Ni-Fe金属中心の構造化学的研究
Ni-Fe金属中心の構造化学的研究
批准号:
10129214
负责人:
樋口 芳樹
金额:
$1.02万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份:
1998
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1998 至 --
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英文摘要
酵素学的アプローチ ヒドロゲナーゼの活性化(すなわち水素還元)により,(SO,CO,CN,S/SH)の4本の非タンパク質配位子が大きな構造変化を起こすことを予想し,それを,特定する実験を行った.その結果,水素でヒドロゲナーゼを活性化すると,H_2Sが.発生することを見出した.これは活性部位の非タンパク質配位子が水素還元によりH_2Sとして遊離したことと,更に,活性中心の配位子のうち少なくともひとつはH_2Sとして遊離するイオウの化合物であることを伺わせる結果であった.還元型超高分解能結晶構造解析 上記還元反応の生成物(H_2S)が活性部位から遊離した配位子であることを証明するために,ヒドロゲナーゼの水素還元型結晶の低温超高分解能構造解析を試みた.還元型結晶の1.4Åの超高分解能の電子密度図を計算したところ,NiとFeをブリッジしていた単原子配位子が水素還元により活性部位から消えることが分かった.これは,上の酵素化学的データと合わせて,この単原子配位子がイオウの化合物であり,水素還元によって遊離されたことを強く裏付ける結果である.実際,この活性部位のブリッジ配位子以外に還元による大きな構造変化はなかった.活性化で消失するブリッジイオウ配位子は,ごの酵素が不活性な状態の時,これらの金属中心(FeとNi)に余計な配位子が入り込まないようにキャップとしてブロックする機能を持つという新しい説を提案することができた.
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M.Kataoka,Y.Higuchi et al.: "Crystallization and preliminary X-ray diffraction study of lactonohydrolase from Fusarium oxysporum" Acta Crystallogr.D54. 1432-1434 (1998)
M.Kataoka,Y.Higuchi 等人:“尖镰孢内酯水解酶的结晶和初步 X 射线衍射研究”Acta Crystallogr.D54。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
S.Misaki,Y.Higuchi et al.: "Structure Determination of Rubredoxin from Desulfovibrio vulgaris Miyazaki F in Two Crystal Forms" Acta Crystallogr.D55. 408-413 (1999)
S.Misaki,Y.Higuchi 等人:“来自 Desulfovibrio vulgaris Miyazaki F 的两种晶体形式的红氧还蛋白的结构测定”Acta Crystallogr.D55。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Y.Higuchi et al.: "Removal of bridging ligand atom at the Ni-Fe active site of hydrogenase upon reduction with H_2,as revealed by X-ray structure analysis at 1.4Å resolution" Structure. (in press). (1999)
Y. Higuchi 等人:“用 H_2 还原时去除氢化酶的 Ni-Fe 活性位点上的桥接配体原子,如 1.4Å 分辨率的 X 射线结构分析所揭示的”结构(1999 年出版)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
K.Suto,Y.Higuchi et al.: "Crystallization and preliminary crystallographic studies of FMN-binding protein from Desulfovibrio vulgaris Miyazaki F" Acta Crystallogr.(in press). (1999)
K.Suto,Y.Higuchi 等人:“来自 Desulfovibrio vulgaris Miyazaki F 的 FMN 结合蛋白的结晶和初步晶体学研究”Acta Crystallogr.(印刷中)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Y.Higuchi,T.Yagi: "Liberation of hydrogen sulfide during the catalytic action of Desulfovibrio hydrogenase under the atmosphere of hydrogen" Biochem.Biophys.Res.Commun. (in press). (1999)
Y.Higuchi、T.Yagi:“脱硫弧菌氢化酶在氢气氛下催化作用期间释放硫化氢”Biochem.Biophys.Res.Commun。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 6 条
Structural basis of reaction mechanism and proton pathway of [NiFe]-hydrogenase
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批准号:19H00984
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$29.04万
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财政年份:2019
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负责人:樋口 芳樹
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依托单位:
動的・準動的X線結晶解析法による蛋白質間相互作用の研究
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批准号:13014210
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.02万
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财政年份:2001
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负责人:樋口 芳樹
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依托单位:
動的・準動的結晶解析法による蛋白質間相互作用の研究
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批准号:12034212
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.02万
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财政年份:2000
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负责人:樋口 芳樹
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依托单位:
Ni-Fe金属中心の構造化学的研究
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批准号:11116214
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$0.96万
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财政年份:1999
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负责人:樋口 芳樹
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依托单位:
16ヘム・タンパク質の結晶構造化学
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批准号:08249218
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.47万
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财政年份:1996
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负责人:樋口 芳樹
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依托单位:
ニッケル酵素・ヒドロゲナーゼの構造化学的研究
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批准号:07680727
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1995
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负责人:樋口 芳樹
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依托单位:
タンパク質結晶内の部分的な結晶性の乱れと結晶成長との関係についての研究
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批准号:02858016
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1990
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负责人:樋口 芳樹
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依托单位:
ヒト上皮細胞成長因子の構造化学的研究
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批准号:01780209
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1989
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负责人:樋口 芳樹
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依托单位:
ヒト上皮細胞成長因子のX線結晶構造解析
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批准号:63780338
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1988
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负责人:樋口 芳樹
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依托单位:
硫酸還元菌の水素酸化還元酵素・ヒドロゲナーゼの構造学的研究
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批准号:62780073
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1987
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负责人:樋口 芳樹
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依托单位: