Serial analysis of gene expression (SAGE) bei Raps: Quantitative, differentielle Expressionsanalyse im sich entwickelnden Rapssamen zur Erzeugung von Transkriptionsmarkern für die Samenentwicklung

油菜籽基因表达 (SAGE) 的系列分析：油菜籽发育过程中的定量差异表达分析，以产生用于种子发育的转录标记

• 批准号: 5446801
• 负责人: Professor Dr. Rod Snowdon
• 金额: --
• 依托单位: Lehrstuhl für Pflanzenzüchtung
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2004-12-31 至 2007-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5446801?language=en
• 关键词: Serial; analysis; gene; expression; SAGE

Serial analysis of gene expression (SAGE) ist eine Hochdurchsatz- sequenzbasierte Methode für die detaillierte und umfassende Transkriptomanalyse verschiedener Gewebe- und/oder Genotypen. Mittels SAGE ist sowohl die qualitative als auch die quantitative Analyse der exprimierten Gene im jeweiligen Gewebe zu einem definierten Zeitpunkt möglich. Im Gegensatz zu anderen Methoden - wie der Microarray-Technologie - können hierbei auch Gene mit einem sehr niedrigen Expressionsniveau detektiert werden, da mehrere tausend Transkripte analysiert werden. Solche schwach exprimierten Sequenzen können u.a. eine wesentliche Rolle in der Regulation von Transkription und Translation spielen. Ziel dieses Vorhabens ist eine umfassende Studie der Genexpression im Laufe der Samenentwicklung bei Raps, um solche Gene zu identifizieren, deren Über- bzw. Unterexpression zu bestimmten Zeitpunkten der Samenentwicklung mit Änderungen von wertbestimmenden Sameninhaltsstoffen assoziert sind. Die Erstellung von SAGE-Bibliotheken für Raps wird zum ersten Mal ein detailliertes zeitliches Profil des Rapssamen-Transkriptoms liefern und ebenfalls erstmalig eine für die genetische Analyse von Kulturpflanzen in Deutschland bisher nicht verwendete Technik etablieren. Durch die Identifizierung und Quantifizierung von Genen, die an der Rapssamenentwicklung beteiligt sind, können grundlegende Kenntnisse über das Genrepertoir im sich entwickelnden Rapssamen gewonnen und ein einzigartiger Vergleich mit vorhandenen Informationen zum Samen-Transkriptom des engverwandten Modell-Kreuzblütler Arabidopsis thaliana ermöglicht werden. Nicht zuletzt erwarten wir neue Hinweise bzw. Informationen über die hinter der Gentranskription steckenden Kontrollmechanismen, die in Zukunft eine neue Generation von Tranksriptionsmarkern ermöglichen könnten.

基因表达系列分析（SAGE）是一种基于高通量测序的方法，用于详细和快速的跨膜分析和基因分型。SAGE是一种定性和定量的分析表达基因的方法。在基因芯片技术的基础上，我们也可以用一种非常简单的表达方式检测基因，并进行跨膜分析。Solche schwach explainerten Sequenzen können u.a.一个西方人在规范翻译中的角色。这些前体是一项关于说唱音乐中的基因表达的重要研究，它可以识别出不同的基因。Unterexpression zu bestimmten Zeitpunkten der Samenentwicklung mit Änderungen von wertbestimmenden Sameninhaltsstoffen assoziert sind. SAGE-Bibliotheken für Raps的建立将首先详细介绍Rapssamen-transkriptenliefern的时代概况，并在德国进行一项关于Kulturpflanzen的遗传学分析，但这并不意味着技术的建立。通过对基因组的识别和定量，以及对Rapssamenentwicklung beteiligt sind的研究，我们可以将Kenntnisse的基本概念理解为Rapssamen Genrepertoir，并通过对工程模型-Kreuzblütler Arabidopsis thaliana ermöglicht韦尔登的Samen-transskriptom的信息处理来进行一个简单的验证。我们不需要新的信息。信息在Gentranskriptionsteckenden控制机制的后面，在Zukunft eine neue Generation von Transkriptionsmarkern ermöglichen könnten。