GLYCOSAMINOGLYCAN-PROTEIN INTERACTIONS IN MALARIA PARASITE INFECTION
GLYCOSAMINOGLYCAN-PROTEIN INTERACTIONS IN MALARIA PARASITE INFECTION
批准号:
8361799
负责人:
JAMES H. PRESTEGARD
金额:
$0.18万
依托单位:
依托单位国家:
美国
项目类别:
财政年份:
2011
资助国家:
美国
项目状态:
已结题
起止时间:
2011-02-01 至 2012-01-31
关键词:
AnisotropyBindingCell surfaceChemicalsChondroitin Sulfate AComplexErythrocytesFundingGlycosaminoglycansGrantHuman ResourcesInfectionLabelLaboratoriesMalariaMethodsNational Center for Research ResourcesParasitesPlacentaPlasmidsPlasmodium falciparumPlayPregnant WomenPrincipal InvestigatorProteinsProtocols documentationResearchResearch InfrastructureResidual stateResourcesSamplingSourceSpecificityTertiary Protein StructureTestingUnited States National Institutes of HealthWorkcoststem
中文摘要
这个子项目是利用资源的许多研究子项目之一。
由NIH/NCRR资助的中心拨款提供。对子项目的主要支持
子项目的首席调查员可能是由其他来源提供的,
包括美国国立卫生研究院的其他来源。为子项目列出的总成本可能
表示该子项目使用的中心基础设施的估计数量,
不是由NCRR赠款提供给次级项目或次级项目工作人员的直接资金。
疟疾寄生虫恶性疟原虫被认为是通过VAR2CSA蛋白的某些结构域与细胞表面的糖胺聚糖相互作用,特别是软骨素4-硫酸盐(C4S),导致孕妇感染的红细胞与胎盘结合。DBL3X结构域被预测在VAR2CSA与C4S的结合中发挥关键作用。Gowda博士的实验室已经提供了表达蛋白质DBLX3结构域的质粒和方案,以测试和表征这些假设的相互作用。该资源的工作人员正在生产13C标记形式的特定C4S低聚体,可用于评估相互作用的特异性,并将表达适当标记形式的蛋白质。核磁共振方法允许在排列的样品中使用13C化学位移各向异性偏移量来返回络合物的几何信息,这些方法源于之前由资源支持的关于剩余偶极耦合(RDC)的工作。
英文摘要
This subproject is one of many research subprojects utilizing the resources
provided by a Center grant funded by NIH/NCRR. Primary support for the subproject
and the subproject's principal investigator may have been provided by other sources,
including other NIH sources. The Total Cost listed for the subproject likely
represents the estimated amount of Center infrastructure utilized by the subproject,
not direct funding provided by the NCRR grant to the subproject or subproject staff.
The malaria parasite, Plasmodium falciparum, is believed to cause binding of infected erythrocytes to the placenta in pregnant women through interactions of certain domains of the VAR2CSA protein with cell-surface glycosaminoglycans, specifically chondroitin 4-sulfate (C4S). DBL3X domain has been predicted to play key roles in the binding of VAR2CSA to C4S. Dr Gowda's laboratory has provided plasmids and protocols for expressing the DBLX3 domain of the protein for the purpose of testing and characterizing these hypothesized interactions. Personnel at the Resource are producing 13C-labeled forms of specific C4S oligomers that can be used in assessing the specificity of interactions and will express appropriately labeled forms of the protein. The NMR methods that allow use of 13C chemical shift anisotropy offsets in aligned samples to return geometry information on the complexes stem from pre8vious Resource supported work on residual dipolar couplings (RDCs).
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会议论文
Sparse NMR Labeling Approach to Glycoprotein Structure and Function
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批准号:10388355
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项目类别:
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资助金额:$30.2万
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财政年份:2019
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负责人:JAMES H. PRESTEGARD
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依托单位:
Sparse NMR Labeling Approach to Glycoprotein Structure and Function
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项目类别:
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资助金额:$30.2万
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财政年份:2019
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负责人:JAMES H. PRESTEGARD
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依托单位:
Establishing the Molecular Basis of Glycoconjugate Glycosylation
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批准号:9313292
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项目类别:
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资助金额:$39.55万
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财政年份:2017
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负责人:JAMES H. PRESTEGARD
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依托单位:
Upgrade for a 600 MHz Structural Biology NMR
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批准号:9075568
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项目类别:
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资助金额:$59.99万
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财政年份:2016
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负责人:JAMES H. PRESTEGARD
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依托单位:
New Reagents for DNP Enhanced Metabolic Imaging
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批准号:8619048
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项目类别:
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资助金额:$21.37万
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财政年份:2014
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负责人:JAMES H. PRESTEGARD
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依托单位:
2013 Computational Aspects of Biomolecular NMR GRC/GRS
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批准号:8521526
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项目类别:
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资助金额:$1.0万
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财政年份:2013
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负责人:JAMES H. PRESTEGARD
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依托单位:
ISOTOPE LABELING OF GLYCOPROTEIN GLYCANS FOR NMR OBSERVATION
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批准号:8361810
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项目类别:
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资助金额:$0.18万
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财政年份:2011
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负责人:JAMES H. PRESTEGARD
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依托单位:
HEPARAN SULFATE LIGAND REQUIREMENTS OF PHAGE DISPLAY ANTIBODIES
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批准号:8361820
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项目类别:
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资助金额:$0.18万
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财政年份:2011
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负责人:JAMES H. PRESTEGARD
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依托单位:
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批准号:8361787
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项目类别:
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资助金额:$0.18万
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财政年份:2011
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负责人:JAMES H. PRESTEGARD
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依托单位:
FTMS STUDIES OF GLYCOSAMINOGLYCANS
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批准号:8361791
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项目类别:
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资助金额:$0.18万
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财政年份:2011
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负责人:JAMES H. PRESTEGARD
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依托单位:
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批准号:8361817
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项目类别:
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资助金额:$0.18万
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财政年份:2011
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负责人:JAMES H. PRESTEGARD
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依托单位:
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批准号:8361793
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项目类别:
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资助金额:$0.18万
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财政年份:2011
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负责人:JAMES H. PRESTEGARD
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依托单位:
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批准号:8361784
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财政年份:2011
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负责人:JAMES H. PRESTEGARD
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财政年份:2011
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负责人:JAMES H. PRESTEGARD
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批准号:8361811
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项目类别:
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资助金额:$10.63万
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财政年份:2011
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负责人:JAMES H. PRESTEGARD
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批准号:8361819
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项目类别:
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资助金额:$0.18万
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财政年份:2011
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负责人:JAMES H. PRESTEGARD
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依托单位:
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批准号:8361823
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项目类别:
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资助金额:$0.18万
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财政年份:2011
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负责人:JAMES H. PRESTEGARD
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依托单位:
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批准号:8168839
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项目类别:
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资助金额:$10.11万
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财政年份:2010
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负责人:JAMES H. PRESTEGARD
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依托单位:
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批准号:8168849
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项目类别:
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资助金额:$0.17万
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财政年份:2010
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负责人:JAMES H. PRESTEGARD
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依托单位:
MODELING PROTEIN STRUCTURE USING SPARSE NMR CONSTRAINTS
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批准号:8168852
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项目类别:
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资助金额:$0.17万
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财政年份:2010
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负责人:JAMES H. PRESTEGARD
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依托单位:
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帽结合蛋白(cap binding protein)调控乙烯信号转导的分子机制
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批准号:32170319
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负责人:董春海
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帽结合蛋白(cap binding protein)调控乙烯信号转导的分子机制
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资助金额:58万元
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批准年份:2021
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负责人:董春海
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