NMRを用いた紫外線損傷DNA修復機構の構造生物学的解析
NMRを用いた紫外線損傷DNA修復機構の構造生物学的解析
批准号:
17012006
负责人:
寺沢 宏明
金额:
$5.7万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2005
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2005 至 --
中文摘要
生体に紫外線を照射すると、細胞内のDNAが損傷を受ける。損傷塩基は複製・転写時に変異を誘発し、細胞死やがん化の原因になる。生体には光を用いて紫外線損傷DNAを修復する酵素が存在する。その修復機構を解明し、修復効率を飛躍的に高めることが出来れば、損傷DNA治療によるがん化の予防という実用的な応用も可能となる。本研究は、代表的な紫外線損傷DNAであるシクロブタンピリミジンダイマー(CPD)の光修復酵素であるCPD-photolyaseによる認識・修復機構を原子レベルで解明し、さらに、高い修復効率を有する分子を創製すること、および、もう1つの代表的な光損傷DNAである(6-4)photoproductとその修復酵素である(6-4)photolyaseについても、認識・修復機構を明らかにすることを目的とする。2つの修復酵素を併用することにより、がん化の予防効果も相乗的に高まると考えられる。本年度は、CPD含有二本鎖DNA複合体構造決定を行うための、CPD含有長鎖二本鎖DNAの調製に成功した。また、高熱菌由来CPD photolyaseの精製法に改善を加えた結果、新たに第二補酵素を同定し、第二補酵素を着脱出来る条件を確立した。さらに、修復活性に対する第二補酵素の機能解析を進め、光アンテナとして効率の良い集光に寄与することを明らかにした。アフリカツメガエル由来(6-4)photolyaseについて、大腸菌を用いた発現系を数種類構築し、発現量の良好なものを得た。測定を行った結果、(6-4)photolyaseが立体構造を保持していることを示す、NMRシグナルの良好な分散が観測された。同時に、(6-4)photolyaseのC末端に存在する核移行シグナル領域がランダムな構造であることを明らかにした。これを除いた結果、NMRシグナルの強度を均一にすることが出来た。
英文摘要
生体に紫外線を照射すると、細胞内のDNAが損傷を受ける。損傷塩基は複製・転写時に変異を誘発し、細胞死やがん化の原因になる。生体には光を用いて紫外線損傷DNAを修復する酵素が存在する。その修復機構を解明し、修復効率を飛躍的に高めることが出来れば、損傷DNA治療によるがん化の予防という実用的な応用も可能となる。本研究は、代表的な紫外線損傷DNAであるシクロブタンピリミジンダイマー(CPD)の光修復酵素であるCPD-photolyaseによる認識・修復機構を原子レベルで解明し、さらに、高い修復効率を有する分子を創製すること、および、もう1つの代表的な光損傷DNAである(6-4)photoproductとその修復酵素である(6-4)photolyaseについても、認識・修復機構を明らかにすることを目的とする。2つの修復酵素を併用することにより、がん化の予防効果も相乗的に高まると考えられる。本年度は、CPD含有二本鎖DNA複合体構造決定を行うための、CPD含有長鎖二本鎖DNAの調製に成功した。また、高熱菌由来CPD photolyaseの精製法に改善を加えた結果、新たに第二補酵素を同定し、第二補酵素を着脱出来る条件を確立した。さらに、修復活性に対する第二補酵素の機能解析を進め、光アンテナとして効率の良い集光に寄与することを明らかにした。アフリカツメガエル由来(6-4)photolyaseについて、大腸菌を用いた発現系を数種類構築し、発現量の良好なものを得た。測定を行った結果、(6-4)photolyaseが立体構造を保持していることを示す、NMRシグナルの良好な分散が観測された。同時に、(6-4)photolyaseのC末端に存在する核移行シグナル領域がランダムな構造であることを明らかにした。これを除いた結果、NMRシグナルの強度を均一にすることが出来た。
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Backbone resonance assignments for the Fv fragment of catalytic antibody 6D9 complexed with a transition state analogue
与过渡态类似物复合的催化抗体 6D9 的 Fv 片段的主链共振分配
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
Journal of Biomolecular NMR 33
影响因子:
--
作者:
[Mugishima, M.Tsuda, M.et al., M.Kitajima, S.Horie, H.Takayama, K.Matsumoto, K.Matsumoto, Masayoshi Sakakura, Masayoshi Sakakura]
通讯作者:
Masayoshi Sakakura
Direct determination of interface between membrane and peptide using NMR cross-saturation method
使用 NMR 交叉饱和法直接测定膜和肽之间的界面
DOI:
--
发表时间:
期刊:
Biophys.J. (in press)
影响因子:
--
作者:
[T.Nakamura, I.Shimada 他]
通讯作者:
I.Shimada 他
DOI:
10.1074/jbc.m507972200
发表时间:
2005-10-28
期刊:
JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
影响因子:
4.8
作者:
[Ueda, T, Kato, A, Shimada, I]
通讯作者:
Shimada, I
An NMR method for the determination of protein-binding interfaces using dioxygen-induced spin-lattice relaxation enhancement.
一种使用分子氧诱导的自旋晶格弛豫增强来确定蛋白质结合界面的 NMR 方法。
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
J.Biol.Chem. 280・43
影响因子:
--
作者:
[Aravin, A.(7名), Kuramochi-Miyagawa, S., Nakano, T.(6), Tuschl,T, Addy C., Takeuchi K., Yokogawa M, Nakasako M, Ueda T]
通讯作者:
Ueda T
Conformational dynamics of complementary determining region H3 of an anti-dansyl Fv fragment in the presence of its hapten
半抗原存在下抗丹磺酰 Fv 片段的互补决定区 H3 的构象动力学
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
Journal of Molecular Biology 351
影响因子:
--
作者:
[M.Nakasako, Toshihiko Oka, M.Mashumo, H.Takahashi, I.Shimada, Y.Yamaguchi, K.Kato, Y.Arata]
通讯作者:
Y.Arata
共 6 条
機能性システインの化学修飾に基づく新規作用機序の炎症制御化合物の開発
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批准号:23K27315
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$7.82万
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财政年份:2024
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负责人:寺沢 宏明
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依托单位:
機能性システインの化学修飾に基づく新規作用機序の炎症制御化合物の開発
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批准号:23H02624
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.98万
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财政年份:2023
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负责人:寺沢 宏明
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依托单位:
DfMRIに基づく匂い応答の脳活性化パターン解析:嗅覚障害の改善に向けて
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批准号:22K19938
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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资助金额:$4.16万
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财政年份:2022
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负责人:寺沢 宏明
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依托单位:
マウスフェロモンファミリーとG蛋白質共役受容体の相互作用ネットワークに関する研究
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批准号:19036022
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.03万
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财政年份:2007
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负责人:寺沢 宏明
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依托单位:
NMRを用いた紫外線損傷DNA修復機構の構造生物学的解析
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批准号:18011001
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$7.62万
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财政年份:2006
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负责人:寺沢 宏明
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依托单位:
CD44の糖鎖認識とシグナル伝達制御に関する構造生物学的研究
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批准号:17046003
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.33万
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财政年份:2005
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负责人:寺沢 宏明
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依托单位:
HIV感染機構の解明:ケモカイン受容体・リガンド相互作用の構造生物学的研究
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批准号:16017223
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$6.91万
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财政年份:2004
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负责人:寺沢 宏明
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依托单位:
NMRによるCD44‐プロテオグリカン複合体の相互作用解析
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批准号:15040205
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.11万
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财政年份:2003
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负责人:寺沢 宏明
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依托单位:
リン脂質を認識するタンパク質の脂質二重膜における配向に関する構造生物学的研究
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批准号:15013218
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.94万
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财政年份:2003
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负责人:寺沢 宏明
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依托单位:
NMRによる原子レベルでの分子間相互作用スクリーニング法の開発
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批准号:14657569
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.98万
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财政年份:2002
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负责人:寺沢 宏明
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依托单位:
PCモチーフを含むタンパク質の特異的認識の解析
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批准号:12034221
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$0.77万
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财政年份:2000
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负责人:寺沢 宏明
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依托单位:
構造生物学に基づく食細胞NADPH酸化酵素系のSH3を中心とする制御機構の解明
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批准号:10780375
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1998
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负责人:寺沢 宏明
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依托单位:
海外基金