内在性受容体の特異的on cellケミカルラベリングと時空間的機能解析
内在性受容体の特異的on cellケミカルラベリングと時空間的機能解析
批准号:
13J04988
负责人:
三木 卓幸
金额:
$2.3万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2013
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2013-04-01 至 2016-03-31
中文摘要
Zn(II)に応答性を有するラベル化剤を開発し、Zn(II)条件的なproteomicsを考案し、実証した。Zn(II)イオンは細胞内外でシグナル伝達物質として働ことが示唆されており、動的に局在が変化する。Zn(II)シグナル伝達に関わる蛋白質を調べる手法は従来、総括的な解析ではなかった。申請者は、Zn(II)シグナル伝達に関わるタンパク質を総括的に調べる手法として、ケミカルラベル化を応用した新しい”conditional プロテオミクス”を開発した。これは、有機化学的手法によって、生細胞中の高濃度Zn(II)環境下に存在している蛋白質を選択的にラベル化する。ラベル化蛋白質を細胞破砕後に精製し、LC-MS/MS解析によって同定する方法である。まず、申請者はZn(II)との結合によって反応が活性化するラベル化剤”AIZin”を開発した。これは、蛋白質のラベル化に有用な求電子反応基Acyl Imidazole にdipicolylamine を連結した分子である。ルイス酸性の強いZn(II)の配位により、アシル転移反応の脱離基であるImidazoleの電子密度が低下することで、活性化し、蛋白質表面上の求核性アミノ酸残基と反応をする。C6細胞に対して一酸化窒素(NO)刺激を加えると、一時的に細胞内のZn(II)濃度が急激に上昇し、未知なvesicleに貯蔵される。AIZinラベル化剤をC6細胞に投与すると、NO刺激後に多数の蛋白質がラベル化された。ラベル化蛋白質を免疫沈降法によって精製し、トリプシンでpeptide断片化、LC-MS/MS解析を行った。その結果、未知なzinc-rich vesicleに存在する蛋白質を同定することができた。
英文摘要
Zn(II)に応答性を有するラベル化剤を開発し、Zn(II)条件的なproteomicsを考案し、実証した。Zn(II)イオンは細胞内外でシグナル伝達物質として働ことが示唆されており、動的に局在が変化する。Zn(II)シグナル伝達に関わる蛋白質を調べる手法は従来、総括的な解析ではなかった。申請者は、Zn(II)シグナル伝達に関わるタンパク質を総括的に調べる手法として、ケミカルラベル化を応用した新しい”conditional プロテオミクス”を開発した。これは、有機化学的手法によって、生細胞中の高濃度Zn(II)環境下に存在している蛋白質を選択的にラベル化する。ラベル化蛋白質を細胞破砕後に精製し、LC-MS/MS解析によって同定する方法である。まず、申請者はZn(II)との結合によって反応が活性化するラベル化剤”AIZin”を開発した。これは、蛋白質のラベル化に有用な求電子反応基Acyl Imidazole にdipicolylamine を連結した分子である。ルイス酸性の強いZn(II)の配位により、アシル転移反応の脱離基であるImidazoleの電子密度が低下することで、活性化し、蛋白質表面上の求核性アミノ酸残基と反応をする。C6細胞に対して一酸化窒素(NO)刺激を加えると、一時的に細胞内のZn(II)濃度が急激に上昇し、未知なvesicleに貯蔵される。AIZinラベル化剤をC6細胞に投与すると、NO刺激後に多数の蛋白質がラベル化された。ラベル化蛋白質を免疫沈降法によって精製し、トリプシンでpeptide断片化、LC-MS/MS解析を行った。その結果、未知なzinc-rich vesicleに存在する蛋白質を同定することができた。
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LDAI化学による内在性CAI2のmulti-color pulse chase imging
通过 LDAI 化学对内源性 CAI2 进行多色脉冲追踪成像
DOI:
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发表时间:
2013
期刊:
影响因子:
--
作者:
[三木 卓幸, 藤島 祥平, 浜地 格]
通讯作者:
浜地 格
LDAI化学による内在性膜蛋白質のケミカルラベル化とpulse chase解析
使用 LDAI 化学和脉冲追踪分析对完整膜蛋白进行化学标记
DOI:
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发表时间:
2013
期刊:
影响因子:
--
作者:
[三木 卓幸, 藤島 祥平, 浜地 格]
通讯作者:
浜地 格
A novel conditional protein labeling method(1):Zinc ion responsive focused proteome analysis in live cell
一种新型条件蛋白质标记方法(1):活细胞中锌离子响应聚焦蛋白质组分析
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[三木 卓幸, 阿波 諒, 清中 茂樹, 浜地 格]
通讯作者:
浜地 格
LDAI化学による蛋白質ラベリング(1)膜蛋白質のpulse chase解析法への展開
使用LDAI化学进行蛋白质标记 (1) 膜蛋白脉冲追踪分析方法的开发
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[三木 卓幸, 藤島 祥平, 浜地 格]
通讯作者:
浜地 格
Zn応答性ラベル化剤を用いたconditionalプロテオミクス
使用锌响应标记剂的条件蛋白质组学
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[三木卓幸, 阿波諒, 清中茂樹, 浜地格]
通讯作者:
浜地格
共 8 条
PPI阻害剤のin cellアッセイを実現するRsHPセンサの開発
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批准号:23K17972
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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资助金额:$4.16万
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财政年份:2023
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负责人:三木 卓幸
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依托单位:
海外基金