Ultradeep Genom- und Transkriptomanalyse bei Raps (Brassica napus) mittels Next-Generation-Sequenzierungsverfahren

下一代新一代电子标签-电子标签和电子标签。Hauptziel Dieses Vorhabens ist ES，MIT Hilfe von超深-Sequenzierungstechniken eine Plattform zur集成von Genetischen and Physikalischen Karten MIT umfangreichen Genextions to Raps(Brassica Napus)zu etablieren.MIT der Massenequenzierung von AFLP-Marker-Fragmenten soll zum ersten Mal eine dichte SNP-Karte für Raps erstellt Well den，dieüber Sequenziertation an die Physikalischen Brassica and Arabiopsis-Karten angeknüPFT wanden kann.通过拟南芥和甘蓝型油菜的超有限元表达，描述了一种并行的遗传信息表达方式。所有的这些数据都来自于他们的工作，而且他们的工作也很有效，而且他们的工作也不是很顺利。通过超高速表达谱定量分析有丝分裂像-GA-EST-TAG-Sequenzierung Sol-Sequenzierung解决方案的差异表达von entschedenden Transritions，die bebe微阵列-Analysen wegen Deren niedrigen ExpressionsSniveau通常übersehenen。Für die集成der Daten Aus den SNP-und Exages-Karten MIT vorhandenen Physikalischen Karten soll eline BioInformation Platform auf base einer en Datenbank entwickelt.Das groçe set von AFLP-SNP-Markern Sowie Ufangreiche EST-SNPs，die wir wir w？hrend der Ultratiefen ExpressionsAnalyst detektieren，Wen den einer International Initiative zur Erstellung einesöffentlich Verfügbaren B.napus SNP-ararns zur Verfügung egellt.有些人将成为国际大家庭的一员。

Die neuen Next-Generation Hochdurchsatz-Sequenzierungs-Technologien eignen sich neben der hocheffizienten Genomsquenzierung auch für die Etablierung neuer sequenzbasierter Markertechnologien sowie für umfassende Transkriptom-Analysen. Hauptziel dieses Vorhabens ist es, mit Hilfe von Ultradeep-Sequenzierungstechniken eine Plattform zur Integration von genetischen und physikalischen Karten mit umfangreichen Genexpressionsdaten in Raps (Brassica napus) zu etablieren. Mit der Massensequenzierung von AFLP-Marker-Fragmenten soll zum ersten Mal eine dichte SNP-Karte für Raps erstellt werden, die über Sequenzannotation an die physikalischen Brassica und Arabidopsis-Karten angeknüpft werden kann. Durch eine umfassende Studie der Genexpression mittels ultratiefem Expressionsprofiling wird parallel zur genetischen Kartierung auch eine Expressionskarte der Samenentwicklung erstellt, die über Sequenzverknüpfung via Arabidopsis an die B. napus-SNP-Karte gekoppelt wird. Dabei soll eine umfangreiche Datenbankressource geschaffen werden, mit der die effiziente Identifizierung von wirtschaftlich bedeutenden Genen für wichtige Sameninhaltsstoffe ermöglicht wird. Durch das ultratiefe Expressionsprofiling mittels quantitativer Illumina-GA EST-Tag-Sequenzierung soll auch differentielle Expression von entscheidenden Transkriptionsfaktoren erfasst werden, die bei Microarray-Analysen wegen deren niedrigen Expressionsniveau oft übersehen werden. Für die Integration der Daten aus den SNP- und Expressions-Karten mit vorhandenen physikalischen Karten soll eine bioinformatische Plattform auf der Basis einer relationalen Datenbank entwickelt werden. Das große Set von AFLP-SNP-Markern sowie umfangreiche EST-SNPs, die wir während der ultratiefen Expressionsanalyse detektieren, werden einer internationalen Initiative zur Erstellung eines öffentlich verfügbaren B. napus SNP-Arrays zur Verfügung gestellt. Somit wird das Vorhaben einen bedeutenden Beitrag zur internationalen Brassica-Forschung leisten.