Strukturelle Charakterisierung der human accelerated region 1 RNA vonMensch und Schimpansen
Strukturelle Charakterisierung der human accelerated region 1 RNA vonMensch und Schimpansen
批准号:
151328194
负责人:
Professor Dr. Harald Schwalbe
金额:
$0.0万
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Grants
财政年份:
2009
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2008-12-31 至 2012-12-31
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英文摘要
Die human accelerated region 1 des Menschen (hHAR1F) besitzt mit 18 Mutationen auf 118nt zur homologen Schimpansensequenz (cHAR1F) den größten genetischen Drift aller 49 bisher identifizierten HARs. 96% aller HARs liegen in nicht-codierenden Abschnitten der mRNA. Um die bisher unbekannte Funktion dieser RNAs in der Entwicklung des menschlichen Bewusstseins zu verstehen, ist die Aufklärung der Sekundär- und Tertiärstruktur der HAR RNA mit atomarer Auflösung unerlässlich. Hierzu wird für cHAR1F ein 69mer und für hHAR1F ein 104mer als Subdomäne der Volllängenkonstrukte charakterisiert. Auf der Basis von NMR-spektroskopischen Untersuchungen dieser RNAs (Resonanzzuordnung, Messung von RDC-Daten, 13C-Relaxation und Relaxationsdispersion) sollen Modelle für die Tertiärstrukturen und deren Dynamiken ermittelt werden. Einzelne Mutationen der cHAR1F-Sequenz hin zur humanen Sequenz sollen Aufschluss geben, welche von den 18 Substitutionen den Konformationswechsel zur hHAR1F-RNA auslösen. Die Synthese der RNA-Konstrukte und deren Mutageneseuntersuchungen werden biochemisch durchgeführt. Die Kenntnis der Funktionen der cHAR1F und hHAR1F-RNA könnte Aufschluss über die Großhirnrindenentwicklung des Menschen im Unterschied zu der des Schimpansen liefern und einen Beitrag leisten zu verstehen, welche Eigenschaften kennzeichnend für die Spezies Mensch sind.
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会议论文
NMR Studies of HAR1 RNA Secondary Structures Reveal Conformational Dynamics in the Human RNA
HAR1 RNA 二级结构的 NMR 研究揭示了人类 RNA 的构象动力学
DOI:
10.1002/cbic.201200401
发表时间:
1974
期刊:
ChemBioChem
影响因子:
3.2
作者:
[Ziegeler, Richter, Schwalbe]
通讯作者:
Schwalbe
Structure, dynamics and kinetics of folding of G-quadruplex nucleic acids
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批准号:392117191
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2017
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负责人:Professor Dr. Harald Schwalbe
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依托单位:
Effects of glycosylation on protein structure, function and dynamics
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批准号:347211955
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项目类别:Research Units
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2017
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负责人:Professor Dr. Harald Schwalbe
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依托单位:
Dynamic basis of the molecular mechanism of nucleotide secondary messengers-sensing riboswitches by NMR spectroscopy
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批准号:314774469
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项目类别:Priority Programmes
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2016
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负责人:Professor Dr. Harald Schwalbe
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依托单位:
Elucidation of the mechanism of aggregation of disease-associated single point mutants of the murine prion protein on the basis of time-resolved 2D NMR spectroscopy in combination with complementary kinetic methods
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批准号:169270524
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2010
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负责人:Professor Dr. Harald Schwalbe
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依托单位:
NMR Investigation of the Regulation of Gene Expression by RNA Thermometers
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批准号:40116492
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项目类别:Priority Programmes
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2007
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负责人:Professor Dr. Harald Schwalbe
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依托单位:
Improvement of the NMR structural quality for RNA and DNA
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批准号:537258662
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:--
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负责人:Professor Dr. Harald Schwalbe
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依托单位:
Nanoseond Ultra-Rapid Freeze Quenching for Time-resolved Structural Biology
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批准号:451906961
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项目类别:New Instrumentation for Research
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资助金额:$0.0万
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财政年份:--
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负责人:Professor Dr. Harald Schwalbe
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依托单位:
SARS-CoV-2-RNA: Understanding the RNA architecture of SARS-CoV-2
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批准号:495006306
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:--
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负责人:Professor Dr. Harald Schwalbe
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依托单位:
NMR and biophysical characterization of structure and dynamics of µ-proteins and their complexes.
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批准号:379644268
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项目类别:Priority Programmes
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资助金额:$0.0万
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财政年份:--
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负责人:Professor Dr. Harald Schwalbe
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依托单位:
Effects of glycosylation on protein structure, function and dynamics
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批准号:445098147
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项目类别:Research Units
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资助金额:$0.0万
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财政年份:--
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负责人:Professor Dr. Harald Schwalbe
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依托单位:
海外基金