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Seeing the (super)trees through the phlogenomic forest

Seeing the (super)trees through the phlogenomic forest
透过植物森林看到（超级）树木
批准号：
155251-2009
负责人：
Lapointe, FrançoisJoseph
金额：
$1.89万
依托单位：
Université de Montréal
依托单位国家：
加拿大
项目类别：
Discovery Grants Program - Individual
财政年份：
2009
资助国家：
加拿大
项目状态：
已结题
起止时间：
2009-01-01 至 2010-12-31
来源：
https://www.nserc-crsng.gc.ca/ase-oro/Details-Detailles_eng.asp?id=422499
关键词：
Seeingsupertreesthroughphlogenomic

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
随着系统基因组学中全基因组数据的增长，可以使用新的方法来组合在重叠类群集上定义的基因树（超树），分析不完整数据的多基因比对（超矩阵）或通过允许系统发生树的网状结构（超网络）来解决不同基因之间的冲突。我想调查这些方法的方法论和理论方面，然后应用这些方法来解决进化生物学中的重要问题。
英文摘要
With the growth of genome-wide data in phylogenomics, new methods are becoming available to combine gene trees defined on overlapping sets of taxa (supertrees), analyze multi-gene alignments with incomplete data (supermatrices) or resolve conflicts among different genes by allowing reticulations in phylogenetic trees (supernetworks). I want to investigate the methodological and theoretical aspects of such approaches, and then apply these methods to address important questions in evolutionary biology.
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会议论文
Statistical analysis of microbiome longitudinal data with multiplex networks
  • 批准号：
    RGPIN-2021-03120
  • 项目类别：
    Discovery Grants Program - Individual
  • 资助金额：
    $2.04万
  • 财政年份：
    2022
  • 负责人：
    Lapointe, FrançoisJoseph
  • 依托单位：
    Université de Montréal
Statistical analysis of microbiome longitudinal data with multiplex networks
  • 批准号：
    RGPIN-2021-03120
  • 项目类别：
    Discovery Grants Program - Individual
  • 资助金额：
    $2.04万
  • 财政年份：
    2021
  • 负责人：
    Lapointe, FrançoisJoseph
  • 依托单位：
    Université de Montréal
A statistical framework for the evaluation and comparison of complex networks and its application to microbiome research
  • 批准号：
    RGPIN-2015-05219
  • 项目类别：
    Discovery Grants Program - Individual
  • 资助金额：
    $1.89万
  • 财政年份：
    2019
  • 负责人：
    Lapointe, FrançoisJoseph
  • 依托单位：
    Université de Montréal
A statistical framework for the evaluation and comparison of complex networks and its application to microbiome research
  • 批准号：
    RGPIN-2015-05219
  • 项目类别：
    Discovery Grants Program - Individual
  • 资助金额：
    $1.89万
  • 财政年份：
    2018
  • 负责人：
    Lapointe, FrançoisJoseph
  • 依托单位：
    Université de Montréal
国内基金
海外基金
水稻 SUPER WOMAN 5 (SPW5) 基因调控花器官发育的分子机制解析
  • 批准号：
  • 项目类别：
    省市级项目
  • 资助金额：
    --
  • 批准年份：
    2025
  • 负责人：
    庄慧
  • 依托单位：
    西南大学
BRPF1 m6A修饰异常通过重塑BCAT1超级增强子介导Setd2缺陷型肾癌支链氨基酸代谢成瘾的机制研究
  • 批准号：
    82372724
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    49.00万元
  • 批准年份：
    2023
  • 负责人：
    何竑超
  • 依托单位：
    上海交通大学
肌细胞生成素与Super-enhancer互作形成正反馈环路促进肌损伤修复的机制研究
水稻SUPER WOMAN 3 (SPW3) 基因调控花器官发育的分子机制研究
  • 批准号：
    --
  • 项目类别：
    --
  • 资助金额：
    30万元
  • 批准年份：
    2021
  • 负责人：
    庄慧
  • 依托单位：
    西南大学