Analyse der genetischen Steuerung des Wasserbindungsvermögens durch Bestimmung Merkmals-assoziierter und QTL-Genotyp-assoziierter Expression von Kandidatengenen und deren genomischer Basis
通过确定候选基因的性状相关和 QTL 基因型相关表达及其基因组基础来分析水结合能力的遗传控制
基本信息
- 批准号:23365950
- 负责人:
- 金额:--
- 依托单位:
- 依托单位国家:德国
- 项目类别:Research Units
- 财政年份:2006
- 资助国家:德国
- 起止时间:2005-12-31 至 2008-12-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
Für die Fleischqualität ist das Wasserbindungsvermögen (WBV) von großer Bedeutung. Das Projekt zielt auf die Analyse des funktionellen Netzwerkes von Genen zur Steuerung des WBV beim Schwein. Für das Projekt werden kommerziell erhältliche, genomweite Mikroarrays genutzt. Als Targets werden mRNAs von Schweinen, differenziert nach Tropfsaftverlust und Genotypen an zwei QTL-Regionen, die in einem Genomscan der DUPI Ressourcen- Population zuvor auf Sscr5 bzw. Sscr18 identifiziert wurden, verwendet. Merkmals- und QTL-Genotyp-assoziiert exprimierte Kandidatengene werden identifiziert und anschließend untersucht, inwiefern cis- und trans-Genregulation für die Merkmalsausprägung relevant ist. Dazu werden mittels eQTL-Analyse Genomregionen identifiziert, in denen Gene lokalisiert sind, die signifikante Effekte auf das Transkriptionsrate/Expressionsmuster von nach den Array-Analysen ausgewählten Loci ausüben. Kandidatengene, für die die eQTL-Analyse auf cis-wirkende regulatorische DNA Variation hinweist, werden in ihren regulativen Abschnitten charakterisiert, nach SNPs durchforstet und zur Kopplungs- und Assoziationsanalyse genotypisiert.
Für die Fleischqualitätät is das Wasserbindungsvermögen(WBV)von groüer Bedeutung(WBV)von groüer Bedeutung(WBV)。这是一项新的工程,它分析了世界上最大的财富和财富。Für das Projekt是kommerziell erhältliche,Genomweite Mikroararns genutzt。ALS的靶点是von Schweinen、不同的TropfSaftverlust和基因型别和zwei QTL-Regionen,死于Einem基因组扫描和Dupi资源库或auf Sscr5 BZW。Sscr18鉴定Wurden,verwendet。Merkmals-und QTL-Genotyp-assoziiert exPrimierte Kandidatengene is den Genfiziert and anschlieüend untersuht,inwiefern cis-and tran-genReguling für die MerkMalsausprägung相关。大足是一种QTL-分析基因的区域鉴定方法,在基因定位的基础上,有意义的是基因的转移率/表达频率-基因序列分析。对顺式DNA调控者的DNA变异进行了EQTL分析,并对其进行了基因分型分析。
项目成果
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