領域については栽培系統のDNAについてサンガーシーケンスを行い、現在の栽培系統が交雑系統でないことを確認した。さらにリアルタイムPCRによって簡易なジェノタイピングができるようにマーカー作成も進めている。最後に、純粋な系統であることが確認できた栽培2系統について、高分子ゲノムDNAの抽出に取り組んだ。市販のキットを用い、プロトコルをいくつか改変して試行錯誤することで、ロングリードシーケンスに適した十分な長さの高分子ゲノムDNAを得ることができた。

In 2022, we will compare the results of the analysis and analysis of the development of the culture and the establishment of the culture environment under the conditions of the environment. The establishment of stable cultivation environment, the preservation of seeds, the improvement of cultivation environment, the establishment of stable cultivation environment, the The results of this study are as follows: (1) the relationship between sea water system and forest bed system,(2) the relationship between plasticity and genetic decision, and (3) the relationship between water system and forest bed system. To compare the analysis of the previous stage, the cultivation system is pure, the system is confirmed, and the system is determined. The MIG-seq analysis of the whole distribution domain has been re-analyzed, and the sea and forest bed types have been clarified. 2. Identification of the DNA of the culture system and identification of the current culture system This is the first time I've ever seen a woman who's been in a relationship with someone else. Finally, the pure system is confirmed. The culture 2 system is confirmed. The polymer is extracted from the DNA. The market is full of people, and the market is full of people.