肉用牛における肥育状態の生体評価法の開発と産肉制御の分子機構の解明

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（研究課題A）黒毛和種肥育牛（去勢）の産肉形質を生体評価する予測モデルの構築：令和2～3年度に引き続き、黒毛和種肥育牛（去勢）の生後9ヶ月から28ヶ月齢の間で採材したサンプルを供試して、既に確立した定量プロテオミクスSWATH法による血清タンパク質135種類の多項目同時定量解析を行ない、定量情報と経時的な動態情報を獲得した。また、枝肉成績（枝肉重量・ロース芯面積・バラの厚さ・皮下脂肪の厚さ・歩留基準値・脂肪交雑・オレイン酸濃度）を目的変数として、構築する予測モデルにあった特徴量（説明変数）を作成し、線形の回帰タスク（LASSO, IFSによる変数選択と重回帰分析）を実施して予測モデルの構築を行なった。（研究課題B）肥育期間中の産肉形質の発育シミュレーションモデルの構築：研究課題Aで構築された生体評価予測モデルで予測精度の高いモデル（枝肉重量）の特徴量（説明変数）（同定された血清バイオマーカータンパク質）の生理学的機能を、公共データベース（令和３年度に導入したIPAソフトウェア含む）を用いたバイオインフォマティクス解析によって推測した。さらに、得られた血清バイオマーカータンパク質の推定される生理学的機能情報とその動態と、血清生化学値の動態を入力データとして、黒毛和種肥育牛（去勢）の肥育期間中の産肉形質の発育シミュレーションモデル（β版）を構築した。さらに、飼料試験サンプルを用いたシミュレーションモデルの構築も実施し、飼料添加物の試験区において、複数のタンパク質群の動態の変化する時期が変化していることを確認した。