Systematische Analyse der Rekrutierung von signal-abhängig regulierten Transkriptionsfaktoren an entzündungsrelevante Gene mittels ChIP-Chip Technologie

促炎性刺激如白细胞介素-1，表达了数百种基因，导致了一种肠道反应。显然，许多基因的表达和调控韦尔登的功能都是通过基因组DNA测序来实现的，因此，通过基因组转录中的酶解信号转导，基因组DNA测序并不能提供转录因子的联合检测所需的信息。Eine wichtige Voraussetzung zur Lösung solcher Fragen ist，für geignete Gruppen von Entzündungsgenen das Muster der Rekrutierung von Transkriptionsfaktoren an diese Gene zu bestimmen.随着人类基因组研究的深入，我们已经建立了一个新的技术和一个有效的模型韦尔登。我们已经在前面的研究中发现，白细胞介素-1与FRA-1的mRNA和蛋白ERK信号通路有关，但这并不意味着对二种转录因子AP（激活蛋白）-1的瞬时调节。染色质免疫沉淀（ChIP）实验表明，FRA-1与IL-1结合，并与内源性IL-8启动子结合。在利用DNA微阵列（Chip）联合韦尔登的染色质IP研究中，通过新的支持，ChlP-Chip技术可以更好地研究FRA-1和AP-1的异源二聚体伴侣的结合，从而降低IL-1和ERK信号通路的mRNA表达。新FRA-1结合的功能性意义在于通过基因组学报告基因的突变增强Ebene的表达，并通过FRA-1的调节增强Ebene的表达，从而使FRA-1与AP-1的结合增强。在FRA-1框架内的Art和Weise是AP-1- abhängigen Entzündungsgenregulation实验中的一种möglichst genaues Netzwerk，它是一种机制性的实验，信号转换在Einzelnen或Gruppen von entzündlichen Genen übersetzen的活动中进行，并不只是一种用于在Rahmen功能基因组研究中进行基础研究的最佳片段，sondern eröffnet auch neue intersante Perspektiven für die selektive Modulation von Entzündungsgenen.

Proinflammatorische Stimuli wie Interleukin-1 verändern die Expression von hunderten von Genen während einer Entzündungsreaktion. Obwohl sehr viele dieser Gene zeitlich und mengenmässig koreguliert werden, ergibt sich aus ihrer genomischen DNA Sequenz keine unmittelbare Information über die kombinatorische Verwendung von Transkriptionsfaktoren, durch welche die zytosolische Signaltransduktion in Gentranskription übersetzt wird. Eine wichtige Voraussetzung zur Lösung solcher Fragen ist, für geeignete Gruppen von Entzündungsgenen das Muster der Rekrutierung von Transkriptionsfaktoren an diese Gene zu bestimmen. Aufgrund der Größe des menschlichen Genoms müssen hierfür neue Technologien etabliert und an geeigneten Modellgenen validiert werden.Wir haben in Vorarbeiten zu diesem Antrag zeigen können, dass Interleukin-1 über den ERK Signalweg die mRNA und Proteinmenge von FRA-1, einer bisher nicht in Entzündungsgenregulation implizierten Untereinheit des dimeren Transkriptionsfaktors AP(activating protein)-1, transient hochreguliert. Chromatin Immunpräzipitations (ChIP) Experimente zeigten, dass FRA-1 nachfolgend IL-1-abhängig an den endogenen Interleukin-8 Promoter rekrutiert wird. In diesem Antrag soll die Chromatin IP mit DNA Mikroarrays (Chip) kombiniert werden, um mit Hilfe dieser neuen, sogenannten ChlP-Chip Technik eine möglichst akkurate Erfassung der Bindungsstellen von FRA-1 und seiner heterodimerischen AP-1 Partner in allen weiteren Entzündungsgenen zu ermöglichen, deren mRNA Expression von IL-1 und dem ERK Signalweg abhängt. Die funktionelle Signifikanz der neuen FRA-1 Bindungsstellen wird sodann auf cis Ebene durch Mutagenese in geeigneten genomischen Reportergenkoristrukten, und auf trans Ebene durch Modulation der FRA-1 Menge sowie der Expression von Fusionsproteinen aus FRA-1 und einem zweiten AP-1 Partner überprüft. Ziel ist es, auf diese Art und Weise am Beispiel der FRA-1 Untereinheit ein möglichst genaues Netzwerk der AP-1- abhängigen Entzündungsgenregulation experimentell zu bestimmen.Die beispielhafte Entschlüsselung derjenigen Mechanismen, die die Signaltransduktion in die Aktivierung von einzelnen oder von Gruppen von entzündlichen Genen übersetzen, stellt nicht nur eine wichtige sehr aktuelle Fragestellung für die Grundlagenforschung im Rahmen funktioneller Genomforschung dar, sondern eröffnet auch neue interessante Perspektiven für die selektive Modulation von Entzündungsgenen.