Étude des mécanismes d'action d'ingrédients prébiotiques et d'un probiotique: impact sur l'écologie du microbiote intestinal et la physiologie d'organoïdes intestinaux

点击翻译按钮获取中文摘要

L'entreprise Roquette, un leader mondial dans la production d'ingrédients d'origine végétale, vient de bâtir une usine d'une valeur de 600M can $ à Portage La Prairie au Manitoba pour produire des protéines de pois sec. Pour valoriser les coproduits de l'extraction, l'entreprise a mis au point des procédés permettant de produire des amidons résistants ayant une action potentiellement prébiotique. Ainsi, Roquette désire collaborer avec les chercheurs de l'INAF afin d'identifier les mécanismes d'action de nouveaux pré- et probiotiques et comprendre leur influence sur l'écologie du microbiote intestinal. Ce projet vise donc à renforcer les connaissances fondamentales de l'effet prébiotique des produits de Roquette et étudier leur interaction avec un Lacticaseibacillus paracasei ROQB1probiotique. Nous chercherons à comprendre comment les prébiotiques modifient les conditions de l'environnement colique et favorisent l'établissement de L. paracasei et sa production de bactériocines. Nous pourrons ainsi faire la lumière sur l'impact des traitements sur l'homéostasie du microbiote, déterminer leur capacité à moduler les microbiotes luminal et mucinal, évaluer la persistance d'agents probiotiques spécifiques dans un microbiote complexe et stable et leur capacité à réduire la prolifération de pathobiontes. Nous pourrons aussi éclaircir la réponse physiologique de l'hôte (amélioration de la fonction barrière de l'intestin, la réponse inflammatoire de l'entérocyte, la différenciation cellulaire de la muqueuse intestinale). Pour étudier les mécanismes d'action des pré- et probiotiques développés par Roquette, nous mobiliserons les plateformes de métagénomique, de métabolomique, de digestion artificielle (M-SHIME, microbiofermenteurs), un modèle 3-D de l'épithélium intestinal murin (organoïdes intestinaux) et analyserons les jeux de données massives grâce à des outils bio-informatiques puissants. Les projets associent des stagiaires, des étudiants de 2e cycle, un doctorant et une postdoctorante.