Profils génomiques de souches et analyse transcriptionnelle des interactions entre bactéries lactiques

基因组概况和乳酸细菌相互作用转录分析

• 批准号: RGPIN-2014-06330
• 负责人: Roy, Denis
• 金额: $ 1.89万
• 依托单位: Université Laval
• 依托单位国家: 加拿大
• 项目类别: Discovery Grants Program - Individual
• 财政年份: 2014
• 资助国家: 加拿大
• 起止时间: 2014-01-01 至 2015-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://www.nserc-crsng.gc.ca/ase-oro/Details-Detailles_eng.asp?id=567740
• 关键词: Profils; nomiques; de; souches; et

Les bactéries lactiques se retrouvent dans de nombres produits alimentaires car elles possèdent de multiples caractéristiques physiologiques et biochimiques de même que des propriétés probiotiques potentielles. Les ferments et les cultures lactiques utilisés en fabrication fromagère doivent résister à de nombreuses conditions adverses. Ces bactéries sont caractérisées par une grande variation génomique et transcriptomique conduisant à des propriétés technologiques différentes. Dans le cadre de mon programme de recherche, j’ai contribué à l’approfondissement des connaissances sur l’expression du métabolisme microbien associé au fromage par la mise en œuvre d’un champ de recherche basé sur les méthodes génomiques. Cette approche de quantification relative de l’expression des gènes permet d’identifier ceux impliqués dans les interactions complexes entre les différentes souches bactériennes utilisées en fabrication fromagère (ferments et flore secondaire). Elle aide à mieux comprendre l’évolution et la contribution de chaque espèce puisqu’il n’est pas possible de quantifier l'activité spécifique des enzymes pour une espèce donnée. L’approche préconisée permet aussi de déterminer la compatibilité et d’élucider les interactions entre les différentes espèces ou souches de bactéries lactiques. Au cours des cinq prochaines années, mon programme de recherche se concentrera à élucider les interactions entre les ferments de même qu’entre les différentes flores bactériennes laitières (flore secondaire, d’appoint ou probiotique) sous des conditions de fabrication fromagère grâce au profilage génomique de souches et l’analyse transcriptionnelle en cultures mixtes. Chacun des quatre objectifs aidera à valider nos hypothèses de recherche sur la diversité et l’évolution des ferments, les interactions entre les diverses flores et l’impact de lactobacilles hétérofermentaires sur la production de composés volatils. Des systèmes modèles, des méthodes microbiologiques conventionnelles, des méthodes moléculaires, des analyses de l’expression des gènes et des statistiques appropriées seront mis en œuvre pour réaliser les travaux exécutés par un stagiaire postdoctoral, un étudiant au doctorat, deux étudiants à la maitrise et cinq étudiants du premier cycle. Une méthodologie basée sur le pyroséquençage, l’analyse transcriptionnelle et la quantification par PCR basée sur la détection des cellules viables non cultivables sera en mesure d’améliorer notre capacité de sélectionner et de valider différentes combinaisons de souches de bactéries lactiques utilisées comme ferments ou cultures d’appoint, permettant ainsi de faire avancer les connaissances sur la compatibilité, la complémentarité et les interactions entre bactéries lactiques en fabrication fromagère. Le programme de recherche va donc intégrer une gamme pluridisciplinaire d'expertise et de connaissances sur les écosystèmes microbiens dans la fabrication du fromage, et plus particulièrement, les cultures probiotiques produites au Canada. En outre, du personnel hautement qualifié sera prêt à entrer sur le marché du travail dans le domaine de la recherche académique et industrielle. Les résultats escomptés permettront de proposer: un savoir-faire permettant une quantification des principaux groupes microbiens et un suivi de leurs réponses transcriptionnelles par des méthodes génomiques pour la détection des différences entre les communautés microbiennes d’un fromage selon le lot, le procédé de fabrication et le temps de maturation. Ainsi, les nouvelles connaissances générées permettront de proposer à terme de nouveaux leviers de contrôle et de suivi des bactéries lactiques aux chercheurs en industrie fromagère par des méthodes rapides et fiables capables de prédire leur performance en interaction.

乳制品和食品、汽车配件、多个乳制品、生理学和生物制品。S益生菌潜力巨大。发酵和培养乳汁使用S从鸽子的妹妹和条件逆差捏造。《S的技术与技术》是一种宏大的变化和转录的传导性工具。L同志对L同志的表态表示赞同，并表示支持L同志的事业发展。从L的表达到量化的相对表达的含义是S和他的相互作用的复合体Enre re les différentes Souches Bactériennes Utilisées en Manufacturing from magère(发酵和花卉的第二次生产)。L的研究成果以及对乳制品的贡献不可能用数量词L的方法来量化。L对乳制品的兼容性和乳制品的互动性给予了认可。Au Cours des Cinq Prochaines Années，MON PROGREE DE REARCHE Se REARCHE se浓缩拉éLucider Les Interactive Entres Me méme Qu‘entre les différentes Flores bactériennes laitières(FLORE Second，d’Approbitique)sous des Conditions de faction from magère gráce au proprovitice au prospectionnes de prospecties de recherche se proferche se consiereraééLucider Les Interactive entes de méme quentre les différentes es différentes Flores bact bactériennes laitières(FLORE Secdaire，d‘Approvitique)sous des Conductions de Faces from magère gráce au Profacice au Profacec au Prospecnique de Souches et L’analyasChacun des Quatre Objectif aidera valider nos假说de recherche sur la多元化和L的酿造，以及相互作用和分流弗洛雷斯和L对乳酸菌的影响和S的生产。《系统动力学》、《微生物生物学公约》、《模型微生物分析》、《L的表达及统计分析》、《血清学与统计分析》、《L的表现与统计》、《S的科学与技术研究》是博士后、博士后、博士后及博士后、博士后等的重要组成部分。[方法]L‘分析转录本和定量分析聚合酶链式反应基础上的细胞和非可培养物血清中可培养的非可培养物血清，S和验证不同的能力的S和德验证者不同的组合，你的文化指定，永久的工业和乳制品的生产。这是一项多学科的专业知识和专业知识的研究计划，加拿大的益生菌产品的培养和生产。在外面，你的工作人员有资格在工作岗位上工作，这是一项重要的工作。S先生的建议是：从宏观的角度，从宏观的角度来量化，从宏观的角度，从宏观的角度，从宏观、微观和微观三个在互动的过程中，所有的新事物都是新的提议者和新的征服者。