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ミスセンス変異体の安定性に注目したハイスループット機能評価系の開発

ミスセンス変異体の安定性に注目したハイスループット機能評価系の開発
开发关注错义突变体稳定性的高通量功能评估系统
批准号:
22K19488
负责人:
才津 浩智
金额:
$4.08万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2022-06-30 至 2024-03-31

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项目成果

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GFP融合ランダム変異体のハイスループット表現型スクリーニング1.ポジティブコントロールを用いたフローサイトメトリーの条件検討野生型のGFP-STXBP1を発現する発現ベクターと顕著な不安定性を有するGFP-STXBP1-Y84D変異体を発現するベクターを用いて、フローサイトメトリーで分取可能か条件検討を行った。別々にトランスフェクションし、その細胞を混ぜてフローサイトメトリーを行ったところ、内部発現コントロールのDsRedが陽性で、GFPが陰性である細胞(Y84D群)を明瞭に分取可能であった。しかしながら、2つのプラスミドを同時にトランスフェクションした場合、同一細胞に同時にトランスフェクションされるため、内部発現コントロールのDsRedが陽性で、GFPが陰性である細胞(Y84D群)が認められないという結果が得られた。この結果から、トランスフェクションは各クローン別々に行う必要があると考えられた。スループットを上げるために、各クローンのミニプレップは96サンプル処理が可能なキットを用いて行い、各クローンのGFP-STXBP1の発現量を評価後に、抽出したDNAを混合して配列決定を行うこととした。その際には、計画したショートリードとロングリードシークエンスの利点を生かした変異体の配列決定が可能である。2.変異体発現ベクターライブラリの作製計画通り、Diversify PCRランダム突然変異誘発キット(タカラバイオ)を用いてランダム変異導入を行った。どの程度の変異が入るかの確認を含めて、まず20クローンを単離し、このクローンをトランスフェクションしてGFP蛍光で安定性が評価できることを確認した。
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科研奖励(0)
会议论文
ゲノムの非コード領域に注目した小児脳神経疾患の新規発症機序の解明
  • 批准号:
    23K27566
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额:
    $7.32万
  • 财政年份:
    2024
  • 负责人:
    才津 浩智
  • 依托单位:
Elucidation of novel onset mechanisms of pediatric neurological disorders focusing on non-coding regions of the genome
  • 批准号:
    23H02875
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额:
    $12.06万
  • 财政年份:
    2023
  • 负责人:
    才津 浩智
  • 依托单位:
マウス胚神経管における葉酸受容体の発現調節機構およびその細胞系譜の解析
  • 批准号:
    18790141
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
  • 资助金额:
    $2.24万
  • 财政年份:
    2006
  • 负责人:
    才津 浩智
  • 依托单位:
海外基金