Protein-Protein-Interaktionen im DNA-mismatch-Reparatursystem: site-directed crosslink und Fluoreszenz-Resonanzenergie-Transfer Studien

在后基因组学时代，蛋白质相互作用的研究将成为一种新的方法。Proteine treten dabei über kleine，speziophilhe Teile ihrer Oberfläche miteinander in Wechselenkung. Die Identifizierung dieser Interaktionstellen und das Verständnis der Combustion zwischen Proteinen ist eines der wichtigsten Ziele in der modernen Struktur- und Systembiologie.利用多蛋白复合物的拓扑学方法鉴定大肠杆菌的蛋白质-蛋白质-蛋白质间相互作用。大肠杆菌MutH、MutL和MutS蛋白用于进化中的DNA错配修复系统。该方法遵循以下原则：将生物信息学的前处理结构和序列信息的前处理韦尔登方法转化为半胱氨酸，然后用巯基特异性试剂修饰蛋白质的上表面。因此，化学修饰的分子筛只能通过交联技术、共振能量转移（FRET）技术来实现，而不能通过功能上的改变来实现韦尔登。这一韦尔登事件发生在公司内部。蛋白质erweitert韦尔登。Die zu erwartenden Ergebnisse dürften Modelcharakter für alle MMR-System haben，u.a.对于人类来说，这是一个非常有趣的问题，遗传性非息肉病性结肠癌（HNPCC，hereditary non-polyposis colon cancer）是人类在遗传学上的缺陷，也是一个修复性的缺陷。

In der post-genomischen Ära stellt die Untersuchung der Protein-Interaktionsnetzwerke eine der großen methodischen Herausforderungen dar. Proteine treten dabei über kleine, spezifische Teile ihrer Oberfläche miteinander in Wechselwirkung. Die Identifizierung dieser Interaktionsstellen und das Verständnis der Kommunikation zwischen Proteinen ist eines der wichtigsten Ziele in der modernen Struktur- und Systembiologie. Ziel des vorliegenden Antrags ist die Identifizierung der Protein-Protein-Interaktionsstellen sowie der Topographie des Multiproteinkomplexes der E. coli Proteine MutH, MutL und MutS des evolutiv hochkonservierten DNA-mismatch-Reparartursystems. Die methodische Vorgehensweise wird folgende sein: Nach bioinformatorischer Vorarbeit unter Verwendung der vorhandenen Struktur- und Sequenzinformationen werden einzelne Cysteinreste auf der Oberfläche der Proteine mit thiol-spezifischen Reagenzien modifiziert. Die so chemisch modifizierten Wechselwirkungspartner sollen mit Hilfe von crosslink-Techniken, Fluoreszenz-Resonanz-Energie-Transfer-(FRET)-Messungen und nicht zuletzt auch durch Funktionsuntersuchungen charakterisiert werden. Die Studien werden später auf andere Interaktionspartner der o.g. Proteine erweitert werden. Die zu erwartenden Ergebnisse dürften Modellcharakter für alle MMR-Systeme haben, u.a. für die des Menschen, was von besonderem Interesse ist, da die häufigste Ursache von vererbbarem Darmkrebs (HNPCC, hereditary non-polyposis colon cancer) beim Menschen auf genetischen Defekten in den an der Reparatur beteiligten mutS und mutL homologen Genen beruht.