Molekulare Charakterisierung der Interaktion zwischen Protein-Transmembrandomänen und Sphingolipiden.

这些项目是Wechselenchung zwischen Protein-transmembrandomänen und Sphingolipiden的分子特征。在前一阶段的研究中，我们发现了一种在跨膜蛋白p24鉴定中的鞘磷脂相互作用，这种特异性结合是一种鞘磷脂特异性结合（SM 18：0）。一项生物信息学分析，采用了48年前的一项脂质结合动力学退化，可能与鞘脂、蛋白质结合。为了获得具有特征的脂质结合物，结合质谱法鉴定脂质-蛋白质-产物韦尔登，进行光鞘氨醇测定。通过体内和体外突变分析和特异性分析，验证了蛋白质测序和脂质相互作用之间的相关性，并建立了一个用于鞘脂跨膜转运的模型。建立了一个分子动力学模拟和固体核磁共振的结构分析系统。Die Analyse der zellulären Funktionen einzelner Kandidaten韦尔登neue moleculare Erkenntnisse über die Regulation von Proteinfunktionen durch Lipide liefern.

Ziel des Projektes ist die molekulare Charakterisierung der Wechselwirkung zwischen Protein-Transmembrandomänen und Sphingolipiden. In vorausgegangenen Studien wurde ein Sphingolipid-Interaktionsmotiv in der Transmembrandomäne des Membranproteins p24 identifiziert, das spezifisch die Bindung einer einzelnen Sphingomyelinspezies (SM 18:0) vermittelt. Eine bioinformatische Analyse mit einem degeneriertem Lipidbindungsmotiv ergab 48 weitere, potentiell mit Sphingolipiden interagierende, Proteinkandidaten. Um deren Lipidbindungspartner zu charakterisieren, soll eine Photosphingosinquervernetzung in Kombination mit massenspektrometrischer Identifizierung der Lipid-Protein-Produkte eingesetzt werden. Die erhaltene Korrelation von Proteinsequenz und interagierenden Lipiden soll zu einem Modell für Sphingolipid-Transmembrandomänen-Interaktionen führen, welches im Folgenden durch Mutationsanalyse und spezifische in vivo und in vitro Assays validiert werden soll. Eine strukturelle Analyse über Molecular Dynamcis Simulationen und Solid State NMR ist geplant. Die Analyse der zellulären Funktionen einzelner Kandidaten werden neue molekulare Erkenntnisse über die Regulation von Proteinfunktionen durch Lipide liefern.