Réponse transcriptomique au stress acide de bactéries probiotiques après leur passage dans un simulateur gastrointestinal

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Biena inc., fondée en 1996, est une compagnie productrice de cultures bactériennes de premier rang au Canada**qui commercialise une vaste gamme de produits dédiés à l'industrie fromagère de même qu'au secteur des**produits de santé naturels. Les souches probiotiques produites par Biena inc. doivent non seulement rester**vivantes lors de la production et de l'entreposage, mais doivent aussi être métaboliquement actives au moment**leur ingestion et pendant le transit intestinal. Ces différentes étapes exposent les souches à plusieurs stress qui**affectent leur viabilité, notamment les stress associés à la présence d'oxygène et aux températures abusives,**mais aussi les stress acides de l'estomac (pH, acidité). Bien que Biena inc. maîtrise toutes les étapes de la**sélection des souches à la production en passant par le contrôle de la qualité, l'entreprise ne possède ni**l'expertise ni les techniques pour mettre au point des techniques moléculaires capables de s'assurer que des**souches probiotiques ont les caractéristiques recherchées pour résister aux stress acides associés au passage**gastrique. Le projet vise ainsi à développer des outils moléculaires basés sur l'analyse de l'expression de gènes**permettant d'évaluer les réponses aux stress de l'estomac pour différentes espèces de probiotiques parmi les**plus commercialisées. L'utilisation d'un modèle dynamique in vitro permettra de simuler la diminution du pH**dans le temps, en plus de respecter le temps de résidence dans l'estomac. La quantification des bactéries ayant**survécues à la simulation gastrique se fera par la méthode PCR quantitative (qPCR) couplée à l'utilisation du**propidium monoazide (PMA). La détermination des réponses des souches probiotiques aux stress acides sera**obtenue par extraction de l'ARN pour l'analyse du niveau d'expression des gènes ciblés par transcription**inversée en PCR en temps réel. À notre connaissance, ce type d'étude n'a jamais été réalisée pour divers**groupes de probiotiques à la suite du passage de l'estomac dans un système de digestion in vitro. Les retombées**du projet se traduiront par un avantage concurrentiel pour l'entreprise puisque les résultats escomptés mettront**en avant plan certaines souches plus adaptées aux stress acides.