16ヘム・タンパク質の結晶構造化学

16 血红素蛋白质晶体结构化学

• 批准号: 08249218
• 负责人: 樋口 芳樹
• 金额: $ 1.47万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1996
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1996 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-08249218/
• 关键词: 16ヘムタンパク質; X線結晶解析; 硫酸還元菌; チトクロムC3

硫酸還元菌の持つ高分子量チトクロムは16個のc型ヘムを持つと考えられている,分子量67KDaの可溶性タンパク質である。一次構造からその立体構造は4ヘム・チトクロムc3の部分構造3つと1ヘムチトクロムc‐553の部分構造1つから構成されていると予想でき,遺伝子重複により進化的に発生したタンパク質とも考えられている。16個もの酸化還元中心を持つことから,硫酸還元菌内のさまざまな酵素間の電子伝達体として働くと考えられ,その機能も注目に値する。本研究ではD.vulgaris Miyazaki F株から抽出した高分子量チトクロムの結晶のX線回折の分解能をさらに上げるために結晶化の条件検索をした。既に得られていた条件(クエン酸緩衝溶液,pH5.6,20%2‐プロパノール,20%PEG4000)で析出した微結晶(0.01mm)をカコジル酸緩衝溶液中でPEG4000を沈殿剤としたタンパク質溶液にシ-ディングしたところ,2週間で,0.8×0.4×0.1mmの結晶が析出した。この結晶を高エネルギー物理学研究所の放射光施設の巨大分子用ワイセンベルグカメラを用いて回折実験を試みた。その結果,空間群を特定することができ,3.8A分解能のネイティブ結晶の回折データを収集することができた。この新しい結晶は斜方晶系に属し,空間群はP2l2l2l,各格子定数はa=89.8,b=129.1,c=61.6Aであった。現在重原子誘導体結晶の調整を進めている。

Sulfuric acid bacteria hold 16 strains of high molecular weight and type c, and the molecular weight of 67KDa is soluble. In one step, the three-dimensional system was built, and the third part was made. The third part, the second part, the third part, the second part, the third part, the Sixteen acidizing centers were used to carry out laboratory tests, which were carried out in sulfuric acid bacteria. The laboratory tests were conducted between the enzymes in the sulfuric acid bacteria, and the machines were able to pay close attention to them. In this study, the extraction of high molecular weight D.vulgaris Miyazaki F strain X-ray diffraction X-ray back-folding decomposition can be used to determine the conditions for the crystallization of high molecular weight samples. The condition (pH5.6,20%2- acid solution, 20%PEG4000) for the precipitation of PEG4000 in the acid solution (0.01mm) and the precipitation temperature of the 0.1mm solution was obtained. The results show that the radiation construction of the Institute of Physics uses giant molecules. The results show that the empty group has a specific temperature response, and the 3.8A decomposition can analyze the results of the data collection. The results show that the rhombohedral crystal system belongs to the rhombohedral system, the empty group is P2l2l2l, and each lattice has a fixed number of rhombohedral crystals 89.8, 129.1, and 61.6 A, respectively. At present, the crystal structure of heavy atomic alloys is in the process of aging.

项目成果

Yoshiki Higuchi et al: "“Concerted movement of side chains in the haem vicinity observed on ligand binding in cytochromec' from Rhodobacter capsulatus"" Nature Structural Biology. vol 3 no5. 459‐464 (1996)

Yoshiki Higuchi 等人：““在荚膜红杆菌细胞色素中的配体结合中观察到血红素附近侧链的协同运动””《自然结构生物学》，第 3 卷第 5 卷，459-464（1996 年）

Yoshiki Higuchi et al: "“Crystallization and Preliminary X ray study of a new crystal form of cytochromec' from Rhodobacter capsulatus"" Acta Crystallogr.D52. 199‐200 (1996)

Yoshiki Higuchi 等人：“来自荚膜红杆菌的细胞色素新晶型的结晶和初步 X 射线研究”Acta Crystallogr.D52.199‐200 (1996)

Yoshiki Higuchi et al: "“High resolution Crystal Structures of Two Polymorphs of Cvtochromec' from Purple Phototrophic Bacterium,Rhodobacter capsulatus"" J.Mol.Biol. 259. 467‐479 (1996)

Yoshiki Higuchi 等人：“来自紫色光养细菌、荚膜红细菌的两种 Cvtochromec 多晶型物的高分辨率晶体结构”，J.Mol.Biol. 259. 467-479 (1996)

Yoshiki Higuchi et al: ""The Heterogeneity in a Protein Crystal Revealed by Synchrotron Radiation"" J. Crstal Growth. 168. 99‐105 (1996)

Yoshiki Higuchi 等人：“同步辐射揭示的蛋白质晶体的异质性”J. Cristal Growth。168. 99‐105 (1996)

Yoshiki Higuchi et al: "“Single crystal EPR study of the Ni center of NiFe hydrogenase"" Chemical Physics Letters. 256. 518‐524 (1996)

Yoshiki Higuchi 等人：“NiFe 氢化酶 Ni 中心的单晶 EPR 研究””《化学物理快报》256. 518-524 (1996)。