Identifizierung und Charakterisierung HERV-LTR-initiierter regulatorischer RNA und ihre Bedeutung für die Karzinogenese

HERV-LTR 启动的调控 RNA 的鉴定和表征及其对致癌作用的重要性

基本信息

项目摘要

Das menschliche Erbgut enthält mehr als 500.000 genetisch mobile Elemente mit Promotorfunktion, die als „long terminal repeats“ (LTRs) humaner endogener Retroviren (HERV) klassifiziert werden. Mittels der in ihnen enthaltenen regulatorischen Steuersignale initiieren sie schätzungsweise zehnmal mehr Transkripte als alle ~30.000 zellulären Gene zusammen. Das dabei transkribierte Volumen ist äquivalent zu ungefähr 20% der Gesamt-DNA. Die biologische Funktion der meist nichtkodierenden Transkripte (ncRNA) ist noch weitgehend unerforscht. Wir wollen untersuchen, ob HERV-LTRs regulatorische RNA initiieren und so die Genexpression in normalen Zellen und in Tumoren beeinflussen. Dazu haben wir in Vorarbeiten gewebe- und tumorspezifisch aktive LTR-Familien mittels unserer RetroArray-Technologie identifiziert. Wir beabsichtigen, die identifizierten LTR-Familien durch Einsatz synthetischer siRNA in Tumorzelllinien gezielt abzuregulieren (Silencing) und die Auswirkung auf das zelluläre Transkriptom mittels Genexpressionsanalyse zu analysieren. Der systematische Ansatz, die Funktion genomweit verteilter LTRs als Initiatoren regulatorischer RNAs zu bestimmen, lässt neue Erkenntnisse über die biologische Funktion von HERV für gesunde und maligne Zellen, mittelfristig auch neue therapeutische Ansätze, erwarten.
Das menschliche Erbgut enthält mehr als 50万基因移动元件启动功能,die als“长末端重复序列”(LTRs)人内源性逆转录病毒(HERV)分类。mitels在enenaltenen调控中发现了Steuersignale initialeserschätzungsweise zehnmal mehr转录因子也发现了~ 30,000 zellulären基因zusammen。Das dabei transkribierte Volumen ist äquivalent zu ungefähr 20% der Gesamt-DNA。【生物学】ncRNA的功能与基因转录(ncRNA)有关。在这种情况下,HERV-LTRs调控的RNA在正常细胞和肿瘤细胞中启动和表达。利用逆转录阵列技术鉴定了大足在肿瘤和肿瘤特异性之间的活性ltr -家族基因。通过对基因的分析,我们鉴定了LTR-Familien durch Einsatz合成的siRNA在tumorzelllinen gezielt abzuregulen (Silencing)和die Auswirkung aufdas中的表达。Der systematische Ansatz, die funksche genome weit verilter LTRs als Initiatoren regulatorischer RNAs zu beestimmen, lässt neue erkenntnise <e:1>, die biologische funksche von HERV f<s:1> r gesunde and恶性肿瘤Zellen, mittelfristig auche neue therapeutische Ansätze, erwarten。

项目成果

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