Exploration of chloroplast DNA repair mechanism with the cancer therapy
Exploration of chloroplast DNA repair mechanism with the cancer therapy
批准号:
22K19329
负责人:
西村 芳樹
金额:
$4.16万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2022-06-30 至 2025-03-31
中文摘要
葉緑体DNAは、光合成電子複合体の近傍に位置するため、常に活性酸素種などの遺伝毒性物質に曝露される。そのため迅速なDNA修復が不可欠なはずであるが、その分子機構の詳細は十分に理解されていない。研究の障害となってきたのは、植物細胞には3つの異なるゲノム(細胞核、ミトコンドリア、葉緑体)が混在する点である。本研究では、このなかで葉緑体ゲノムだけに二本鎖切断(Double strand break: DSB)を引き起こす手法の開発に取り組み、細胞の応答を解析することで、葉緑体DNA修復機構の時空間的理解を目指した。本研究で用いたのは、1980年代に動物細胞で用いられたUVA照射によるDSB誘導法である。BrdU標識したDNAをHoechst染色すると、通常は無害であるはずのUVA(365 nm)照射によって二本鎖切断が引き起こされる。本研究では単細胞緑藻クラミドモナスをモデルとして、FuUrd存在下で葉緑体DNAのみをBrdU標識することで、生きた細胞に対しUVA照射をすることで葉緑体DNA特異的なDSBを導入する方法の開発に取り組んだ(BrdU/UVA/hoechst-mediated pt/cpDNA scission: BUMPS法)。DSB検出法として用いたのは、アポトーシスにおけるDSB検出法としてしられるTUNEL法である。この手法により様々な処理条件でのDSBを解析したところ、UVC(254 nm)照射では蛍光顕微鏡下で細胞核と葉緑体核様体の両方にDSBが観察されたのに対し、BrdU/FrUrd/Hoechst処理細胞では葉緑体核様体のみDSBが検出された。さらにUVA照射5分後の葉緑体核様体では明瞭に観察されたDSBが、30分後には検出されなくなったことから、葉緑体DNA修復に要する時間が世界で初めて明らかになってきた。
英文摘要
葉緑体DNAは、光合成電子複合体の近傍に位置するため、常に活性酸素種などの遺伝毒性物質に曝露される。そのため迅速なDNA修復が不可欠なはずであるが、その分子機構の詳細は十分に理解されていない。研究の障害となってきたのは、植物細胞には3つの異なるゲノム(細胞核、ミトコンドリア、葉緑体)が混在する点である。本研究では、このなかで葉緑体ゲノムだけに二本鎖切断(Double strand break: DSB)を引き起こす手法の開発に取り組み、細胞の応答を解析することで、葉緑体DNA修復機構の時空間的理解を目指した。本研究で用いたのは、1980年代に動物細胞で用いられたUVA照射によるDSB誘導法である。BrdU標識したDNAをHoechst染色すると、通常は無害であるはずのUVA(365 nm)照射によって二本鎖切断が引き起こされる。本研究では単細胞緑藻クラミドモナスをモデルとして、FuUrd存在下で葉緑体DNAのみをBrdU標識することで、生きた細胞に対しUVA照射をすることで葉緑体DNA特異的なDSBを導入する方法の開発に取り組んだ(BrdU/UVA/hoechst-mediated pt/cpDNA scission: BUMPS法)。DSB検出法として用いたのは、アポトーシスにおけるDSB検出法としてしられるTUNEL法である。この手法により様々な処理条件でのDSBを解析したところ、UVC(254 nm)照射では蛍光顕微鏡下で細胞核と葉緑体核様体の両方にDSBが観察されたのに対し、BrdU/FrUrd/Hoechst処理細胞では葉緑体核様体のみDSBが検出された。さらにUVA照射5分後の葉緑体核様体では明瞭に観察されたDSBが、30分後には検出されなくなったことから、葉緑体DNA修復に要する時間が世界で初めて明らかになってきた。
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Exploring the role of chloroplast nucleoids in the maintenance of the pyrenoid, a phase-separated structure in chloroplasts
探索叶绿体核在维持核糖体(叶绿体中的相分离结构)中的作用
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kanazawa,H., Takusagawa,M., Kawashima, A., Shikanai, T. and Nishimura, Y.]
通讯作者:
Y.
Exploring the Role of Chloroplast Nucleoids in the Maintenance of Pyrenoid, a Phase-separated Structure
探索叶绿体核在维持相分离结构 Pyrenoid 中的作用
DOI:
--
发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kanazawa,H., Takusagawa,M., Kawashima, A., Shikanai, T. and Nishimura, Y.]
通讯作者:
Y.
Enzymes controlling the inheritance of chloroplast DNA.
控制叶绿体 DNA 遗传的酶。
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Nishimura, Y.]
通讯作者:
Y.
葉緑体 DNA 修復機構の時空間的理解に向けて
对叶绿体 DNA 修复机制的时空理解
DOI:
--
发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[川島愛音, 鹿内利治, 西村芳樹]
通讯作者:
西村芳樹
An Establishment of Novel Technique for cpDNA Specific DSBs Induction
cpDNA特异性DSB诱导新技术的建立
DOI:
--
发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[川島愛音, 鹿内利治, 西村芳樹]
通讯作者:
西村芳樹
共 12 条
Elucidation of the regulatory mechanism of chloroplast nucleoid with DNA supercoils as the core
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批准号:21H02504
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.15万
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财政年份:2021
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负责人:西村 芳樹
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依托单位:
母性遺伝の分子プログラム解読に挑む
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批准号:23687006
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
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资助金额:$4.74万
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财政年份:2011
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负责人:西村 芳樹
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依托单位:
単一細胞の顕微解析による細胞質遺伝機構の分子形態学的研究
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批准号:01J05096
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.73万
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财政年份:2001
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负责人:西村 芳樹
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依托单位:
顕微操作による細胞質遺伝の機構に関する分子形態学的研究
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批准号:98J05024
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.73万
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财政年份:1998
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负责人:西村 芳樹
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依托单位:
海外基金