Profils génomiques de souches et analyse transcriptionnelle des interactions entre bactéries lactiques

基因组概况和乳酸细菌相互作用转录分析

• 批准号: RGPIN-2014-06330
• 负责人: Roy, Denis
• 金额: $ 1.89万
• 依托单位: Université Laval
• 依托单位国家: 加拿大
• 项目类别: Discovery Grants Program - Individual
• 财政年份: 2015
• 资助国家: 加拿大
• 起止时间: 2015-01-01 至 2016-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://www.nserc-crsng.gc.ca/ase-oro/Details-Detailles_eng.asp?id=588945
• 关键词: Profils; nomiques; de; souches; et

Les bactéries lactiques se retrouvent dans de nombres produits alimentaires car elles possèdent de multiples caractéristiques physiologiques et biochimiques de même que des propriétés probiotiques potentielles. Les ferments et les cultures lactiques utilisés en fabrication fromagère doivent résister à de nombreuses conditions adverses. Ces bactéries sont caractérisées par une grande variation génomique et transcriptomique conduisant à des propriétés technologiques différentes. Dans le cadre de mon programme de recherche, j’ai contribué à l’approfondissement des connaissances sur l’expression du métabolisme microbien associé au fromage par la mise en œuvre d’un champ de recherche basé sur les méthodes génomiques. Cette approche de quantification relative de l’expression des gènes permet d’identifier ceux impliqués dans les interactions complexes entre les différentes souches bactériennes utilisées en fabrication fromagère (ferments et flore secondaire). Elle aide à mieux comprendre l’évolution et la contribution de chaque espèce puisqu’il n’est pas possible de quantifier l'activité spécifique des enzymes pour une espèce donnée. L’approche préconisée permet aussi de déterminer la compatibilité et d’élucider les interactions entre les différentes espèces ou souches de bactéries lactiques. Au cours des cinq prochaines années, mon programme de recherche se concentrera à élucider les interactions entre les ferments de même qu’entre les différentes flores bactériennes laitières (flore secondaire, d’appoint ou probiotique) sous des conditions de fabrication fromagère grâce au profilage génomique de souches et l’analyse transcriptionnelle en cultures mixtes. Chacun des quatre objectifs aidera à valider nos hypothèses de recherche sur la diversité et l’évolution des ferments, les interactions entre les diverses flores et l’impact de lactobacilles hétérofermentaires sur la production de composés volatils. Des systèmes modèles, des méthodes microbiologiques conventionnelles, des méthodes moléculaires, des analyses de l’expression des gènes et des statistiques appropriées seront mis en œuvre pour réaliser les travaux exécutés par un stagiaire postdoctoral, un étudiant au doctorat, deux étudiants à la maitrise et cinq étudiants du premier cycle. Une méthodologie basée sur le pyroséquençage, l’analyse transcriptionnelle et la quantification par PCR basée sur la détection des cellules viables non cultivables sera en mesure d’améliorer notre capacité de sélectionner et de valider différentes combinaisons de souches de bactéries lactiques utilisées comme ferments ou cultures d’appoint, permettant ainsi de faire avancer les connaissances sur la compatibilité, la complémentarité et les interactions entre bactéries lactiques en fabrication fromagère. Le programme de recherche va donc intégrer une gamme pluridisciplinaire d'expertise et de connaissances sur les écosystèmes microbiens dans la fabrication du fromage, et plus particulièrement, les cultures probiotiques produites au Canada. En outre, du personnel hautement qualifié sera prêt à entrer sur le marché du travail dans le domaine de la recherche académique et industrielle. Les résultats escomptés permettront de proposer: un savoir-faire permettant une quantification des principaux groupes microbiens et un suivi de leurs réponses transcriptionnelles par des méthodes génomiques pour la détection des différences entre les communautés microbiennes d’un fromage selon le lot, le procédé de fabrication et le temps de maturation. Ainsi, les nouvelles connaissances générées permettront de proposer à terme de nouveaux leviers de contrôle et de suivi des bactéries lactiques aux chercheurs en industrie fromagère par des méthodes rapides et fiables capables de prédire leur performance en interaction.

从细菌的角度看，它们是可逆的；从生理角度看，它们是可逆的；从生理角度看，它们是可逆的；从生理角度看，它们是可逆的；从生理角度看，它们是可逆的。发酵和培养过程中使用的化学物质是由化学物质制成的，化学物质是由化学物质制成的，化学物质是由化学物质制成的。这些变异体、变异体、变异体、变异体、变异体、变异体、变异体、变异体、变异体。在我的研究方案的基础上，我为我的研究提供了一种新的方法，使我的研究结果与我的研究结果一致，使我的研究结果与我的研究结果一致，使我的研究结果与我的研究结果一致。这种量化的方法相对于对基因表达的理解，允许对基因标识符的理解，隐含的基因表达，复杂的基因表达，不同的基因表达，不同的基因表达，不同的基因表达，不同的基因表达，不同的基因表达，不同的基因表达，不同的基因表达，不同的基因表达，不同的基因表达，不同的基因表达，不同的基因表达，不同的基因表达，不同的基因表达，不同的基因表达，不同的基因表达，不同的基因表达，不同的基因表达，不同的基因表达。如果你能理解“i ' m - miieux”，那么你就能理解“i ' m - miieux”，“i ' m - miriux”，“i ' m - miriux”，“i ' m - miriux”，“i ' m - miriux”，“i ' m - miriux”，“i ' m - miriux”，“i ' m - miriux”，“i ' m - miriux”。我的办法是，我的办法是，我的办法是，我的办法是，我的办法是，我的办法是，我的办法是，我的办法是，我的办法是，我的办法是，我的办法是，我的办法是，我的办法是，我的办法是，我的办法是，我的办法是，我的办法。在研究过程中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，在研究方案中，四分之一的目标是，通过对各种物质的研究和发酵，通过对各种物质的相互作用，通过对乳酸菌的影响，通过对各种物质的生产和发酵，通过对各种物质的生产和发酵，实现对乳酸菌的影响。系统<s:1>模态<e:1>、常规微生物系统、系统<s:1>模态<e:1>、系统<s:1>模态<e:1>、系统<s:2>模态表达式、系统与统计系统的分析、系统与统计系统的分析、系统与统计系统的分析、系统与统计系统的分析、系统与统计系统的分析、系统与统计系统的分析、系统与统计系统的分析、系统与统计系统的分析、系统与统计系统的分析、系统与统计系统的分析、系统与统计系统的分析、系统与统计系统的分析、系统与统计系统的分析、系统与统计系统的分析、系统与统计系统的分析、系统与统计系统的分析、系统与统计系统的分析、系统与统计系统的分析、系统与统计系统的分析。有一种方法是：用化学方法分析，用化学方法分析，用化学方法定量分析，用PCR方法分析，用化学方法测定，用化学方法测定，用化学方法测定，用化学方法测定，用化学方法测定，用化学方法测定，用化学方法测定，用化学方法测定，用化学方法测定，用化学方法测定，用化学方法测定，用化学方法测定，用化学方法测定，用化学方法测定，用发酵方法测定，用化学方法测定，用化学方法测定，用化学方法测定，用化学方法测定，用化学方法测定，用化学方法测定，用化学方法测定，用化学方法测定，用化学方法测定，用化学方法测定，用化学方法测定，从表面上看，这是一个复杂的过程。加拿大的研究项目是：在加拿大的研究项目是：在加拿大的研究项目是：在加拿大的研究项目是：在加拿大的研究项目是：在加拿大的研究项目是：在加拿大的研究项目是：在加拿大的研究项目是：在加拿大的研究项目是：在加拿大的研究项目是：在加拿大的研究项目是：在加拿大的研究项目。此外，人力资源管理公司还提供了<s:1>人力资源管理公司/人力资源管理公司/人力资源管理公司/人力资源管理公司/人力资源管理公司/人力资源管理公司。结果escomptes permettront de申请人:联合国处世permettant一个量化des principaux的小组microbiens等联合国suivi de他们回应transcriptionnelles par方法genomiques倒两者之间communautes检测des差异microbiennes d一个清爽根据勒很多,勒就制造等le temps de成熟。例如，将新一代的通讯工具与其他的通讯工具结合起来，将新一代的通讯工具与其他通讯工具结合起来，将新一代的通讯工具与其他通讯工具结合起来，将新一代的通讯工具与其他通讯工具结合起来，将新一代的通讯工具与其他通讯工具结合起来。