内在性受容体の特異的on cellケミカルラベリングと時空間的機能解析

内源性受体的特异性细胞化学标记和时空功能分析

基本信息

  • 批准号:
    13J04988
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.3万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2013
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2013-04-01 至 2016-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

Zn(II)に応答性を有するラベル化剤を開発し、Zn(II)条件的なproteomicsを考案し、実証した。Zn(II)イオンは細胞内外でシグナル伝達物質として働ことが示唆されており、動的に局在が変化する。Zn(II)シグナル伝達に関わる蛋白質を調べる手法は従来、総括的な解析ではなかった。申請者は、Zn(II)シグナル伝達に関わるタンパク質を総括的に調べる手法として、ケミカルラベル化を応用した新しい”conditional プロテオミクス”を開発した。これは、有機化学的手法によって、生細胞中の高濃度Zn(II)環境下に存在している蛋白質を選択的にラベル化する。ラベル化蛋白質を細胞破砕後に精製し、LC-MS/MS解析によって同定する方法である。まず、申請者はZn(II)との結合によって反応が活性化するラベル化剤”AIZin”を開発した。これは、蛋白質のラベル化に有用な求電子反応基Acyl Imidazole にdipicolylamine を連結した分子である。ルイス酸性の強いZn(II)の配位により、アシル転移反応の脱離基であるImidazoleの電子密度が低下することで、活性化し、蛋白質表面上の求核性アミノ酸残基と反応をする。C6細胞に対して一酸化窒素(NO)刺激を加えると、一時的に細胞内のZn(II)濃度が急激に上昇し、未知なvesicleに貯蔵される。AIZinラベル化剤をC6細胞に投与すると、NO刺激後に多数の蛋白質がラベル化された。ラベル化蛋白質を免疫沈降法によって精製し、トリプシンでpeptide断片化、LC-MS/MS解析を行った。その結果、未知なzinc-rich vesicleに存在する蛋白質を同定することができた。
开发了对锌(II)的响应的标记剂,并设计和证明了锌(II)条件蛋白质组学。已经提出锌离子在细胞内外充当信号传感器,它们的定位动态变化。以前,一种检查参与Zn(II)信号传导的蛋白质的方法不是全面的分析。申请人开发了一种新的“条件蛋白质组学”,该蛋白质组学将化学标记应用于一种全面检查涉及Zn(II)信号传导的蛋白质的方法。通过有机化学技术,这有选择地将活细胞中的Zn(II)环境高浓度标记。该方法涉及在细胞中断后纯化标记的蛋白质,并通过LC-MS/MS分析识别它。首先,申请人开发了标记剂“ Aizin”,该标记剂与Zn(II)结合时激活反应。这是将二吡咯胺与亲电基团酰基咪唑联系起来的分子,该酰基咪唑可用于标记蛋白质。路易斯酸性锌(II)的配位降低了咪唑的电子密度,咪唑的电子密度,酰基转移反应的离开组,并被激活并与蛋白质表面上的亲核氨基酸残基反应。对C6细胞的一氧化氮(NO)刺激暂时增加细胞中锌(II)的浓度,并存储在未知的囊泡中。在没有刺激后,给予AIZIN标记剂对C6细胞的施用导致了许多蛋白质的标记。通过免疫沉淀纯化了标记的蛋白质,然后用​​胰蛋白酶胡椒进行纯化,并进行了LC-MS/MS分析。结果,鉴定出富含锌的囊泡中存在的蛋白质。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
LDAI化学による内在性CAI2のmulti-color pulse chase imging
通过 LDAI 化学对内源性 CAI2 进行多色脉冲追踪成像
  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    三木 卓幸;藤島 祥平;浜地 格
  • 通讯作者:
    浜地 格
LDAI化学による内在性膜蛋白質のケミカルラベル化とpulse chase解析
使用 LDAI 化学和脉冲追踪分析对完整膜蛋白进行化学标记
  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    三木 卓幸;藤島 祥平;浜地 格
  • 通讯作者:
    浜地 格
LDAI化学による蛋白質ラベリング(1)膜蛋白質のpulse chase解析法への展開
使用LDAI化学进行蛋白质标记 (1) 膜蛋白脉冲追踪分析方法的开发
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    三木 卓幸;藤島 祥平;浜地 格
  • 通讯作者:
    浜地 格
A novel conditional protein labeling method(1):Zinc ion responsive focused proteome analysis in live cell
一种新型条件蛋白质标记方法(1):活细胞中锌离子响应聚焦蛋白质组分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    三木 卓幸;阿波 諒;清中 茂樹;浜地 格
  • 通讯作者:
    浜地 格
Zn応答性ラベル化剤を用いたconditionalプロテオミクス
使用锌响应标记剂的条件蛋白质组学
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    三木卓幸;阿波諒;清中茂樹;浜地格
  • 通讯作者:
    浜地格
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三木 卓幸其他文献

細胞内で液-液相分離を作る設計ペプチドの開発
开发可在细胞内产生液-液相分离的工程肽
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Hiroki Takahashi;Takayuki Miki;Masahiro Hashimoto and Hisakazu Mihara;Takayuki Miki;橋本 匡浩・三木 卓幸・中井 太一・丹羽 達也・三原久和;三木 卓幸・高橋 広樹・橋本 匡浩・梶原 圭悟・中山 彩恵・三原久和;三木 卓幸
  • 通讯作者:
    三木 卓幸
Development of self-assembling peptide tag for intracellular reconstitution of protein assembly
开发用于细胞内蛋白质组装重建的自组装肽标签
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Miki Takayuki;Hashimoto Masahiro;Nakai Taichi;Mihara Hisakazu;三木 卓幸;橋本 匡浩・三木 卓幸・高橋 広樹・中山 彩恵・三原久和;Takayuki Miki
  • 通讯作者:
    Takayuki Miki
ペプチドを基軸とした細胞内蛋白質の検出・操作技術の開発
基于肽的细胞内蛋白检测与操作技术的发展
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Miki Takayuki;Hashimoto Masahiro;Nakai Taichi;Mihara Hisakazu;三木 卓幸;橋本 匡浩・三木 卓幸・高橋 広樹・中山 彩恵・三原久和;Takayuki Miki;三木 卓幸;三木 卓幸・橋本 匡浩・中井 太一・梶原 圭悟・高橋 広樹・中山 彩恵・三原久和;三木 卓幸・橋本 匡浩・高橋 広樹・中山 彩恵・三原久和;三木 卓幸
  • 通讯作者:
    三木 卓幸
Design of self-assembling peptide tags for protein-based supramolecular construction in living cells
用于活细胞中基于蛋白质的超分子构建的自组装肽标签的设计
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Miki Takayuki;Hashimoto Masahiro;Nakai Taichi;Mihara Hisakazu;三木 卓幸;橋本 匡浩・三木 卓幸・高橋 広樹・中山 彩恵・三原久和;Takayuki Miki;三木 卓幸;三木 卓幸・橋本 匡浩・中井 太一・梶原 圭悟・高橋 広樹・中山 彩恵・三原久和;三木 卓幸・橋本 匡浩・高橋 広樹・中山 彩恵・三原久和;三木 卓幸;Takayuki Miki・Masahiro Hashimoto・Hiroki Takahashi・Sae Nakayama・Hisakazu Mihara
  • 通讯作者:
    Takayuki Miki・Masahiro Hashimoto・Hiroki Takahashi・Sae Nakayama・Hisakazu Mihara
De novoペプチド間の自己集合と蛋白質間相互作用の協奏による細胞内での液滴形成
通过从头肽自组装和蛋白质-蛋白质相互作用形成细胞内液滴
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Miki Takayuki;Hashimoto Masahiro;Nakai Taichi;Mihara Hisakazu;三木 卓幸;橋本 匡浩・三木 卓幸・高橋 広樹・中山 彩恵・三原久和;Takayuki Miki;三木 卓幸;三木 卓幸・橋本 匡浩・中井 太一・梶原 圭悟・高橋 広樹・中山 彩恵・三原久和;三木 卓幸・橋本 匡浩・高橋 広樹・中山 彩恵・三原久和;三木 卓幸;Takayuki Miki・Masahiro Hashimoto・Hiroki Takahashi・Sae Nakayama・Hisakazu Mihara;Takayuki Miki;Takayuki Miki;中山 彩恵・三木 卓幸・橋本 匡浩・高橋 広樹・梶原 圭悟・三原久和
  • 通讯作者:
    中山 彩恵・三木 卓幸・橋本 匡浩・高橋 広樹・梶原 圭悟・三原久和

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    Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

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Mapping synaptic cleft proteomes by photoactivated proximity labeling
通过光激活邻近标记绘制突触裂隙蛋白质组
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    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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开发通过专门针对循环肿瘤细胞表面的蛋白质组学寻找新抗体靶点的技术
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    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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响应ROS的标记分子的设计及其在条件蛋白质组学中的应用
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  • 财政年份:
    2017
  • 资助金额:
    $ 2.3万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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疾病特异性表面蛋白新型纯化技术的开发和示范
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  • 财政年份:
    2016
  • 资助金额:
    $ 2.3万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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开发活细胞膜中的综合脂质标记技术和脂质分析
  • 批准号:
    14J04745
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 2.3万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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知道了