Entwicklung und Erprobung von Methoden zur Meta-Analyse phylogenetischer Studien bei Nutztieren
Entwicklung und Erprobung von Methoden zur Meta-Analyse phylogenetischer Studien bei Nutztieren
批准号:
14844133
负责人:
Dr. Helge Täubert
金额:
$0.0万
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Fellowships
财政年份:
2005
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2004-12-31 至 2007-12-31
中文摘要
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英文摘要
Phylogenetische Studien werden zur Darstellung genetischer Distanzen zwischen Rassen bei ver-schiedenen Nutztierarten betrieben. Die zunehmenden Bemühungen übergeordneter Organisationen zur Entwicklung einheitlicher Markersets bei genetischen Differenzierungen ermöglichen durch eine zunehmende Überlappung der eingesetzten Methoden eine Vergleichbarkeit von unterschiedlichen Studien. Ziel dieses Forschungsvorhabens ist die Entwicklung von statistischen Methoden zur Meta-Analyse phylogenetischer Studien. Im Gegensatz zu bestehenden Ansätzen sollen hier die Informati-onen aufgrund der molekulargenetischen Ergebnisse kombiniert werden, um Rassen von verschiede-nen Studien miteinander ins Verhältnis zu setzen. Ein Algorithmus soll entwickelt werden, um zwei oder mehrere Studien mit Markeranalysen zu kombinieren. Ein Ansatz zur Lösung ist die Expectation-Maximization (EM)-Methode, fehlende Informationen aus mangelnden Überlappungen zu ergänzen. Es soll zur Entwicklung und Überprüfung des Verfahrens ein Simulationsprogramm entwickelt werden. Neben den theoretischen Ansätzen stehen aber auch verschiedene Datensätze von Rinderpopulatio-nen zur Verfügung, um die erarbeiteten Methoden zu testen. Das Vorhaben soll hauptsächlich am Trinity College, Dublin, Irland durchgeführt werden. Forschungsaufenthalte am International Livestock Research Institute in Kenia sollen afrikanische und europäische Studien miteinander verbinden.
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会议论文
combi.pl: a computer program to combine data sets with inconsistent microsatellite marker allele size information
Combi PL:一种计算机程序,用于将数据集与不一致的微卫星标记等位基因大小信息组合起来
DOI:
10.1111/j.1471-8286.2007.02011.x
发表时间:
2007
期刊:
Molecular Ecology Resources
影响因子:
7.7
作者:
[H. Täubert, D.G. Bradley]
通讯作者:
D.G. Bradley
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