AFFINITY ISOLATION & I-DIRT MS ANALYSIS OF E COLI O157:H7 SAKAI RNA POL COMPLEX
亲和隔离
基本信息
- 批准号:7722251
- 负责人:
- 金额:$ 0.55万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:
- 财政年份:2008
- 资助国家:美国
- 起止时间:2008-03-01 至 2009-02-28
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:AffinityBacteriaCodeComplexComputer Retrieval of Information on Scientific Projects DatabaseDNA-Directed RNA PolymeraseEscherichia coliEscherichia coli O157FundingGenesGenomeGrantInstitutionLaboratoriesMass Spectrum AnalysisMultienzyme ComplexesProteinsRNAResearchResearch PersonnelResourcesSourceTechniquesTranscription InitiationTranscriptional RegulationUnited States National Institutes of Healthpathogenic Escherichia colipol genes
项目摘要
This subproject is one of many research subprojects utilizing the
resources provided by a Center grant funded by NIH/NCRR. The subproject and
investigator (PI) may have received primary funding from another NIH source,
and thus could be represented in other CRISP entries. The institution listed is
for the Center, which is not necessarily the institution for the investigator.
Bacteria contain a single multi-subunit RNA polymerase that is responsible for the synthesis of all RNA. Previous studies on the Escherichia coli K-12 laboratory strain had identified a group of effector proteins that interact directly with RNA polymerase to modulate the efficiency of transcription initiation, elongation or termination. Here we have used a rapid affinity isolation technique to isolate RNA polymerase from the pathogenic Escherichia coli O157:H7 Sakai strain. We analysed the RNA polymerase enzyme complex using mass spectrometry and identified associated proteins. Although Escherichia coli O157:H7 Sakai contains more than 1,600 genes not present in the K-12 strain, many of which are predicted to be involved in transcription regulation, all of the identified proteins in this study were coded on the 'core' Escherichia coli genome.
这个子项目是许多研究子项目中的一个
由NIH/NCRR资助的中心赠款提供的资源。子项目和
研究者(PI)可能从另一个NIH来源获得了主要资金,
因此可以在其他CRISP条目中表示。所列机构为
研究中心,而研究中心不一定是研究者所在的机构。
细菌含有一个单一的多亚基RNA聚合酶,负责所有RNA的合成。先前对大肠杆菌K-12实验室菌株的研究已经鉴定了一组效应蛋白,其直接与RNA聚合酶相互作用以调节转录起始、延伸或终止的效率。在这里,我们已经使用了一种快速的亲和分离技术,分离RNA聚合酶从致病性大肠杆菌O 157:H7酒井株。我们用质谱分析了RNA聚合酶复合物,并鉴定了相关蛋白质。虽然大肠杆菌O 157:H7 Sakai含有K-12菌株中不存在的1,600多个基因,其中许多基因预计参与转录调控,但本研究中鉴定的所有蛋白质都在“核心”大肠杆菌基因组上编码。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
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