次世代シークエンス技術と機械学習を用いた、心房細動の精密化医療実現のための研究
利用新一代测序技术和机器学习实现房颤精准医疗的研究
基本信息
- 批准号:20J01343
- 负责人:
- 金额:$ 3.08万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2020
- 资助国家:日本
- 起止时间:2020-04-24 至 2023-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
今年度は昨年度までに実施した心房細動のゲノムワイド関連解析の結果を用いて、ゲノム以外のオミックスデータとの統合解析を実施し、さらに疾患予測のためのリスクスコアの構築を実施した。解析手法に関しては、論文等で示されている既存の方法を参照しつつ、さらに共同研究施設と結果の共有とディスカッションを行った。具体的には、公開されている遺伝子発現量のデータベースをもとに、トランスクリプトームワイド関連解析を行い、ゲノムワイド関連解析で得られたバリアントと遺伝子発現量の関連を調べた。その結果、炎症反応のシグナル伝達に関わる遺伝子を含む約130の遺伝子が心房細動との関連を認めた。さらに転写因子のChIP-seqデータとの統合解析では、転写因子であるエストロゲン関連受容体ガンマの結合部位が心房細動の疾患感受性領域に有意にエンリッチすることが示された。またリスクスコアに関しては、ゲノムワイド関連解析の結果を用いて、複数の導出方法から疾患予測において最も高性能な遺伝的リスクスコアを構築した。このスコアが疾患予測に加えて、心房細動の発症年齢や心房細動の合併症である心原性脳梗塞の予測に有用であり、さらに死亡データを含めた長期フォローアップデータを用いた生存解析でも、心血管疾患、特に脳梗塞による死亡の予測に有用であることが示された。本研究の内容に関して国内外での学会発表を通して多くの研究者から指摘をもらい、最終的にその結果は学術雑誌に掲載された。
This year, the results of the correlation analysis of atrial fibrillation were used to implement the integrated analysis of atrial fibrillation, and the construction of disease prediction was implemented. Analysis methods, papers, etc., show that existing methods are referenced, joint research is conducted, and results are shared Specifically, the correlation analysis of the data and the detection of the gene expression in the open media is carried out. The results of the study showed that there were about 130 genes associated with atrial fibrillation in the inflammatory response. The integrated analysis of ChIP-seq data of the writing factors indicates that the binding sites of the relevant receptors are intentional in the domain of atrial fibrillation and disease susceptibility. The results of correlation analysis are used to derive multiple methods from disease prediction to high-performance analysis. The prediction of cardiac infarction is useful in the analysis of cardiovascular disease and the prediction of cardiac infarction. The content of this study is related to the academic society at home and abroad, and many researchers have criticized it, and the final results are published in academic journals.
项目成果
期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Genome-wide Analysis Reveals Novel Mechanisms Underlying Atrial Fibrillation and the Clinical Utility of a Polygenic Predictor for Cardioembolic Risk
全基因组分析揭示了心房颤动的新机制以及心脏栓塞风险多基因预测因子的临床效用
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:K. Miyazawa;K. Ito;M. Ito;Z. Zou;M. Kubota;S. Nomura;H. Matsunaga;S. Koyama;H. Ieki;Y. Koike;M. Akiyama;R. Kurosawa;H. Yoshida;K. Ozaki;Y. Onouchi;A. Takahashi;K. Matsuda;Y. Murakami;H. Aburatani;M. Kubo;Y. Momozawa;C. Terao;S. Oki
- 通讯作者:S. Oki
Genome-wide Analysis Reveals Novel Mechanism Underlying Atrial Fibrillation by Multi-omics Approach and Provides a Polygenic Predictor for Cardioembolic Risk
全基因组分析通过多组学方法揭示心房颤动的新机制,并为心脏栓塞风险提供多基因预测因子
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Kazuo Miyazawa;Hiroki Yoshida;Ryo Kurosawa;Hirotaka Ieki;Satoshi Koyama;Kaoru Ito;Hiroshi Akazawa;Issei Komuro
- 通讯作者:Issei Komuro
Trans-ancestry genome-wide association study of atrial fibrillation identifies 35 new loci and provides a polygenic predictor for cardioembolic risk
心房颤动的跨祖先全基因组关联研究确定了 35 个新基因座,并提供了心脏栓塞风险的多基因预测因子
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Kazuo Miyazawa;Kaoru Ito;Zhaonan Zou;Hiroshi Matsunaga;Satoshi Koyama;Hirotaka Ieki ;Kouichi Ozaki;Yoshihiro Onouchi;Shinya Oki;Hiroshi Akazawa;Issei Komuro
- 通讯作者:Issei Komuro
Multi-omics analysis and polygenic risk stratification for pathophysiology and precision medicine in atrial fibrillation
房颤病理生理学和精准医学的多组学分析和多基因风险分层
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:宮澤 一雄;伊藤 薫;鄒 兆南;松永 紘;小山 智史;家城 博隆;尾崎 浩一;尾内 義広;沖 真弥;赤澤 宏;小室 一成
- 通讯作者:小室 一成
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- 发表时间:
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- 作者:
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